转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 46 / 139 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004430 Chr03 NC_080389.1:62456203-62456214promoter 内 2684-2695 bp + 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62457520-62460404(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTTCACGTGGC
SmilChr03G001227 Chr03 NC_080389.1:14159484-14159495promoter 内 2679-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 14160806-14162209(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTCGC
SmilChr01G000266 Chr01 NC_080387.1:5131049-5131060promoter 内 2647-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5132403-5133228(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGGTC
SmilChr03G004602 Chr03 NC_080389.1:63806591-63806602promoter 内 2642-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63802678-63805243(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA
SmilChr02G003313 Chr02 NC_080388.1:54389397-54389408promoter 内 2635-2646 bp + 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54390763-54392598(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGAGACGTGGG
SmilChr03G003431 Chr03 NC_080389.1:52665046-52665057promoter 内 2516-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52666531-52691520(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGT
SmilChr04G000559 Chr04 NC_080390.1:6255331-6255342promoter 内 2355-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6256977-6258392(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATGA
SmilChr02G001710 Chr02 NC_080388.1:31499446-31499457promoter 内 2335-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 31501112-31504383(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGT
SmilChr03G004604 Chr03 NC_080389.1:63813014-63813025promoter 内 2246-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63809935-63811270(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA
SmilChr03G001711 Chr03 NC_080389.1:22895574-22895585promoter 内 2196-2207 bp - 1794 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 22897379-22900731(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGCG
SmilChr02G002492 Chr02 NC_080388.1:43362309-43362320promoter 内 2069-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43353388-43360388(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr02G004924 Chr02 NC_080388.1:71254953-71254964promoter 内 2067-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 71252206-71253030(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr01G002089 Chr01 NC_080387.1:36886016-36886027promoter 内 2052-2063 bp + 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36883067-36884078(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGTC
SmilChr01G000987 Chr01 NC_080387.1:20872334-20872345promoter 内 2005-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 20874330-20876202(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGGTG
SmilChr04G003250 Chr04 NC_080390.1:49244213-49244224promoter 内 1982-1993 bp + 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49246232-49247104(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr02G003830 Chr02 NC_080388.1:59949601-59949612promoter 内 1863-1874 bp + 2127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 59951739-59952492(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr01G003811 Chr01 NC_080387.1:56489532-56489543promoter 内 1788-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56485183-56487330(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTGAA
SmilChr04G002267 Chr04 NC_080390.1:36680414-36680425promoter 内 1642-1653 bp + 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36682773-36686580(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr04G004082 Chr04 NC_080390.1:55863483-55863494promoter 内 1453-1464 bp - 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 55866031-55873695(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr03G004607 Chr03 NC_080389.1:63826106-63826117promoter 内 1386-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63822711-63823502(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA
SmilChr04G000604 Chr04 NC_080390.1:6838557-6838568promoter 内 1384-1395 bp + 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6829232-6835951(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAGCG
SmilChr03G004125 Chr03 NC_080389.1:60092123-60092134promoter 内 1376-1387 bp + 2614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60094748-60095865(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr03G002973 Chr03 NC_080389.1:46529228-46529239promoter 内 1139-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46524990-46526377(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr03G004625 Chr03 NC_080389.1:63920578-63920589promoter 内 1054-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63916370-63917642(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGC
SmilChr01G004270 Chr01 NC_080387.1:60949806-60949817promoter 内 1012-1023 bp + 2978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60943716-60946828(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGAC
SmilChr03G004458 Chr03 NC_080389.1:62683446-62683457promoter 内 973-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62675581-62680429(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr03G000729 Chr03 NC_080389.1:8215364-8215375promoter 内 967-978 bp + 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 8211273-8212341(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAGCT
SmilChr01G002845 Chr01 NC_080387.1:47023123-47023134promoter 内 936-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 47019019-47020069(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr02G003189 Chr02 NC_080388.1:53047204-53047215promoter 内 928-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53050277-53053110(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr01G006159 Chr01 NC_080387.1:77007301-77007312promoter 内 854-865 bp - 3136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 77003151-77004165(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGT
SmilChr01G003799 Chr01 NC_080387.1:56376602-56376613promoter 内 650-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56370038-56373262(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGA
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62683446-62683457promoter 内 543-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62679200-62679999(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr02G000137 Chr02 NC_080388.1:1856655-1856666promoter 内 454-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1860202-1861492(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr02G003831 Chr02 NC_080388.1:59949601-59949612promoter 内 402-413 bp + 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 59953200-59954266(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr01G004900 Chr01 NC_080387.1:67068276-67068287promoter 内 199-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 67072078-67072761(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr01G005360 Chr01 NC_080387.1:70826552-70826563promoter 内 162-173 bp + 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 70830391-70831054(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr03G003974 Chr03 NC_080389.1:58762968-58762979promoter 内 32-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 58766937-58772361(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCCGACGTGGG
SmilChr04G001399 Chr04 NC_080390.1:22779819-22779830promoter 内 30-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 22775380-22775859(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTTCACGTGGC
SmilChr03G003726 Chr03 NC_080389.1:56283277-56283288promoter 内 4-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56287274-56287975(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr02G003231 Chr02 NC_080388.1:53584434-53584445promoter 内 3707-3718 bp + 283 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 53579680-53584151(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGC
SmilChr02G001310 Chr02 NC_080388.1:24339707-24339718promoter 内 3706-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 24340002-24340595(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTT
SmilChr02G002867 Chr02 NC_080388.1:48844642-48844653promoter 内 3464-3475 bp - 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 48826093-48844116(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTA
SmilChr01G000181 Chr01 NC_080387.1:3131859-3131870promoter 内 3366-3377 bp - 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 3129296-3131235(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTGAC
SmilChr01G003488 Chr01 NC_080387.1:53428061-53428072promoter 内 3228-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 53422592-53427299(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGTGACGTGGA
SmilChr04G002327 Chr04 NC_080390.1:37577825-37577836promoter 内 2919-2930 bp + 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 37578907-37584645(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GATTGACGTGGG
SmilChr04G002296 Chr04 NC_080390.1:37218782-37218793promoter 内 2831-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 37219952-37224381(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTT
SmilChr04G001858 Chr04 NC_080390.1:30266298-30266309promoter 内 2627-2638 bp - 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 30267672-30268295(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTCC
SmilChr02G001311 Chr02 NC_080388.1:24339707-24339718promoter 内 2130-2141 bp + 1860 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 24341578-24343361(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTT
SmilChr01G000182 Chr01 NC_080387.1:3131859-3131870promoter 内 2046-2057 bp - 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 3133814-3136631(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGGA
SmilChr03G003584 Chr03 NC_080389.1:54480613-54480624promoter 内 1353-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 54476504-54477976(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGTGACGTGGA