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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 34 / 128 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000379 Chr02 NC_080388.1:4772000-4772011promoter 内 1705-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 4766030-4769715(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTTCA
SmilChr01G004298 Chr01 NC_080387.1:61166399-61166410promoter 内 1615-1626 bp - 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 61168785-61172798(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTCG
SmilChr01G005792 Chr01 NC_080387.1:74013885-74013896promoter 内 1203-1214 bp - 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 74016683-74025384(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTTG
SmilChr02G001479 Chr02 NC_080388.1:27666110-27666121promoter 内 1071-1082 bp - 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 27659998-27663191(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACA
SmilChr02G003494 Chr02 NC_080388.1:56171711-56171722promoter 内 906-917 bp - 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 56166008-56168627(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr03G001183 Chr03 NC_080389.1:13594124-13594135promoter 内 777-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 13588546-13590911(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTT
SmilChr01G003760 Chr01 NC_080387.1:55990398-55990409promoter 内 730-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 55984024-55987138(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTT
SmilChr02G003626 Chr02 NC_080388.1:57590356-57590367promoter 内 715-726 bp + 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 57593642-57595039(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr01G000849 Chr01 NC_080387.1:18340611-18340622promoter 内 607-618 bp - 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 18344005-18344110(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCT
SmilChr02G000070 Chr02 NC_080388.1:888115-888126promoter 内 569-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 891547-894899(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTT
SmilChr01G003306 Chr01 NC_080387.1:51741363-51741374promoter 内 402-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 51744962-51753039(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTCG
SmilChr01G004036 Chr01 NC_080387.1:58773750-58773761promoter 内 397-408 bp + 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 58777354-58779040(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGTG
SmilChr01G005090 Chr01 NC_080387.1:68761814-68761825promoter 内 350-361 bp - 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 68765465-68766556(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTT
SmilChr02G002937 Chr02 NC_080388.1:49875735-49875746promoter 内 346-357 bp - 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 49879390-49884337(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTTG
SmilChr01G004371 Chr01 NC_080387.1:61927142-61927153promoter 内 179-190 bp - 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 61922627-61923331(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr02G001736 Chr02 NC_080388.1:31933792-31933803promoter 内 144-155 bp - 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 31937649-31939943(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTC
SmilChr03G000224 Chr03 NC_080389.1:2625757-2625768promoter 内 3971-3982 bp - 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2625787-2628468(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTCC
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SmilChr01G001130 Chr01 NC_080387.1:22980104-22980115promoter 内 3346-3357 bp - 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 22978984-22979460(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAGCAGAGCA
SmilChr02G000072 Chr02 NC_080388.1:906207-906218promoter 内 3247-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 904943-905464(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCC
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SmilChr01G002624 Chr01 NC_080387.1:44512351-44512362promoter 内 2784-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 44508084-44511145(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACA
SmilChr02G000197 Chr02 NC_080388.1:2493009-2493020promoter 内 2749-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2490229-2491768(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr02G001446 Chr02 NC_080388.1:27133254-27133265promoter 内 2728-2739 bp - 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 27128730-27131992(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGCT
SmilChr02G003011 Chr02 NC_080388.1:50761962-50761973promoter 内 2650-2661 bp - 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 50759571-50760622(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr01G005486 Chr01 NC_080387.1:71817515-71817526promoter 内 2061-2072 bp - 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 71814847-71815586(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGAA
SmilChr02G001472 Chr02 NC_080388.1:27463786-27463797promoter 内 2055-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 27465732-27468531(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTA
SmilChr01G003973 Chr01 NC_080387.1:58168681-58168692promoter 内 2024-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 58164188-58166715(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr03G001072 Chr03 NC_080389.1:12425346-12425357promoter 内 2023-2034 bp + 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 12427324-12430901(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAGCAGAGCA
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SmilChr01G005248 Chr01 NC_080387.1:70009447-70009458promoter 内 1893-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 70011555-70016026(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTC
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SmilChr01G005439 Chr01 NC_080387.1:71512605-71512616promoter 内 1794-1805 bp + 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 71514812-71518585(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAGAACAGAGCA
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SmilChr01G001710 Chr01 NC_080387.1:31572703-31572714promoter 内 1572-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 31575132-31576792(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAGCAGAGCA
SmilChr01G002148 Chr01 NC_080387.1:37472003-37472014promoter 内 1518-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 37474486-37476248(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTT
SmilChr02G003726 Chr02 NC_080388.1:58893784-58893795promoter 内 1478-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 58886403-58891272(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
SmilChr01G001912 Chr01 NC_080387.1:34264376-34264387promoter 内 1463-1474 bp + 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 34266914-34268749(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAA
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SmilChr03G000828 Chr03 NC_080389.1:9509617-9509628promoter 内 910-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 9481327-9506537(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCT
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SmilChr01G005586 Chr01 NC_080387.1:72548223-72548234promoter 内 812-823 bp - 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 72551412-72553133(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTCG