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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 41 / 138 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002828 Chr05 NC_080391.1:33542921-33542935promoter 内 273-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 33546649-33547371(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGATTCCACGTGGCA
SmilChr05G002631 Chr05 NC_080391.1:29668484-29668498promoter 内 240-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29672245-29673624(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr06G001726 Chr06 NC_080392.1:19892901-19892915promoter 内 186-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 19896716-19899644(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr05G003084 Chr05 NC_080391.1:39024581-39024595promoter 内 151-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 39028431-39029726(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr01G000809 Chr01 NC_080387.1:17478739-17478753promoter 内 81-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 17474079-17474833(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr08G004661 Chr08 NC_080394.1:56108192-56108206promoter 内 49-63 bp + 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 56101579-56104254(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9532338-9532352promoter 内 17-31 bp - 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 9536322-9536798(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCA
SmilChr03G004145 Chr03 NC_080389.1:60283859-60283873promoter 内 3955-3969 bp - 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 60283905-60288534(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTTCTAT
SmilChr04G004085 Chr04 NC_080390.1:55891130-55891144promoter 内 3934-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 55887282-55891077(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTCAGAT
SmilChr04G002076 Chr04 NC_080390.1:33505024-33505038promoter 内 3927-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 33505098-33509447(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGGATGA
SmilChr07G000774 Chr07 NC_080393.1:5421247-5421261promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5421364-5422583(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCGTCA
SmilChr06G000374 Chr06 NC_080392.1:2886442-2886456promoter 内 3774-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 2882841-2886229(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGCCAC
SmilChr08G002322 Chr08 NC_080394.1:21882266-21882280promoter 内 3341-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 21877303-21881620(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGCGCC
SmilChr03G003252 Chr03 NC_080389.1:50391792-50391806promoter 内 3321-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 50392472-50396682(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTGTAAT
SmilChr01G003416 Chr01 NC_080387.1:52796898-52796912promoter 内 3214-3228 bp + 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 52797685-52800784(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TATGCTTACGTGGCA
SmilChr08G003063 Chr08 NC_080394.1:30818599-30818613promoter 内 3154-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 30816712-30817766(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAGTTGC
SmilChr01G000717 Chr01 NC_080387.1:16066099-16066113promoter 内 3132-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 16060426-16065244(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCGGTCCG
SmilChr01G004536 Chr01 NC_080387.1:63519496-63519510promoter 内 3029-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63520468-63524011(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GATGGAGACGTGGCT
SmilChr01G001994 Chr01 NC_080387.1:35342462-35342476promoter 内 2917-2931 bp - 1070 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35339808-35341392(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAGAGACACGTGGCA
SmilChr08G000787 Chr08 NC_080394.1:5808036-5808050promoter 内 2753-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5802314-5806802(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCTTAACT
SmilChr07G003744 Chr07 NC_080393.1:45643345-45643359promoter 内 2494-2508 bp + 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 45644852-45644958(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCTCCACACGTGGCA
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SmilChr03G001952 Chr03 NC_080389.1:27894167-27894181promoter 内 2340-2354 bp + 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 27895828-27895934(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCTCCACACGTGGCA
SmilChr03G001041 Chr03 NC_080389.1:12127414-12127428promoter 内 1756-1770 bp - 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 12129659-12133243(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGAGTTTC
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SmilChr02G005524 Chr02 NC_080388.1:75320775-75320789promoter 内 1645-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 75315098-75318433(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TATGCTTACGTGGCA
SmilChr01G005079 Chr01 NC_080387.1:68672342-68672356promoter 内 1603-1617 bp - 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 68666714-68669958(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCTTCTGACGTGGCG
SmilChr06G001661 Chr06 NC_080392.1:18894115-18894129promoter 内 1521-1535 bp + 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 18890472-18891649(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCTCTT
SmilChr03G000307 Chr03 NC_080389.1:3498725-3498739promoter 内 1421-1435 bp + 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 3493752-3496159(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAGTCTA
SmilChr08G003471 Chr08 NC_080394.1:37334094-37334108promoter 内 1377-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37328225-37331484(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCAGGA
SmilChr01G001841 Chr01 NC_080387.1:33347436-33347450promoter 内 1299-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 33350138-33352410(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TAGGGCTACGTGGCA
SmilChr07G000556 Chr07 NC_080393.1:3840946-3840960promoter 内 1273-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 3836456-3838232(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCACGTGT
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SmilChr07G004003 Chr07 NC_080393.1:51103691-51103705promoter 内 1038-1052 bp + 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 51097361-51100742(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGCGAC
SmilChr08G004639 Chr08 NC_080394.1:55928567-55928581promoter 内 990-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 55919184-55925570(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCACCGAG
SmilChr08G000788 Chr08 NC_080394.1:5808036-5808050promoter 内 949-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5811088-5815369(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGTTAAGACGTGGCA
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SmilChr04G003263 Chr04 NC_080390.1:49363215-49363229promoter 内 579-593 bp + 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 49359417-49359807(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCAGGA
SmilChr01G002191 Chr01 NC_080387.1:38057809-38057823promoter 内 344-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 38061466-38062409(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCCTGACACGTGGCA
SmilChr05G004370 Chr05 NC_080391.1:57219272-57219286promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57213480-57215560(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGGGCCCACGTGGCT
SmilChr08G001418 Chr08 NC_080394.1:11355490-11355504promoter 内 201-215 bp + 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 11350169-11351704(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCTTCTTT
SmilChr02G005525 Chr02 NC_080388.1:75320775-75320789promoter 内 186-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 75324590-75342843(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGCATA
SmilChr01G002783 Chr01 NC_080387.1:46290550-46290564promoter 内 1354-1368 bp - 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 46280234-46287917(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGCTTACGTGGCA
SmilChr01G000345 Chr01 NC_080387.1:7038748-7038762promoter 内 3823-3837 bp - 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 7035909-7038584(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAGAGCCACGTGGCG
SmilChr08G002672 Chr08 NC_080394.1:26226635-26226649promoter 内 3135-3149 bp - 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 26221368-26225783(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGCGACACGTGGCA
SmilChr01G003482 Chr01 NC_080387.1:53371816-53371830promoter 内 1975-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 53373842-53376928(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATGCTTACGTGGCA
SmilChr07G001136 Chr07 NC_080393.1:8526856-8526870promoter 内 3954-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 8526903-8530483(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGCGTC