转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 48 / 139 下载 TSV

上一页 48 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001811 Chr03 NC_080389.1:24725520-24725531promoter 内 93-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 24729428-24731395(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACAG
SmilChr01G005685 Chr01 NC_080387.1:73117146-73117157promoter 内 82-93 bp - 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 73109795-73113238(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTGACGTGGA
SmilChr01G005373 Chr01 NC_080387.1:70952866-70952877promoter 内 78-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 70956789-70962209(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTGACGTGGT
SmilChr01G003583 Chr01 NC_080387.1:54395517-54395528promoter 内 3988-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54395530-54401672(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCACTC
SmilChr02G005583 Chr02 NC_080388.1:75651842-75651853promoter 内 3933-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 75650735-75651785(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTA
SmilChr04G001696 Chr04 NC_080390.1:28069306-28069317promoter 内 3921-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 28066110-28069237(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAC
SmilChr03G000696 Chr03 NC_080389.1:7769416-7769427promoter 内 3880-3891 bp + 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7763238-7769306(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGCA
SmilChr02G000491 Chr02 NC_080388.1:6740845-6740856promoter 内 3663-3674 bp + 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 6738437-6740518(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGG
SmilChr03G003458 Chr03 NC_080389.1:52962694-52962705promoter 内 3597-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 52963098-52968142(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGCA
SmilChr03G002383 Chr03 NC_080389.1:37616428-37616439promoter 内 3567-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37615262-37616005(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATGC
SmilChr04G000693 Chr04 NC_080390.1:8080951-8080962promoter 内 3559-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8077173-8080520(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGCA
SmilChr01G002665 Chr01 NC_080387.1:44882797-44882808promoter 内 3481-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44877499-44882288(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCATGACGTGGA
SmilChr01G000040 Chr01 NC_080387.1:638874-638885promoter 内 3438-3449 bp - 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 635623-638322(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGG
SmilChr04G002222 Chr04 NC_080390.1:35910012-35910023promoter 内 3429-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35906714-35909451(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGG
SmilChr01G002014 Chr01 NC_080387.1:35691513-35691524promoter 内 3342-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35689427-35690865(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTGACGTGCG
SmilChr02G005375 Chr02 NC_080388.1:74427186-74427197promoter 内 3245-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74427942-74429920(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGG
SmilChr01G001829 Chr01 NC_080387.1:33232063-33232074promoter 内 3216-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 33227865-33231289(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGAGACGTGGG
SmilChr01G004743 Chr01 NC_080387.1:65610881-65610892promoter 内 3179-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65611703-65613208(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAATG
SmilChr01G000741 Chr01 NC_080387.1:16421078-16421089promoter 内 3156-3167 bp + 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16421923-16422717(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTGAC
SmilChr03G003851 Chr03 NC_080389.1:57632798-57632809promoter 内 3079-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57633720-57637407(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACTG
SmilChr04G000979 Chr04 NC_080390.1:13181609-13181620promoter 内 3072-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13182538-13187262(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGTGACGTGGA
SmilChr01G002171 Chr01 NC_080387.1:37803525-37803536promoter 内 3002-3013 bp + 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37804524-37808319(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTCGT
SmilChr03G001321 Chr03 NC_080389.1:15466182-15466193promoter 内 2964-2975 bp + 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 15463229-15465156(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCACAC
SmilChr01G004742 Chr01 NC_080387.1:65610881-65610892promoter 内 2929-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65603892-65609820(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGG
SmilChr04G000482 Chr04 NC_080390.1:5215519-5215530promoter 内 2900-2911 bp - 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 5216620-5220529(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAC
SmilChr01G005983 Chr01 NC_080387.1:75477194-75477205promoter 内 2848-2859 bp - 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 75478347-75479513(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAG
SmilChr04G000778 Chr04 NC_080390.1:9529743-9529754promoter 内 2846-2857 bp + 1144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9524829-9528599(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAC
SmilChr02G001816 Chr02 NC_080388.1:33025422-33025433promoter 内 2810-2821 bp + 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 33020235-33024242(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAC
SmilChr04G000023 Chr04 NC_080390.1:257715-257726promoter 内 2773-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 258943-263908(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAG
SmilChr01G000667 Chr01 NC_080387.1:14824359-14824370promoter 内 2735-2746 bp + 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14820548-14823104(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCT
SmilChr04G000694 Chr04 NC_080390.1:8125361-8125372promoter 内 2724-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8123065-8124095(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCACAC
SmilChr01G005982 Chr01 NC_080387.1:75477194-75477205promoter 内 2716-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 75473032-75475920(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTTGACGTGGG
SmilChr03G001427 Chr03 NC_080389.1:16904668-16904679promoter 内 2643-2654 bp - 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16906026-16907941(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCACAC
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54658901-54658912promoter 内 2635-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54660267-54661448(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCA
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39907325-39907336promoter 内 2473-2484 bp + 1517 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39908853-39912236(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTGACGTGGA
SmilChr04G000364 Chr04 NC_080390.1:3656285-3656296promoter 内 2436-2447 bp - 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 3654240-3654731(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTA
SmilChr03G001394 Chr03 NC_080389.1:16538002-16538013promoter 内 2430-2441 bp + 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16539573-16545270(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGAGACGTGGA
SmilChr05G000169 Chr05 NC_080391.1:1340525-1340536promoter 内 2412-2423 bp - 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1335060-1338947(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGAAGACGTGGG
SmilChr04G001327 Chr04 NC_080390.1:21411282-21411293promoter 内 2383-2394 bp + 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 21405779-21409675(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCA
SmilChr02G005271 Chr02 NC_080388.1:73792031-73792042promoter 内 2378-2389 bp - 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 73786059-73790419(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGTGACGTGGA
SmilChr01G004884 Chr01 NC_080387.1:66908117-66908128promoter 内 2282-2293 bp + 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 66909836-66914661(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGT
SmilChr01G005694 Chr01 NC_080387.1:73223662-73223673promoter 内 2282-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 73216336-73221954(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGG
SmilChr01G000742 Chr01 NC_080387.1:16421078-16421089promoter 内 2280-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16422799-16423392(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTGAC
SmilChr04G000148 Chr04 NC_080390.1:1295477-1295488promoter 内 2226-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1297252-1299763(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTA
SmilChr02G005161 Chr02 NC_080388.1:72954559-72954570promoter 内 2217-2228 bp - 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72956343-72960922(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATGG
SmilChr04G002492 Chr04 NC_080390.1:39814790-39814801promoter 内 2100-2111 bp + 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39811475-39812900(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAG
SmilChr04G002309 Chr04 NC_080390.1:37394305-37394316promoter 内 2087-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37390072-37392402(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACAG
SmilChr04G000975 Chr04 NC_080390.1:13076383-13076394promoter 内 2084-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13078300-13079759(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTGAC
SmilChr04G002518 Chr04 NC_080390.1:40210894-40210905promoter 内 2075-2086 bp + 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40207582-40208979(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCAAAG
SmilChr04G002938 Chr04 NC_080390.1:45607934-45607945promoter 内 2033-2044 bp - 1957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45602644-45605977(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTA