转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 34 / 134 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003742 Chr01 NC_080387.1:55731190-55731204promoter 内 1800-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55722434-55729003(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTAATCATTAA
SmilChr02G002327 Chr02 NC_080388.1:40951204-40951218promoter 内 1725-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 40953480-40954485(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATCGGT
SmilChr03G002661 Chr03 NC_080389.1:42271968-42271982promoter 内 1516-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42265706-42269497(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATCGTA
SmilChr02G001862 Chr02 NC_080388.1:33857352-33857366promoter 内 1500-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 33859853-33861067(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGATAATGATTGG
SmilChr03G002249 Chr03 NC_080389.1:35419178-35419192promoter 内 1401-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 35421778-35425099(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGGTAATGATAAC
SmilChr01G000583 Chr01 NC_080387.1:12594900-12594914promoter 内 1049-1063 bp + 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 12597852-12601439(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTACTAATGATGAT
SmilChr02G003626 Chr02 NC_080388.1:57590543-57590557promoter 内 902-916 bp + 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57593642-57595039(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTAATAATGATGAT
SmilChr02G002448 Chr02 NC_080388.1:42712407-42712421promoter 内 745-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42700209-42709165(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTACTTAA
SmilChr03G003165 Chr03 NC_080389.1:49017253-49017267promoter 内 109-123 bp - 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 49021145-49022470(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATATGT
SmilChr01G003743 Chr01 NC_080387.1:55731190-55731204promoter 内 69-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55735122-55758638(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATGATTACTTTA
SmilChr03G002533 Chr03 NC_080389.1:40393235-40393249promoter 内 3918-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40387035-40393166(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGGATGATGATTAC
SmilChr03G000709 Chr03 NC_080389.1:7885773-7885787promoter 内 3818-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7878409-7885604(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGTTTG
SmilChr01G000805 Chr01 NC_080387.1:17424545-17424559promoter 内 3804-3818 bp - 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 17424742-17427727(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAA
SmilChr01G000254 Chr01 NC_080387.1:4819662-4819676promoter 内 3713-3727 bp - 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4819950-4827593(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAA
SmilChr01G004029 Chr01 NC_080387.1:58704241-58704255promoter 内 3671-3685 bp + 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58701536-58703925(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATAATG
SmilChr01G003170 Chr01 NC_080387.1:50504243-50504257promoter 内 3638-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50497360-50503894(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAAGTAATAATGAC
SmilChr03G003188 Chr03 NC_080389.1:49342291-49342305promoter 内 3581-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49340636-49341885(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTATATAATGATGAT
SmilChr02G004098 Chr02 NC_080388.1:63295118-63295132promoter 内 3543-3557 bp + 444 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63295576-63297600(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTAATAATGATGAT
SmilChr01G004636 Chr01 NC_080387.1:64378733-64378747promoter 内 3487-3501 bp - 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64379247-64380035(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTATCTCT
SmilChr01G004834 Chr01 NC_080387.1:66472728-66472742promoter 内 3456-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 66466249-66472197(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCGCATTA
SmilChr03G000361 Chr03 NC_080389.1:4042274-4042288promoter 内 3202-3216 bp + 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4040456-4041489(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAA
SmilChr02G000149 Chr02 NC_080388.1:1984834-1984848promoter 内 3138-3152 bp + 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1982500-1983985(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATCTTA
SmilChr03G001506 Chr03 NC_080389.1:18415935-18415949promoter 内 3073-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18410005-18415021(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATCGAAATGATTAC
SmilChr02G003316 Chr02 NC_080388.1:54412793-54412807promoter 内 2920-2934 bp - 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54408101-54411726(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCGATAATGATTGC
SmilChr02G000073 Chr02 NC_080388.1:919437-919451promoter 内 2829-2843 bp - 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 920609-921277(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATCTTA
SmilChr02G003678 Chr02 NC_080388.1:58158097-58158111promoter 内 2812-2826 bp - 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58147251-58156922(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAGATGATGATTAT
SmilChr01G003614 Chr01 NC_080387.1:54680512-54680526promoter 内 2733-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54681780-54685540(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTATG
SmilChr02G000956 Chr02 NC_080388.1:16603874-16603888promoter 内 2631-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16605244-16608137(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATGATA
SmilChr01G001683 Chr01 NC_080387.1:31043837-31043851promoter 内 2561-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 31038720-31042411(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTATCACC
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50579040-50579054promoter 内 2501-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTATG
SmilChr03G002662 Chr03 NC_080389.1:42279090-42279104promoter 内 2342-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42280749-42283805(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATCATAATGATGAA
SmilChr01G005170 Chr01 NC_080387.1:69466595-69466609promoter 内 2244-2258 bp + 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 69468352-69471209(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAGAATAATGATTGC
SmilChr02G002328 Chr02 NC_080388.1:40965417-40965431promoter 内 2157-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40967261-40967923(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATCTTA
SmilChr02G000337 Chr02 NC_080388.1:4307737-4307751promoter 内 1963-1977 bp - 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4304631-4305713(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGATAATGATTGG
SmilChr03G002667 Chr03 NC_080389.1:42370310-42370324promoter 内 1760-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42363952-42368083(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGGGATAATGATGAT
SmilChr03G000433 Chr03 NC_080389.1:4684691-4684705promoter 内 1668-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4687024-4693070(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATATAA
SmilChr02G002476 Chr02 NC_080388.1:43135167-43135181promoter 内 1624-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 43122815-43132804(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAGAATAATGATTAG
SmilChr02G004301 Chr02 NC_080388.1:65380352-65380366promoter 内 1604-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65382749-65386575(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTATAATGATGAT
SmilChr03G000155 Chr03 NC_080389.1:1711379-1711393promoter 内 1448-1462 bp + 2539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1695496-1708840(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCTTCC
SmilChr02G003612 Chr02 NC_080388.1:57368591-57368605promoter 内 1418-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57365660-57366022(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTAATAATGATGAT
SmilChr02G001116 Chr02 NC_080388.1:20119901-20119915promoter 内 1387-1401 bp - 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20114751-20117301(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAATGATGATTAT
SmilChr03G002700 Chr03 NC_080389.1:42962838-42962852promoter 内 1236-1250 bp + 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42965603-42969421(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGATAATGATTAT
SmilChr02G003611 Chr02 NC_080388.1:57368591-57368605promoter 内 953-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57365102-57365557(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTAATAATGATGAT
SmilChr02G003694 Chr02 NC_080388.1:58394954-58394968promoter 内 930-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58398025-58399976(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACATGCGATGATTAC
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SmilChr01G005523 Chr01 NC_080387.1:72108059-72108073promoter 内 757-771 bp - 3230 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72100465-72104829(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGATAATGATTGG
SmilChr03G000710 Chr03 NC_080389.1:7885773-7885787promoter 内 550-564 bp + 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7889224-7889565(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAACTAATGATTAT
SmilChr03G002669 Chr03 NC_080389.1:42370310-42370324promoter 内 518-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42373793-42374845(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCCCA
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