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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 44 / 149 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002241 Chr03 NC_080389.1:35330540-35330554promoter 内 1274-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35333267-35335667(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGCCTTATCCGCTAC
SmilChr01G005130 Chr01 NC_080387.1:69100500-69100514promoter 内 1247-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 69096784-69097760(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACCTTATCCAGTGC
SmilChr03G001197 Chr03 NC_080389.1:13798220-13798234promoter 内 1192-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13794904-13795425(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAAAGGATAAGGGT
SmilChr02G001572 Chr02 NC_080388.1:29145552-29145566promoter 内 1168-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29148385-29153062(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTCTTATCCATTTG
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71455724-71455738promoter 内 1073-1087 bp - 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71458652-71461641(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAATTGGATAAGCTG
SmilChr01G003909 Chr01 NC_080387.1:57377235-57377249promoter 内 924-938 bp + 3063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57373138-57374172(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAAGGGATAAGGTT
SmilChr01G003724 Chr01 NC_080387.1:55561494-55561508promoter 内 887-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55553418-55558394(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCCTTATCTATATC
SmilChr03G004122 Chr03 NC_080389.1:60073881-60073895promoter 内 835-849 bp - 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60077047-60078758(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGAGTGGATAAGCCT
SmilChr04G001825 Chr04 NC_080390.1:29791715-29791729promoter 内 798-812 bp + 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29794918-29797030(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTTATCCAAATG
SmilChr02G003975 Chr02 NC_080388.1:62023651-62023665promoter 内 765-779 bp + 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62018383-62020429(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAATATG
SmilChr04G000173 Chr04 NC_080390.1:1552186-1552200promoter 内 700-714 bp + 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1555487-1566128(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGCCTTATCCGCTAC
SmilChr03G004520 Chr03 NC_080389.1:63276560-63276574promoter 内 681-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 63271455-63273254(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAGTGGATAAGTAT
SmilChr02G005361 Chr02 NC_080388.1:74326338-74326352promoter 内 660-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74329679-74332328(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCATAAT
SmilChr01G005397 Chr01 NC_080387.1:71232714-71232728promoter 内 638-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71236077-71238633(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAATGGATAATAAT
SmilChr01G004796 Chr01 NC_080387.1:66191800-66191814promoter 内 622-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 66186585-66188435(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACTTTATCCAATAT
SmilChr03G002633 Chr03 NC_080389.1:41864388-41864402promoter 内 611-625 bp - 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 41857372-41861012(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCCAACAT
SmilChr01G002539 Chr01 NC_080387.1:43440860-43440874promoter 内 599-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43444262-43446750(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTATTGGATAAGAGT
SmilChr01G003117 Chr01 NC_080387.1:49973338-49973352promoter 内 562-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49967805-49969913(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCTATGGATAAGGAG
SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20988817-20988831promoter 内 556-570 bp + 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20992262-20994544(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGCCTTATCCGCTAC
SmilChr01G003559 Chr01 NC_080387.1:54195917-54195931promoter 内 316-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54199602-54203213(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATCTTATCCACTCT
SmilChr03G002178 Chr03 NC_080389.1:33853720-33853734promoter 内 293-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33857428-33859654(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGCCTTATCCGCTAC
SmilChr01G003894 Chr01 NC_080387.1:57231309-57231323promoter 内 268-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57235042-57237492(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCCCTTTT
SmilChr01G003911 Chr01 NC_080387.1:57377235-57377249promoter 内 268-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57380968-57383344(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCCCTTTT
SmilChr04G001477 Chr04 NC_080390.1:24205760-24205774promoter 内 160-174 bp + 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 24209601-24213426(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAATAA
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SmilChr02G002177 Chr02 NC_080388.1:39004061-39004075promoter 内 20-34 bp + 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38991661-39000094(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGTGGATAACCTT
SmilChr04G003198 Chr04 NC_080390.1:48834244-48834258promoter 内 3765-3779 bp + 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 48834480-48834959(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTCTTATCCATTTT
SmilChr04G000308 Chr04 NC_080390.1:2852540-2852554promoter 内 3898-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 2852643-2853942(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTT
SmilChr03G001504 Chr03 NC_080389.1:18397785-18397799promoter 内 3892-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 18397894-18404947(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCTTTATCCAAACA
SmilChr03G003936 Chr03 NC_080389.1:58424116-58424130promoter 内 3497-3511 bp + 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 58422533-58423626(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTGGATAACATA
SmilChr02G001716 Chr02 NC_080388.1:31606107-31606121promoter 内 2616-2630 bp + 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 31598685-31604736(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAGAAG
SmilChr01G004549 Chr01 NC_080387.1:63612738-63612752promoter 内 2031-2045 bp - 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 63608236-63610782(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCATTATCCACATC
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SmilChr04G003972 Chr04 NC_080390.1:55189423-55189437promoter 内 1961-1975 bp - 2026 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 55185389-55187397(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATCTTATCCGATTC
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SmilChr03G003806 Chr03 NC_080389.1:57136204-57136218promoter 内 890-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 57130065-57133107(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTAACGGATAAGAAT
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SmilChr02G004301 Chr02 NC_080388.1:65379243-65379257promoter 内 495-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 65382749-65386575(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCAAAAC
SmilChr03G003607 Chr03 NC_080389.1:54707388-54707402promoter 内 133-147 bp + 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 54711256-54713883(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCAAATC
SmilChr02G005312 Chr02 NC_080388.1:74013360-74013374promoter 内 3934-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 74013427-74014978(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCATTATCCAATTA
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67303796-67303810promoter 内 3895-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 67303902-67303973(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCATTATCCACATA
SmilChr04G000433 Chr04 NC_080390.1:4602015-4602029promoter 内 3808-3822 bp - 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 4602208-4604343(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGTGGATAATACT
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SmilChr04G002198 Chr04 NC_080390.1:35598629-35598643promoter 内 3548-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 35597271-35598190(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATGAGATT
SmilChr03G002723 Chr03 NC_080389.1:43236972-43236986promoter 内 3494-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 43237479-43237874(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTATTA
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SmilChr02G001253 Chr02 NC_080388.1:23028889-23028903promoter 内 3360-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 23024564-23028262(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATTTGGATAATATA
SmilChr04G000137 Chr04 NC_080390.1:1175144-1175158promoter 内 3256-3270 bp - 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 1175889-1178517(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAATGAA