转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 39 / 148 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001807 Chr04 NC_080390.1:29560151-29560164promoter 内 2486-2499 bp - 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 29555573-29558649(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGGAGCACGTGG
SmilChr03G004527 Chr03 NC_080389.1:63313229-63313242promoter 内 2411-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63314819-63318265(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGGTCA
SmilChr05G002038 Chr05 NC_080391.1:21207157-21207170promoter 内 2300-2313 bp - 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 21200022-21205469(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGAGACACGTGG
SmilChr04G000171 Chr04 NC_080390.1:1531432-1531445promoter 内 2027-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1533406-1536174(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATGCC
SmilChr01G000148 Chr01 NC_080387.1:2550960-2550973promoter 内 1810-1823 bp - 2178 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 2548627-2548782(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGCAGACACGTGG
SmilChr05G003234 Chr05 NC_080391.1:41516357-41516370promoter 内 1767-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41512742-41514136(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCTGGTCACGTGC
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11648314-11648327promoter 内 1664-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 11644323-11645990(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCATTACACGTGG
SmilChr02G002573 Chr02 NC_080388.1:44736642-44736655promoter 内 1586-1599 bp + 2402 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 44733032-44734240(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACACTTA
SmilChr01G000147 Chr01 NC_080387.1:2550960-2550973promoter 内 1426-1439 bp - 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 2545090-2548398(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGCAGACACGTGG
SmilChr01G005380 Chr01 NC_080387.1:71027815-71027828promoter 内 1387-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 71030429-71031319(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTCGTCACGTGC
SmilChr02G005494 Chr02 NC_080388.1:75101984-75101997promoter 内 1337-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 75097484-75099333(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCAACA
SmilChr02G000576 Chr02 NC_080388.1:8277746-8277759promoter 内 1310-1323 bp + 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 8280437-8283269(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACAGTCACGTGC
SmilChr03G002040 Chr03 NC_080389.1:30813257-30813270promoter 内 1291-1304 bp - 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 30815967-30837413(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACCACC
SmilChr03G004613 Chr03 NC_080389.1:63852432-63852445promoter 内 1179-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63845222-63849623(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGTTCT
SmilChr03G004612 Chr03 NC_080389.1:63852432-63852445promoter 内 1153-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63839534-63849597(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGTTCT
SmilChr01G004571 Chr01 NC_080387.1:63764889-63764902promoter 内 1088-1101 bp + 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63767802-63779065(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGAGTCACGTGT
SmilChr01G000749 Chr01 NC_080387.1:16566131-16566144promoter 内 1052-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 16569080-16570541(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTGACGCACGTGG
SmilChr08G001365 Chr08 NC_080394.1:10888691-10888704promoter 内 891-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 10891801-10894381(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGACT
SmilChr05G002266 Chr05 NC_080391.1:24360605-24360618promoter 内 744-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 24363862-24366653(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCCCCA
SmilChr02G004936 Chr02 NC_080388.1:71341287-71341300promoter 内 742-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 71335126-71338041(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTCATC
SmilChr03G003510 Chr03 NC_080389.1:53709414-53709427promoter 内 741-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 53712674-53716261(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGCTCG
SmilChr07G002587 Chr07 NC_080393.1:24757311-24757324promoter 内 730-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 24760582-24766378(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGAACC
SmilChr03G004526 Chr03 NC_080389.1:63313229-63313242promoter 内 700-713 bp - 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63307850-63309941(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACCGCCACGTGG
SmilChr04G001848 Chr04 NC_080390.1:30141596-30141609promoter 内 541-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 30138076-30138149(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAATGACACGTGG
SmilChr04G002578 Chr04 NC_080390.1:41146370-41146383promoter 内 299-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41150072-41155792(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTCGGGCACGTGG
SmilChr05G004152 Chr05 NC_080391.1:55449676-55449689promoter 内 251-264 bp + 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 55453426-55456801(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCATTACACGTGG
SmilChr05G002247 Chr05 NC_080391.1:24149655-24149668promoter 内 182-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 24144159-24145849(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGTAGTCACGTGG
SmilChr07G001948 Chr07 NC_080393.1:16886534-16886547promoter 内 181-194 bp - 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 16890354-16890983(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGACCCA
SmilChr01G000149 Chr01 NC_080387.1:2550960-2550973promoter 内 121-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 2554840-2563158(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTGCCG
SmilChr01G000725 Chr01 NC_080387.1:16167695-16167708promoter 内 54-67 bp - 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 16171642-16173010(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATGCC
SmilChr06G000903 Chr06 NC_080392.1:8508366-8508379promoter 内 3901-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 6 8502533-8508279(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGCGTCACGTGA
SmilChr06G000908 Chr06 NC_080392.1:8559683-8559696promoter 内 3901-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 6 8559783-8565456(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGCGTCACGTGA
SmilChr07G001311 Chr07 NC_080393.1:10104521-10104534promoter 内 2143-2156 bp - 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 4 10101917-10102676(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGCCACGTGG
SmilChr01G001896 Chr01 NC_080387.1:34087240-34087253promoter 内 3223-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 34081061-34086475(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAT
SmilChr01G001897 Chr01 NC_080387.1:34087240-34087253promoter 内 2863-2876 bp + 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 34085428-34086115(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAT
SmilChr01G001898 Chr01 NC_080387.1:34088515-34088528promoter 内 2540-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 34089976-34090299(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAT
SmilChr02G004892 Chr02 NC_080388.1:70962183-70962196promoter 内 2422-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 70959676-70960617(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTCCGGTCACGTGG
SmilChr02G001244 Chr02 NC_080388.1:22829998-22830011promoter 内 1536-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 22832463-22836275(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAT
SmilChr02G002564 Chr02 NC_080388.1:44614726-44614739promoter 内 1517-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 44610723-44612255(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAGGTGACGTGG
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SmilChr01G001856 Chr01 NC_080387.1:33515397-33515410promoter 内 1312-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 33511321-33512721(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAT
SmilChr05G002162 Chr05 NC_080391.1:22855240-22855253promoter 内 932-945 bp - 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 22858309-22858744(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCATCA
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SmilChr02G004891 Chr02 NC_080388.1:70962183-70962196promoter 内 418-431 bp - 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 3 70957290-70958613(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTCCGGTCACGTGG
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SmilChr02G001441 Chr02 NC_080388.1:27102349-27102362promoter 内 3782-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 27099113-27102143(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTGTGACACGTGG
SmilChr08G001164 Chr08 NC_080394.1:9300720-9300733promoter 内 3433-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 9299590-9300165(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTAAT
SmilChr07G001635 Chr07 NC_080393.1:13751787-13751800promoter 内 3213-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 13749995-13751012(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTGCC
SmilChr07G001838 Chr07 NC_080393.1:15856848-15856861promoter 内 3106-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 15853236-15855966(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTCGTA