转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 39 / 167 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000664 Chr01 NC_080387.1:14778050-14778061promoter 内 2191-2202 bp + 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 14779860-14782457(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GACCACGCCAGG
SmilChr01G000663 Chr01 NC_080387.1:14778050-14778061promoter 内 2142-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 14773813-14776202(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCTGGCGTGGTC
SmilChr04G000951 Chr04 NC_080390.1:12590911-12590922promoter 内 2988-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 12588461-12589909(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCTGGCGTGGGA
SmilChr06G002849 Chr06 NC_080392.1:41251018-41251029promoter 内 797-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 41247753-41247825(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGCTT
SmilChr07G000184 Chr07 NC_080393.1:1171865-1171876promoter 内 3865-3876 bp - 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 1169473-1171740(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCAGC
SmilChr05G001251 Chr05 NC_080391.1:10641536-10641547promoter 内 3482-3493 bp - 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 10642055-10645817(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr02G005372 Chr02 NC_080388.1:74409622-74409633promoter 内 3318-3329 bp - 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 74410305-74412582(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr01G003111 Chr01 NC_080387.1:49919679-49919690promoter 内 3209-3220 bp + 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49920471-49922006(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACT
SmilChr03G004044 Chr03 NC_080389.1:59432545-59432556promoter 内 3069-3080 bp + 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 59430620-59431624(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr05G000207 Chr05 NC_080391.1:1649537-1649548promoter 内 2836-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 1645530-1648383(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCAGC
SmilChr04G004120 Chr04 NC_080390.1:56076339-56076350promoter 内 2662-2673 bp + 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 56072747-56075011(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCTGGCGTGGCA
SmilChr05G001053 Chr05 NC_080391.1:8722222-8722233promoter 内 2051-2062 bp - 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 8718649-8720283(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACT
SmilChr04G001420 Chr04 NC_080390.1:23070730-23070741promoter 内 1792-1803 bp + 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 23072939-23074810(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCCCACGCCAGA
SmilChr08G003698 Chr08 NC_080394.1:41430097-41430108promoter 内 1401-1412 bp + 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 41432697-41433688(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCAGG
SmilChr08G002270 Chr08 NC_080394.1:20971152-20971163promoter 内 1021-1032 bp - 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 20974132-20976692(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTAA
SmilChr04G003136 Chr04 NC_080390.1:47957264-47957275promoter 内 662-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 47951279-47953936(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCTGGCGTGGGA
SmilChr06G000652 Chr06 NC_080392.1:5759311-5759322promoter 内 475-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 5754538-5755796(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGCTT
SmilChr04G004122 Chr04 NC_080390.1:56076339-56076350promoter 内 335-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 56080005-56083512(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCAGC
SmilChr05G003159 Chr05 NC_080391.1:40355637-40355648promoter 内 312-323 bp - 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 40359326-40362872(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr06G002567 Chr06 NC_080392.1:36875494-36875505promoter 内 203-214 bp - 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 36869329-36871707(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GACCACGCCAGG
SmilChr01G004959 Chr01 NC_080387.1:67687575-67687586promoter 内 3929-3940 bp + 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 67687647-67692378(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGCCACGCCAGA
SmilChr05G000564 Chr05 NC_080391.1:4241878-4241889promoter 内 3814-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4242065-4248077(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr02G004396 Chr02 NC_080388.1:66301595-66301606promoter 内 3789-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66301807-66304825(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATGCACGCCACA
SmilChr05G003158 Chr05 NC_080391.1:40355637-40355648promoter 内 3788-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 40355850-40357198(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr01G005201 Chr01 NC_080387.1:69691481-69691492promoter 内 3740-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 69691742-69692321(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGGCG
SmilChr01G003331 Chr01 NC_080387.1:52024681-52024692promoter 内 3728-3739 bp + 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 52024954-52026587(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGCCACGCCAGA
SmilChr04G000075 Chr04 NC_080390.1:694470-694481promoter 内 3721-3732 bp + 269 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 694750-696481(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATGCACGCCACA
SmilChr01G005087 Chr01 NC_080387.1:68733325-68733336promoter 内 3665-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68733661-68735754(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACT
SmilChr04G002373 Chr04 NC_080390.1:38237388-38237399promoter 内 3665-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38237724-38245084(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr02G002227 Chr02 NC_080388.1:39620958-39620969promoter 内 3647-3658 bp - 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39619583-39620615(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGCCACGCCAGA
SmilChr05G000520 Chr05 NC_080391.1:4007987-4007998promoter 内 3617-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3998101-4007614(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACT
SmilChr05G000522 Chr05 NC_080391.1:4007987-4007998promoter 内 3583-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4008405-4011669(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr02G002831 Chr02 NC_080388.1:48440549-48440560promoter 内 3572-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48438113-48440131(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGGGC
SmilChr07G003364 Chr07 NC_080393.1:36223528-36223539promoter 内 3556-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36223973-36224394(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGCCACGCCAGA
SmilChr04G002473 Chr04 NC_080390.1:39537904-39537915promoter 内 3501-3512 bp - 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39536451-39537415(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCCCACGCCAGA
SmilChr03G000682 Chr03 NC_080389.1:7627251-7627262promoter 内 3480-3491 bp + 510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7625512-7626741(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT
SmilChr04G000473 Chr04 NC_080390.1:5044870-5044881promoter 内 3460-3471 bp - 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 5042737-5044340(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCACT
SmilChr04G002474 Chr04 NC_080390.1:39537011-39537022promoter 内 3414-3425 bp + 576 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39537598-39538475(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCCCACGCCAGA
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SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2595845-2595856promoter 内 3012-3023 bp - 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2596834-2607793(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGTTT