转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 41 / 138 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000005 Chr02 NC_080388.1:41906-41918promoter 内 1330-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 34537-39247(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACACT
SmilChr03G004068 Chr03 NC_080389.1:59664744-59664756promoter 内 1293-1305 bp - 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59658877-59662048(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAGGTTGACTTTT
SmilChr03G004059 Chr03 NC_080389.1:59550692-59550704promoter 内 1275-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59539744-59547978(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTATA
SmilChr02G001168 Chr02 NC_080388.1:21447872-21447884promoter 内 1268-1280 bp + 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21441617-21445151(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACACA
SmilChr03G000741 Chr03 NC_080389.1:8415686-8415698promoter 内 1203-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8418484-8419344(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACAGA
SmilChr02G000306 Chr02 NC_080388.1:3852340-3852352promoter 内 1176-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3855165-3858519(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTGAC
SmilChr03G001670 Chr03 NC_080389.1:21757881-21757893promoter 内 1171-1183 bp + 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21751607-21755063(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAAAGAA
SmilChr01G002840 Chr01 NC_080387.1:46977885-46977897promoter 内 982-994 bp - 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46980904-46983021(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACAGA
SmilChr02G001480 Chr02 NC_080388.1:27686549-27686561promoter 内 982-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27683437-27683542(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAACCTT
SmilChr01G001356 Chr01 NC_080387.1:26824509-26824521promoter 内 953-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26827557-26828300(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGGTTGACTGAC
SmilChr02G001681 Chr02 NC_080388.1:31047708-31047720promoter 内 947-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 31050762-31051106(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTAAG
SmilChr03G003115 Chr03 NC_080389.1:48280425-48280437promoter 内 924-936 bp + 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 48274473-48277360(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAACCTT
SmilChr03G003688 Chr03 NC_080389.1:55769518-55769530promoter 内 886-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55772633-55776823(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGGGTTGACTAGA
SmilChr01G001651 Chr01 NC_080387.1:30574756-30574768promoter 内 864-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 30577893-30583645(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACACA
SmilChr03G003313 Chr03 NC_080389.1:51374240-51374252promoter 内 845-857 bp - 3144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51370311-51371096(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTGTTGACTGGT
SmilChr01G002368 Chr01 NC_080387.1:40877949-40877961promoter 内 824-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40872592-40874784(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAAAGGG
SmilChr02G001180 Chr02 NC_080388.1:21675973-21675985promoter 内 715-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21671662-21672699(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAACCTT
SmilChr01G003015 Chr01 NC_080387.1:49183068-49183080promoter 内 567-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49178327-49179646(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAACACT
SmilChr01G002096 Chr01 NC_080387.1:36981445-36981457promoter 内 541-553 bp + 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36984905-36986030(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTAAG
SmilChr01G006037 Chr01 NC_080387.1:75871592-75871604promoter 内 508-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75875085-75878965(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGTTGACTGGT
SmilChr01G001831 Chr01 NC_080387.1:33278774-33278786promoter 内 420-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33268420-33275205(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACACA
SmilChr03G004425 Chr03 NC_080389.1:62410425-62410437promoter 内 342-354 bp - 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62400346-62406778(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAGTTGACTAGT
SmilChr01G002265 Chr01 NC_080387.1:39440617-39440629promoter 内 330-342 bp - 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39444288-39446912(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACAGA
SmilChr02G001747 Chr02 NC_080388.1:32061720-32061732promoter 内 321-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 32049309-32058052(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGTTGACTGTT
SmilChr03G002777 Chr03 NC_080389.1:44208043-44208055promoter 内 83-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 44181009-44204137(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACGGTTGACTGAC
SmilChr02G001427 Chr02 NC_080388.1:26929430-26929442promoter 内 48-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26933383-26936742(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACAGA
SmilChr03G001987 Chr03 NC_080389.1:29127092-29127104promoter 内 18-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29109433-29123121(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACGGTTGACTGAC
SmilChr03G003886 Chr03 NC_080389.1:57936955-57936967promoter 内 2628-2640 bp + 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 57928068-57935594(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACACT
SmilChr01G002173 Chr01 NC_080387.1:37817131-37817143promoter 内 1437-1449 bp - 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 37813497-37814579(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTGTTGACTGTA
SmilChr03G000620 Chr03 NC_080389.1:6824296-6824308promoter 内 3885-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 6824412-6832511(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGAGTCAACCCC
SmilChr03G000089 Chr03 NC_080389.1:1013323-1013335promoter 内 3543-3555 bp + 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 1013781-1017093(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTAGG
SmilChr01G005798 Chr01 NC_080387.1:74057838-74057850promoter 内 3255-3267 bp - 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 74058584-74062104(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAAGAT
SmilChr01G000503 Chr01 NC_080387.1:10205132-10205144promoter 内 3243-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 10205890-10206875(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACGTG
SmilChr03G000343 Chr03 NC_080389.1:3886660-3886672promoter 内 2793-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 3883590-3885464(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACAAC
SmilChr03G000411 Chr03 NC_080389.1:4443480-4443492promoter 内 2595-2607 bp + 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 4441547-4442086(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACAAC
SmilChr01G005800 Chr01 NC_080387.1:74072374-74072386promoter 内 2336-2348 bp - 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 74074039-74077240(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAAGAT
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SmilChr03G000410 Chr03 NC_080389.1:4443480-4443492promoter 内 1879-1891 bp + 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 4440018-4441370(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACAAC
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