转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 5 / 152 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002552 Chr01 NC_080387.1:43616098-43616116promoter 内 3192-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43616907-43618214(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACAAAAGTGGTTGGAGTGG
SmilChr03G004712 Chr03 NC_080389.1:64375951-64375969promoter 内 2982-3000 bp - 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 64372608-64374950(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAACTCCAACCACCTTAAG
SmilChr03G003028 Chr03 NC_080389.1:47204869-47204887promoter 内 2869-2887 bp - 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 47200697-47203755(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCACCAACCACCCCCAC
SmilChr03G000605 Chr03 NC_080389.1:6692950-6692968promoter 内 2493-2511 bp - 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6689380-6691460(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTCTTCAACCACCACCAT
SmilChr01G004250 Chr01 NC_080387.1:60801440-60801458promoter 内 2334-2352 bp - 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60798950-60799791(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCCCCAACCACCGGTCC
SmilChr04G002475 Chr04 NC_080390.1:39545503-39545521promoter 内 2132-2150 bp - 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39547372-39550843(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTGAGGTGGTTGTGGGAG
SmilChr02G000299 Chr02 NC_080388.1:3769375-3769393promoter 内 1960-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3771416-3774441(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGAGAAGTGGTTGAGGGAG
SmilChr05G000445 Chr05 NC_080391.1:3388864-3388882promoter 内 1712-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3379568-3386593(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAATCCCAACCACCTGCAT
SmilChr04G002501 Chr04 NC_080390.1:39960192-39960210promoter 内 1280-1298 bp - 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39962913-39966362(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTGAGGTGGTTGTGGGAG
SmilChr01G004251 Chr01 NC_080387.1:60801440-60801458promoter 内 1211-1229 bp - 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60804230-60806045(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGACCGGTGGTTGGGGGTG
SmilChr01G004717 Chr01 NC_080387.1:65373178-65373196promoter 内 163-181 bp + 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 65377016-65378790(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AACTCCCAACCACTTTTGC
SmilChr03G000604 Chr03 NC_080389.1:6692950-6692968promoter 内 93-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6687924-6689060(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTCTTCAACCACCACCAT
SmilChr03G001199 Chr03 NC_080389.1:13827555-13827573promoter 内 52-70 bp + 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13831504-13832646(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTCTTCAACCACCACCAT
SmilChr04G003258 Chr04 NC_080390.1:49302155-49302173promoter 内 3618-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 7 49301026-49301790(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAATG
SmilChr04G003256 Chr04 NC_080390.1:49302155-49302173promoter 内 2651-2669 bp + 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 7 49299723-49300823(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAATG
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24935949-24935967promoter 内 2335-2353 bp + 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 7 24933517-24934301(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAATG
SmilChr04G002209 Chr04 NC_080390.1:35757507-35757525promoter 内 2335-2353 bp + 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 35755075-35755859(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAATG
SmilChr02G004350 Chr02 NC_080388.1:65759091-65759109promoter 内 2017-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 65761075-65764167(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGATGGTGGTTGAGGCCA
SmilChr03G001626 Chr03 NC_080389.1:20916927-20916945promoter 内 2757-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 20918171-20918276(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCCTACCAACCACCTCAAC
SmilChr01G002083 Chr01 NC_080387.1:36777070-36777088promoter 内 2083-2101 bp + 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 36770893-36775170(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGATGGTAGTTGGAAGGG
SmilChr03G000007 Chr03 NC_080389.1:95020-95038promoter 内 2342-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 90718-93379(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCGCCTCAACCACCTTCCA
SmilChr03G002752 Chr03 NC_080389.1:43750094-43750112promoter 内 561-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 43741341-43746672(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAGGAAGTGGTTGGAGGCT
SmilChr02G005462 Chr02 NC_080388.1:74929730-74929748promoter 内 400-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 74921594-74926147(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGGGCATA
SmilChr04G001761 Chr04 NC_080390.1:28931838-28931856promoter 内 359-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 28935480-28935551(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGCCTCCAACCACCACAAC
SmilChr03G001727 Chr03 NC_080389.1:23221440-23221458promoter 内 3280-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 23217959-23220737(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGCCTCAACCACCATTCT
SmilChr05G002546 Chr05 NC_080391.1:28501978-28501996promoter 内 3147-3165 bp - 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28497621-28501142(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGTTTCAACCACCATCGC
SmilChr03G001728 Chr03 NC_080389.1:23221440-23221458promoter 内 2890-2908 bp - 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 23222551-23224466(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGAATGGTGGTTGAGGCGG
SmilChr01G000165 Chr01 NC_080387.1:2731578-2731596promoter 内 1800-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2733779-2735810(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTCCCCCAACCACCAGCAG
SmilChr01G006047 Chr01 NC_080387.1:75968286-75968304promoter 内 1447-1465 bp + 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 75970840-75976116(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGCCACCAACCACCTCCCT
SmilChr02G001391 Chr02 NC_080388.1:26408405-26408423promoter 内 1198-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 26402064-26405620(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTTTCCCAACCACCCCCAT
SmilChr01G006030 Chr01 NC_080387.1:75848529-75848547promoter 内 1179-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 75845074-75845725(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGGCCCAACCACCTTCCT
SmilChr04G000759 Chr04 NC_080390.1:9262210-9262228promoter 内 803-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 9256773-9259030(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGCTCCAACCGCCTCCCC
SmilChr04G003541 Chr04 NC_080390.1:51759879-51759897promoter 内 201-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51763679-51768482(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCCTCCCAACCACCACTAT
SmilChr01G000118 Chr01 NC_080387.1:2033315-2033333promoter 内 3849-3867 bp + 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 6 2032181-2033181(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAACG
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4462928-4462946promoter 内 2919-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 6 4460922-4461864(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAACG
SmilChr01G000117 Chr01 NC_080387.1:2033315-2033333promoter 内 2734-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 6 2031059-2032066(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAGGTGGTTGAAAACG
SmilChr03G001994 Chr03 NC_080389.1:29426539-29426557promoter 内 541-559 bp - 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 5 29419250-29423097(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTACCCCAACCACCCAACC
SmilChr03G003087 Chr03 NC_080389.1:47916186-47916204promoter 内 2106-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 47914238-47914309(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTGGGTGGTTGGAGCGG
SmilChr01G002363 Chr01 NC_080387.1:40784472-40784490promoter 内 1897-1915 bp + 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 40781386-40782386(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTGGGTGGTTGGGGTGG
SmilChr03G003086 Chr03 NC_080389.1:47916186-47916204promoter 内 1871-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 47912099-47914074(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTGGGTGGTTGGAGCGG
SmilChr02G004725 Chr02 NC_080388.1:69502765-69502783promoter 内 1743-1761 bp + 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 69497302-69500525(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGGTGGTGGTTGAAGCAG
SmilChr01G001946 Chr01 NC_080387.1:34680826-34680844promoter 内 1621-1639 bp + 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 34683206-34685403(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCCCAACCACCCAATC
SmilChr03G002443 Chr03 NC_080389.1:38825923-38825941promoter 内 1030-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 38828894-38831374(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCTCAACCACCGCCCT
SmilChr01G002362 Chr01 NC_080387.1:40784472-40784490promoter 内 267-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 40777094-40780756(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTGGGTGGTTGGGGTGG
SmilChr04G001336 Chr04 NC_080390.1:21583239-21583257promoter 内 3962-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 21583278-21586202(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACCCCCAACCACCCCCAA
SmilChr05G000470 Chr05 NC_080391.1:3546237-3546255promoter 内 3497-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 3546741-3549984(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGAAAGGTGGTTGGACGGT
SmilChr02G002548 Chr02 NC_080388.1:44340541-44340559promoter 内 3251-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 44337856-44339809(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGTGAGGTGGTTGAGAGCG
SmilChr01G004565 Chr01 NC_080387.1:63723841-63723859promoter 内 2991-3009 bp + 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 63722107-63722849(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTTGGTGGTTGGAGTGG
SmilChr05G002628 Chr05 NC_080391.1:29619132-29619150promoter 内 1745-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 29614754-29616894(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTGCTTCAACCACCACCAT
SmilChr04G001335 Chr04 NC_080390.1:21573760-21573778promoter 内 3962-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 21573799-21576723(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACCCCCAACCACCCCCAA