转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 40 / 126 下载 TSV

上一页 40 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003667 Chr04 NC_080390.1:53120849-53120863promoter 内 2100-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 53114874-53118962(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCACAG
SmilChr06G001366 Chr06 NC_080392.1:14270143-14270157promoter 内 1832-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 14263395-14267988(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTACGT
SmilChr03G003020 Chr03 NC_080389.1:47107098-47107112promoter 内 1735-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 47109364-47111929(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGTCCTGA
SmilChr01G000557 Chr01 NC_080387.1:11622832-11622846promoter 内 1484-1498 bp - 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 11619164-11620329(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCAGGACACGTGGCT
SmilChr04G003386 Chr04 NC_080390.1:50422564-50422578promoter 内 1447-1461 bp + 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 50417948-50420024(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGTCCTGA
SmilChr01G003666 Chr01 NC_080387.1:55090627-55090641promoter 内 1294-1308 bp - 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 55080249-55087934(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAATGACGTGGCA
SmilChr06G002068 Chr06 NC_080392.1:27246605-27246619promoter 内 1100-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 27249506-27250123(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCGGCT
SmilChr04G001483 Chr04 NC_080390.1:24264873-24264887promoter 内 929-943 bp - 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 24260570-24261815(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCAGGACACGTGGCT
SmilChr03G003997 Chr03 NC_080389.1:59011281-59011295promoter 内 908-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59014374-59017640(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTATA
SmilChr06G001763 Chr06 NC_080392.1:20603342-20603356promoter 内 881-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 20598312-20600236(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCTGCTGACGTGGCC
SmilChr06G001639 Chr06 NC_080392.1:18485390-18485404promoter 内 758-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 18480260-18482161(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGGGTTGACGTGGCA
SmilChr02G001288 Chr02 NC_080388.1:23724751-23724765promoter 内 663-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 23720890-23721427(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTGCTGACGTGGCG
SmilChr06G000312 Chr06 NC_080392.1:2260910-2260924promoter 内 549-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2252940-2257472(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAACTCA
SmilChr02G004841 Chr02 NC_080388.1:70545259-70545273promoter 内 547-561 bp + 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 70536269-70541819(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTTCAT
SmilChr01G004222 Chr01 NC_080387.1:60587023-60587037promoter 内 517-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 60582237-60583553(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGTCCTGA
SmilChr05G000571 Chr05 NC_080391.1:4301578-4301592promoter 内 383-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4297118-4297974(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TACTGACACGTGGCG
SmilChr03G000691 Chr03 NC_080389.1:7723301-7723315promoter 内 3971-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 7723331-7725582(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTCTAAA
SmilChr03G000686 Chr03 NC_080389.1:7671153-7671167promoter 内 3941-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 7671213-7673668(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTCTAAA
SmilChr08G000771 Chr08 NC_080394.1:5691602-5691616promoter 内 3783-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 5683440-5691398(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr06G003237 Chr06 NC_080392.1:45078380-45078394promoter 内 3740-3754 bp + 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 45078641-45080191(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACAGTACACGTGGCA
SmilChr02G005022 Chr02 NC_080388.1:71980294-71980308promoter 内 3588-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 71978069-71979895(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGTTCAC
SmilChr01G001044 Chr01 NC_080387.1:21687424-21687438promoter 内 3508-3522 bp + 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 21684371-21686945(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTTGCAT
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71457912-71457926promoter 内 3261-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 71458652-71461641(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr05G004288 Chr05 NC_080391.1:56661305-56661319promoter 内 2986-3000 bp + 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 56662320-56668544(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTTGACACGTGTCA
SmilChr01G004275 Chr01 NC_080387.1:60985939-60985953promoter 内 2963-2977 bp + 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 60984478-60984915(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGGCAGCA
SmilChr02G000319 Chr02 NC_080388.1:4003640-4003654promoter 内 2778-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 4004863-4005674(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGTTCAC
SmilChr02G005023 Chr02 NC_080388.1:71980294-71980308promoter 内 2624-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 71981671-71985177(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr03G003771 Chr03 NC_080389.1:56849836-56849850promoter 内 2382-2396 bp - 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 56851455-56857112(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGTTCAC
SmilChr02G005558 Chr02 NC_080388.1:75538231-75538245promoter 内 2079-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 75534486-75536323(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGTCCACGTGGCA
SmilChr08G000586 Chr08 NC_080394.1:4366140-4366154promoter 内 1848-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 4359356-4364001(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTACATG
SmilChr06G003236 Chr06 NC_080392.1:45078380-45078394promoter 内 1629-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 45073365-45076022(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTACTGT
SmilChr05G003757 Chr05 NC_080391.1:50747514-50747528promoter 内 1605-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 50739821-50745132(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr04G001600 Chr04 NC_080390.1:26684086-26684100promoter 内 636-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 26676919-26680735(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr08G000772 Chr08 NC_080394.1:5691602-5691616promoter 内 385-399 bp - 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 5686469-5688000(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGAACCACGTGGCA
SmilChr01G002305 Chr01 NC_080387.1:39949641-39949655promoter 内 32-46 bp - 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 39941461-39945686(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGGAGCGACGTGGCG
SmilChr08G000773 Chr08 NC_080394.1:5691602-5691616promoter 内 29-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 5695574-5698253(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGTTCAC
SmilChr05G004350 Chr05 NC_080391.1:57109506-57109520promoter 内 3959-3973 bp - 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 57109548-57113079(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCCATT
SmilChr04G001431 Chr04 NC_080390.1:23345101-23345115promoter 内 3911-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23343883-23345025(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTCGCAGACGTGGCA
SmilChr07G002479 Chr07 NC_080393.1:23389692-23389706promoter 内 3902-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23389791-23391061(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCACAAGC
SmilChr08G004113 Chr08 NC_080394.1:49924359-49924373promoter 内 3719-3733 bp - 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49923973-49924091(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGTCCGACGTGGCA
SmilChr08G000233 Chr08 NC_080394.1:1594724-1594738promoter 内 3630-3644 bp - 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1590925-1594367(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTTGAAGACGTGGCG
SmilChr08G000422 Chr08 NC_080394.1:3013609-3013623promoter 内 3426-3440 bp + 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 3011809-3013048(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTTCAAG
SmilChr05G002702 Chr05 NC_080391.1:31007277-31007291promoter 内 3418-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31004746-31006708(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCAGTGACGTGGCG
SmilChr03G002100 Chr03 NC_080389.1:32499402-32499416promoter 内 3292-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32496188-32498707(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGACTTA
SmilChr07G001942 Chr07 NC_080393.1:16835029-16835043promoter 内 3225-3239 bp + 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 16835805-16841396(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTTCACACGTGGCA
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SmilChr07G003744 Chr07 NC_080393.1:45643345-45643359promoter 内 2494-2508 bp + 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 45644852-45644958(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCTCCACACGTGGCA
SmilChr03G002097 Chr03 NC_080389.1:32419517-32419531promoter 内 2486-2500 bp + 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32421032-32421138(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCTCCACACGTGGCA
SmilChr08G001091 Chr08 NC_080394.1:8417549-8417563promoter 内 2470-2484 bp + 1517 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 8419080-8419274(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACGACACGTGGCG
SmilChr02G000440 Chr02 NC_080388.1:5722462-5722476promoter 内 2390-2404 bp - 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5720759-5720865(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCTCCACACGTGGCA