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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 32 / 164 下载 TSV

上一页 32 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001323 Chr02 NC_080388.1:24573071-24573085promoter 内 3209-3223 bp - 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 24573863-24575193(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
SmilChr01G001661 Chr01 NC_080387.1:30695031-30695045promoter 内 3172-3186 bp - 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 30688649-30694216(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTCTAGGTAGGTAGG
SmilChr01G001686 Chr01 NC_080387.1:31090443-31090457promoter 内 3113-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31086192-31089569(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTGCGGGTAGGTGGA
SmilChr02G004675 Chr02 NC_080388.1:69104903-69104917promoter 内 3041-3055 bp + 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 69103412-69103957(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCAAATT
SmilChr07G003125 Chr07 NC_080393.1:33161386-33161400promoter 内 3030-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 33162357-33163490(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGGCGGGTAGGTGGA
SmilChr07G002484 Chr07 NC_080393.1:23492516-23492530promoter 内 3027-3041 bp + 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 23493490-23498038(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGAGAGTAGGTGGG
SmilChr05G004224 Chr05 NC_080391.1:56081097-56081111promoter 内 2902-2916 bp - 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 56078659-56080012(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTTAGGTAGGTAGA
SmilChr02G002382 Chr02 NC_080388.1:41727308-41727322promoter 内 2877-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41720892-41726198(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25923448-25923462promoter 内 2729-2743 bp + 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAATGGTAGGTAGG
SmilChr01G001453 Chr01 NC_080387.1:28213499-28213513promoter 内 2583-2597 bp - 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 28212024-28212095(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGAAAGGTAGGTGTG
SmilChr08G001184 Chr08 NC_080394.1:9491227-9491241promoter 内 2427-2441 bp + 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 9486601-9489667(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCCCCAT
SmilChr02G001676 Chr02 NC_080388.1:31001030-31001044promoter 内 2366-2380 bp + 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31002665-31011168(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGGAAGTAGGTGGA
SmilChr01G001452 Chr01 NC_080387.1:28213499-28213513promoter 内 2213-2227 bp - 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 28209347-28211725(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGAAAGGTAGGTGTG
SmilChr07G004557 Chr07 NC_080393.1:58305851-58305865promoter 内 2057-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 58300178-58303921(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
SmilChr06G003229 Chr06 NC_080392.1:45028646-45028660promoter 内 2040-2054 bp + 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 45024344-45026699(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCAGCGG
SmilChr08G000681 Chr08 NC_080394.1:5066369-5066383promoter 内 1917-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 5061652-5064299(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCGCCG
SmilChr04G003710 Chr04 NC_080390.1:53423139-53423153promoter 内 1879-1893 bp + 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 53419778-53421031(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCTGAAT
SmilChr03G001670 Chr03 NC_080389.1:21757196-21757210promoter 内 1854-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 21751607-21755063(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCAAACA
SmilChr05G002550 Chr05 NC_080391.1:28562778-28562792promoter 内 1824-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 28556036-28560615(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCAGATG
SmilChr08G000682 Chr08 NC_080394.1:5066369-5066383promoter 内 1638-1652 bp + 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 5068732-5073559(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGGCGGGTAGGTGGA
SmilChr07G004107 Chr07 NC_080393.1:52707331-52707345promoter 内 1550-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 52699102-52704894(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
SmilChr03G000173 Chr03 NC_080389.1:1897497-1897511promoter 内 1542-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1899956-1900505(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTATCC
SmilChr07G004338 Chr07 NC_080393.1:55936281-55936295promoter 内 1473-1487 bp + 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 55938809-55944954(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAAATGGTAGGTAAG
SmilChr02G002358 Chr02 NC_080388.1:41362874-41362888promoter 内 1393-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41365482-41368906(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCATTGGTAGGTAGG
SmilChr08G002142 Chr08 NC_080394.1:19282818-19282832promoter 内 1336-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 19285483-19288502(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
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SmilChr08G002103 Chr08 NC_080394.1:18884812-18884826promoter 内 1202-1216 bp + 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 18887611-18891084(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGTTGGTTGGTAGA
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SmilChr02G001674 Chr02 NC_080388.1:31001030-31001044promoter 内 1102-1116 bp + 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 30995524-30998145(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTCCCA
SmilChr08G001225 Chr08 NC_080394.1:9896581-9896595promoter 内 1051-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 9892300-9893645(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
SmilChr07G003101 Chr07 NC_080393.1:32838279-32838293promoter 内 944-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 32841336-32843269(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCGTGGTAGGTGGC
SmilChr02G004676 Chr02 NC_080388.1:69104903-69104917promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 69108012-69110559(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATTTGGTAGGTTGG
SmilChr07G001646 Chr07 NC_080393.1:13894970-13894984promoter 内 882-896 bp - 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 13888589-13891865(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCGTGGTAGGTGGC
SmilChr07G004628 Chr07 NC_080393.1:59130295-59130309promoter 内 863-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 59121469-59127171(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCCGCCG
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SmilChr01G002120 Chr01 NC_080387.1:37217288-37217302promoter 内 572-586 bp + 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 37220717-37221475(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGGGGTAGGTGGC
SmilChr07G002483 Chr07 NC_080393.1:23492516-23492530promoter 内 541-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 23483584-23489070(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTCTCTC
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SmilChr03G001671 Chr03 NC_080389.1:21757196-21757210promoter 内 423-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 21760774-21764204(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTTGGTAGGTTGG
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SmilChr03G001707 Chr03 NC_080389.1:22664713-22664727promoter 内 317-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 22668397-22671563(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTTGGTAGGTTGG
SmilChr01G001692 Chr01 NC_080387.1:31147688-31147702promoter 内 279-293 bp - 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31142274-31143980(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACTAGGTAGGTAGG
SmilChr05G001451 Chr05 NC_080391.1:13261216-13261230promoter 内 258-272 bp - 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 13252643-13257487(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGAGTGGTAGGTAAA
SmilChr03G002795 Chr03 NC_080389.1:44438913-44438927promoter 内 250-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 44434064-44435176(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGTCGGTAGGTGGA
SmilChr02G002392 Chr02 NC_080388.1:41836669-41836683promoter 内 153-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41831477-41832835(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCACGGC
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SmilChr04G002470 Chr04 NC_080390.1:39519378-39519392promoter 内 75-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 39508606-39515466(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGTACCTACCAACAC
SmilChr07G003129 Chr07 NC_080393.1:33202138-33202152promoter 内 3499-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 4 33202640-33208096(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCGTTAGTAGGTGGG