转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 36 / 149 下载 TSV

上一页 36 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000929 Chr03 NC_080389.1:10617132-10617142promoter 内 3302-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10617831-10619331(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr01G003886 Chr01 NC_080387.1:57174584-57174594promoter 内 3196-3206 bp + 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57175389-57181511(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr03G000829 Chr03 NC_080389.1:9515260-9515270promoter 内 3161-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 9509952-9514430(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr05G003413 Chr05 NC_080391.1:45327925-45327935promoter 内 3058-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45322544-45326992(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G000441 Chr02 NC_080388.1:5750186-5750196promoter 内 2900-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 5751287-5752318(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr02G001184 Chr02 NC_080388.1:21758434-21758444promoter 内 2895-2905 bp - 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 21756307-21757338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr02G001185 Chr02 NC_080388.1:21763850-21763860promoter 内 2895-2905 bp - 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 21761723-21762754(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr01G002624 Chr01 NC_080387.1:44512291-44512301promoter 内 2845-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 44508084-44511145(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G002417 Chr05 NC_080391.1:26691942-26691952promoter 内 2838-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 26693105-26693223(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr04G003186 Chr04 NC_080390.1:48559190-48559200promoter 内 2548-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 48556848-48557747(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G000425 Chr03 NC_080389.1:4628549-4628559promoter 内 2533-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4630017-4632066(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr07G002397 Chr07 NC_080393.1:22331312-22331322promoter 内 2510-2520 bp + 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 22329484-22329831(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGG
SmilChr02G005518 Chr02 NC_080388.1:75292468-75292478promoter 内 2504-2514 bp - 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 75289006-75290981(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr01G002068 Chr01 NC_080387.1:36524788-36524798promoter 内 2499-2509 bp + 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36526290-36527839(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr03G003844 Chr03 NC_080389.1:57562370-57562380promoter 内 2499-2509 bp + 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57559897-57560878(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G003845 Chr03 NC_080389.1:57569767-57569777promoter 内 2499-2509 bp + 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57567386-57568275(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr01G002090 Chr01 NC_080387.1:36932569-36932579promoter 内 2460-2470 bp - 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36929651-36931038(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr04G001434 Chr04 NC_080390.1:23398137-23398147promoter 内 2419-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 23386135-23396565(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr05G001727 Chr05 NC_080391.1:16620308-16620318promoter 内 2286-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 16622023-16625294(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G004185 Chr03 NC_080389.1:60551776-60551786promoter 内 2212-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 60553565-60555593(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr02G002364 Chr02 NC_080388.1:41421128-41421138promoter 内 2122-2132 bp - 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 41417183-41419259(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr02G000140 Chr02 NC_080388.1:1871606-1871616promoter 内 2117-2127 bp + 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1873490-1874531(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr06G003049 Chr06 NC_080392.1:43391986-43391996promoter 内 1994-2004 bp + 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 43393993-43396188(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr02G005079 Chr02 NC_080388.1:72430258-72430268promoter 内 1972-1982 bp - 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 72421915-72428239(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr05G002517 Chr05 NC_080391.1:27951493-27951503promoter 内 1770-1780 bp + 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 27953724-27955181(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr07G002407 Chr07 NC_080393.1:22420673-22420683promoter 内 1748-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 22422926-22423922(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr05G003747 Chr05 NC_080391.1:50604345-50604355promoter 内 1672-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 50606674-50610378(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G001710 Chr05 NC_080391.1:16351454-16351464promoter 内 1637-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 16353818-16357064(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61968779-61968789promoter 内 1623-1633 bp + 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 61971157-61977289(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr05G002616 Chr05 NC_080391.1:29433991-29434001promoter 内 1575-1585 bp - 2416 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 29428360-29431575(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAA
SmilChr03G001228 Chr03 NC_080389.1:14162937-14162947promoter 内 1512-1522 bp - 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 14165426-14166550(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGG
SmilChr03G000928 Chr03 NC_080389.1:10609877-10609887promoter 内 1507-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10612371-10613598(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G004646 Chr03 NC_080389.1:64022580-64022590promoter 内 1480-1490 bp - 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 64019175-64020069(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr01G004027 Chr01 NC_080387.1:58697995-58698005promoter 内 1313-1323 bp + 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 58694404-58695317(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G002603 Chr02 NC_080388.1:45155424-45155434promoter 内 1294-1304 bp - 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45158131-45159911(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr01G001211 Chr01 NC_080387.1:24340590-24340600promoter 内 1276-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 24343315-24345554(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr01G004008 Chr01 NC_080387.1:58463127-58463137promoter 内 1259-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 58453702-58460395(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr06G000717 Chr06 NC_080392.1:6526675-6526685promoter 内 1144-1154 bp - 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 6529532-6533084(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G004554 Chr02 NC_080388.1:68061676-68061686promoter 内 1044-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 68055111-68058729(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr05G000374 Chr05 NC_080391.1:2808498-2808508promoter 内 1042-1052 bp - 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2802627-2805549(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr02G004743 Chr02 NC_080388.1:69650987-69650997promoter 内 996-1006 bp - 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 69644540-69647992(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCG
SmilChr07G000674 Chr07 NC_080393.1:4594469-4594479promoter 内 969-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4597501-4598256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr04G002924 Chr04 NC_080390.1:45511430-45511440promoter 内 831-841 bp + 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45506385-45508270(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69650987-69650997promoter 内 783-793 bp - 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 69654205-69656876(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGG
SmilChr04G002388 Chr04 NC_080390.1:38401760-38401770promoter 内 740-750 bp - 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 38405021-38406730(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G002555 Chr02 NC_080388.1:44466405-44466415promoter 内 724-734 bp + 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 44461832-44463138(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr03G000930 Chr03 NC_080389.1:10617132-10617142promoter 内 612-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10620521-10654750(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr02G000674 Chr02 NC_080388.1:10435413-10435423promoter 内 571-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10438843-10440022(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGGGCTGTCA
SmilChr02G002703 Chr02 NC_080388.1:46871020-46871030promoter 内 566-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 46865206-46867595(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGA
SmilChr04G000163 Chr04 NC_080390.1:1471905-1471915promoter 内 564-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1463504-1468478(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGG