转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 39 / 128 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000994 Chr01 NC_080387.1:20983444-20983455promoter 内 1728-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 20985717-20991575(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTATCT
SmilChr02G000386 Chr02 NC_080388.1:4808810-4808821promoter 内 1355-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 4804307-4806175(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTAT
SmilChr02G000872 Chr02 NC_080388.1:15017628-15017639promoter 内 1333-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 15011322-15014971(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAATA
SmilChr02G002147 Chr02 NC_080388.1:38616147-38616158promoter 内 1309-1320 bp + 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 38611861-38613466(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTT
SmilChr02G005452 Chr02 NC_080388.1:74860753-74860764promoter 内 1308-1319 bp + 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74863446-74865599(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCA
SmilChr01G002742 Chr01 NC_080387.1:45716861-45716872promoter 内 1266-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 45719596-45725020(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTATTT
SmilChr01G000795 Chr01 NC_080387.1:17230781-17230792promoter 内 1196-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 17225327-17227987(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAATA
SmilChr01G005280 Chr01 NC_080387.1:70197661-70197672promoter 内 1014-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 70200648-70203983(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCA
SmilChr01G002629 Chr01 NC_080387.1:44592233-44592244promoter 内 1008-1019 bp + 2982 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 44595226-44600028(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCA
SmilChr01G002959 Chr01 NC_080387.1:48467267-48467278promoter 内 957-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 48457651-48464234(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTT
SmilChr02G005451 Chr02 NC_080388.1:74860753-74860764promoter 内 952-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74853044-74857715(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTTTGTTTTT
SmilChr02G004720 Chr02 NC_080388.1:69455948-69455959promoter 内 941-952 bp + 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 69449774-69452899(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTTTGTTTTT
SmilChr01G002197 Chr01 NC_080387.1:38117359-38117370promoter 内 891-902 bp - 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 38120469-38123859(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTTTGTTTTT
SmilChr02G003490 Chr02 NC_080388.1:56159576-56159587promoter 内 808-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 56152577-56156394(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTATCT
SmilChr01G005674 Chr01 NC_080387.1:73015055-73015066promoter 内 792-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73018264-73019041(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCA
SmilChr01G006080 Chr01 NC_080387.1:76244343-76244354promoter 内 756-767 bp - 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 76247588-76263142(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTTTGTTTTT
SmilChr02G004901 Chr02 NC_080388.1:71015186-71015197promoter 内 753-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 71018434-71021100(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTT
SmilChr02G001050 Chr02 NC_080388.1:18723603-18723614promoter 内 615-626 bp + 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 18726989-18730100(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGATACAGAGCA
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74140318-74140329promoter 内 477-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74130223-74136805(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCA
SmilChr01G002567 Chr01 NC_080387.1:43774199-43774210promoter 内 348-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 43767301-43770557(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTTTGTTTTT
SmilChr01G003487 Chr01 NC_080387.1:53425358-53425369promoter 内 213-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 53418370-53421581(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTT
SmilChr02G001074 Chr02 NC_080388.1:19137627-19137638promoter 内 171-182 bp - 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 19141457-19144458(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTATCT
SmilChr02G001727 Chr02 NC_080388.1:31777943-31777954promoter 内 116-127 bp - 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 31773086-31774069(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAATA
SmilChr01G001796 Chr01 NC_080387.1:32820885-32820896promoter 内 39-50 bp - 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 32824847-32825280(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTT
SmilChr01G003356 Chr01 NC_080387.1:52301033-52301044promoter 内 1192-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 52303842-52304849(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCT
SmilChr02G000476 Chr02 NC_080388.1:6550616-6550627promoter 内 366-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6554251-6560125(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCT
SmilChr03G000967 Chr03 NC_080389.1:10938591-10938602promoter 内 2091-2102 bp - 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 5 10940501-10942103(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCC
SmilChr01G001106 Chr01 NC_080387.1:22652900-22652911promoter 内 1149-1160 bp + 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 5 22647103-22650059(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTCTG
SmilChr01G000697 Chr01 NC_080387.1:15669449-15669460promoter 内 1355-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 15672095-15672531(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAA
SmilChr01G005473 Chr01 NC_080387.1:71716567-71716578promoter 内 3907-3918 bp + 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 71716661-71719500(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGG
SmilChr01G002264 Chr01 NC_080387.1:39438780-39438791promoter 内 3568-3579 bp + 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 39437281-39438358(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCG
SmilChr03G000102 Chr03 NC_080389.1:1136062-1136073promoter 内 3485-3496 bp - 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 1136578-1142278(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTG
SmilChr01G002300 Chr01 NC_080387.1:39830931-39830942promoter 内 3433-3444 bp - 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 39823665-39830374(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAC
SmilChr01G000542 Chr01 NC_080387.1:11126319-11126330promoter 内 2720-2731 bp + 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 11124162-11125049(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCA
SmilChr02G000064 Chr02 NC_080388.1:846136-846147promoter 内 2262-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 843092-844408(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAA
SmilChr02G000206 Chr02 NC_080388.1:2688805-2688816promoter 内 2145-2156 bp + 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 2690661-2692657(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGTT
SmilChr02G003244 Chr02 NC_080388.1:53704161-53704172promoter 内 2076-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 53706086-53708424(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGTT
SmilChr01G005246 Chr01 NC_080387.1:69974104-69974115promoter 内 2058-2069 bp - 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 69976047-69976967(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTA
SmilChr03G001240 Chr03 NC_080389.1:14287302-14287313promoter 内 2001-2012 bp - 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 14289302-14294842(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTG
SmilChr01G005431 Chr01 NC_080387.1:71467867-71467878promoter 内 1909-1920 bp - 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 71469959-71473519(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTA
SmilChr01G004895 Chr01 NC_080387.1:67035862-67035873promoter 内 1808-1819 bp - 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 66999498-67033680(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAT
SmilChr01G004124 Chr01 NC_080387.1:59739687-59739698promoter 内 1807-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 59735616-59737504(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCA
SmilChr03G001401 Chr03 NC_080389.1:16614596-16614607promoter 内 1619-1630 bp - 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 16611364-16612225(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGG
SmilChr01G005071 Chr01 NC_080387.1:68587670-68587681promoter 内 1362-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 68590309-68591133(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTCT
SmilChr02G000284 Chr02 NC_080388.1:3639557-3639568promoter 内 1207-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 3635326-3636774(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGG
SmilChr02G000415 Chr02 NC_080388.1:5298540-5298551promoter 内 1176-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 5294334-5295726(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTTT
SmilChr01G000136 Chr01 NC_080387.1:2297600-2297611promoter 内 413-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 2288363-2294023(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCC
SmilChr02G000762 Chr02 NC_080388.1:12419135-12419146promoter 内 306-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 12414325-12415451(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCA
SmilChr01G000316 Chr01 NC_080387.1:6121761-6121772promoter 内 301-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 6116304-6118072(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCC
SmilChr01G004602 Chr01 NC_080387.1:64002000-64002011promoter 内 38-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 64005963-64007353(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTTT