转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 43 / 134 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003429 Chr08 NC_080394.1:36551226-36551240promoter 内 2625-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36545162-36549864(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCAAACC
SmilChr01G004843 Chr01 NC_080387.1:66571999-66572013promoter 内 2436-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66562443-66570448(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTATGTCGGCCTAGT
SmilChr08G000420 Chr08 NC_080394.1:2989583-2989597promoter 内 2302-2316 bp - 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2991282-3002412(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGGTGTCGGCAAAGA
SmilChr03G004467 Chr03 NC_080389.1:62732967-62732981promoter 内 2294-2308 bp + 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 62726166-62731274(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAACGTCGGCAGGGT
SmilChr04G001453 Chr04 NC_080390.1:23916045-23916059promoter 内 2058-2072 bp - 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23917988-23918094(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATGTCGGCTGATC
SmilChr04G003494 Chr04 NC_080390.1:51371372-51371386promoter 内 2018-2032 bp + 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51365035-51369403(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGACGTCGGCAGTTG
SmilChr02G003326 Chr02 NC_080388.1:54528156-54528170promoter 内 1968-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54523480-54526137(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTATGTCGGCCAATT
SmilChr08G002424 Chr08 NC_080394.1:23016774-23016788promoter 内 1955-1969 bp - 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23018820-23019426(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCCACTA
SmilChr05G001162 Chr05 NC_080391.1:9765709-9765723promoter 内 1880-1894 bp - 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9767830-9773437(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCGAAAA
SmilChr01G001264 Chr01 NC_080387.1:25341223-25341237promoter 内 1853-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25338009-25339089(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTTTCGCCGACAAGG
SmilChr08G003028 Chr08 NC_080394.1:30434272-30434286promoter 内 1814-1828 bp + 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30430738-30432099(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGTTGTCGGCGGGCT
SmilChr01G003100 Chr01 NC_080387.1:49811479-49811493promoter 内 1789-1803 bp + 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49805545-49809281(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGTGTCGGCAGCAG
SmilChr07G003108 Chr07 NC_080393.1:32932273-32932287promoter 内 1783-1797 bp - 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32934491-32934570(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGGTGTCGGCCGTCG
SmilChr03G001862 Chr03 NC_080389.1:25709508-25709522promoter 内 1726-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25711783-25712259(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTCTTGCCGACATTA
SmilChr08G004564 Chr08 NC_080394.1:55247671-55247685promoter 内 1630-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55242514-55245314(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGTGCACCGACATGA
SmilChr02G001060 Chr02 NC_080388.1:18839166-18839180promoter 内 1554-1568 bp - 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18841613-18842665(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGTTGTCGGCGAGAA
SmilChr01G002348 Chr01 NC_080387.1:40624841-40624855promoter 内 1433-1447 bp + 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40627409-40632379(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACTTTGCCGACTTCG
SmilChr01G003176 Chr01 NC_080387.1:50561141-50561155promoter 内 1366-1380 bp - 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50558092-50558520(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATCTTGCCGACGTGG
SmilChr05G001161 Chr05 NC_080391.1:9765709-9765723promoter 内 1131-1145 bp - 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9757662-9762853(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTTTCGCCGACAAGG
SmilChr03G001487 Chr03 NC_080389.1:17942563-17942577promoter 内 1126-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17945438-17947540(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CACCGGCCGACAAGG
SmilChr02G002925 Chr02 NC_080388.1:49659779-49659793promoter 内 960-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49662820-49665482(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGACGTCGGCATAGC
SmilChr01G000768 Chr01 NC_080387.1:16809774-16809788promoter 内 890-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16812885-16820170(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTCTTGCCGACATTA
SmilChr04G004163 Chr04 NC_080390.1:56297381-56297395promoter 内 791-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56300591-56302912(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGTAAAAC
SmilChr05G000899 Chr05 NC_080391.1:7115761-7115775promoter 内 787-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7118975-7119860(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACACTGCCGACATTT
SmilChr08G004494 Chr08 NC_080394.1:54576465-54576479promoter 内 777-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54572282-54573255(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGCTTTGG
SmilChr01G003711 Chr01 NC_080387.1:55455777-55455791promoter 内 676-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55459102-55462477(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTAGAAT
SmilChr07G004605 Chr07 NC_080393.1:58856933-58856947promoter 内 670-684 bp + 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 58850431-58853616(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTCATCT
SmilChr07G004361 Chr07 NC_080393.1:56157648-56157662promoter 内 604-618 bp - 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56161045-56162504(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCGAACA
SmilChr06G001463 Chr06 NC_080392.1:15492061-15492075promoter 内 539-553 bp + 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15495523-15498317(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTCTCGCCGACAACA
SmilChr08G004825 Chr08 NC_080394.1:57507729-57507743promoter 内 448-462 bp + 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 57511282-57514468(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTCTGCCGACCTCC
SmilChr05G001050 Chr05 NC_080391.1:8696668-8696682promoter 内 422-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8700247-8716005(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTGGCGCCGACATTA
SmilChr02G004691 Chr02 NC_080388.1:69258303-69258317promoter 内 409-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 69261895-69268038(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATGTGGCCGACATTA
SmilChr05G000964 Chr05 NC_080391.1:7782026-7782040promoter 内 409-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7785618-7786489(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACACTGCCGACATTT
SmilChr08G002047 Chr08 NC_080394.1:18307851-18307865promoter 内 367-381 bp - 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18311485-18315355(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGAGGTCGGCAACGT
SmilChr06G000175 Chr06 NC_080392.1:1216599-1216613promoter 内 334-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1209620-1212946(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CACTGGCCGACACAG
SmilChr08G003751 Chr08 NC_080394.1:42546460-42546474promoter 内 237-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 42550224-42554243(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGACGTCGGCAATCA
SmilChr04G000600 Chr04 NC_080390.1:6786327-6786341promoter 内 190-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6779158-6782530(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTGATTA
SmilChr04G003592 Chr04 NC_080390.1:52360035-52360049promoter 内 114-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 52353605-52356162(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAACTGCCGACATTG
SmilChr08G001958 Chr08 NC_080394.1:17250681-17250695promoter 内 58-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17245213-17246752(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGTTGCCGACAACG
SmilChr03G001582 Chr03 NC_080389.1:20015024-20015038promoter 内 2874-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 20012117-20013911(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTCTGCCGACCTTG
SmilChr06G001836 Chr06 NC_080392.1:21560237-21560251promoter 内 3815-3829 bp + 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 21556603-21560065(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCAGATT
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SmilChr05G003155 Chr05 NC_080391.1:40301982-40301996promoter 内 3505-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 40302478-40305271(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AATTGTCGGCGGCGG
SmilChr06G001702 Chr06 NC_080392.1:19567879-19567893promoter 内 3128-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 19568752-19576409(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AATCTGCCGACATAT
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SmilChr08G001961 Chr08 NC_080394.1:17263819-17263833promoter 内 1845-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 17265975-17267865(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CACACACCGACATGT
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SmilChr08G004354 Chr08 NC_080394.1:53236494-53236508promoter 内 1356-1370 bp - 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 53239139-53245384(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGGTGTCGGCAATCA