转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 5 / 130 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000408 Chr01 NC_080387.1:8333705-8333717promoter 内 1602-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 8329720-8331318(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAGGCATATTCC
SmilChr02G001802 Chr02 NC_080388.1:32875456-32875468promoter 内 2701-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 5 32876756-32879335(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGCGAATATTCC
SmilChr02G001344 Chr02 NC_080388.1:25047662-25047674promoter 内 2430-2442 bp + 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 5 25039731-25046103(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTTC
SmilChr02G004116 Chr02 NC_080388.1:63455639-63455651promoter 内 2230-2242 bp - 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 4 63457410-63457976(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTTC
SmilChr03G001714 Chr03 NC_080389.1:22955844-22955856promoter 内 561-573 bp - 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 4 22949890-22952416(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAGGCATATTCC
SmilChr01G004790 Chr01 NC_080387.1:66119383-66119395promoter 内 2885-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 66120499-66122980(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr02G001439 Chr02 NC_080388.1:27082039-27082051promoter 内 2532-2544 bp - 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 27075764-27080582(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr01G004791 Chr01 NC_080387.1:66149244-66149256promoter 内 1939-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 66151306-66153316(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr01G003250 Chr01 NC_080387.1:51216759-51216771promoter 内 1204-1216 bp + 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 51219556-51221377(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATTCC
SmilChr02G001440 Chr02 NC_080388.1:27082039-27082051promoter 内 811-823 bp - 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 27085229-27088122(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTTC
SmilChr02G002790 Chr02 NC_080388.1:47953913-47953925promoter 内 748-760 bp + 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 47957166-47958823(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATTCG
SmilChr02G004670 Chr02 NC_080388.1:69059402-69059414promoter 内 599-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 69053031-69056012(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTTC
SmilChr02G003911 Chr02 NC_080388.1:61200631-61200643promoter 内 3438-3450 bp + 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 61195543-61200080(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTCT
SmilChr01G004738 Chr01 NC_080387.1:65567830-65567842promoter 内 3416-3428 bp + 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 65563100-65567257(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTTC
SmilChr01G004396 Chr01 NC_080387.1:62111429-62111441promoter 内 3157-3169 bp - 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 62112273-62113970(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCTCCC
SmilChr03G001453 Chr03 NC_080389.1:17355209-17355221promoter 内 2562-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 17356648-17361096(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr01G001730 Chr01 NC_080387.1:31854455-31854467promoter 内 2530-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 31855926-31860250(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr02G003345 Chr02 NC_080388.1:54679149-54679161promoter 内 1413-1425 bp + 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 54672454-54676573(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCTGAT
SmilChr03G001458 Chr03 NC_080389.1:17411471-17411483promoter 内 1402-1414 bp + 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 17414070-17422471(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTCG
SmilChr02G003347 Chr02 NC_080388.1:54679149-54679161promoter 内 899-911 bp + 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 54682251-54684804(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATTCC
SmilChr02G004747 Chr02 NC_080388.1:69682810-69682822promoter 内 792-804 bp + 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 69674212-69679613(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCTCCC
SmilChr02G004901 Chr02 NC_080388.1:71014457-71014469promoter 内 24-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 71018434-71021100(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATTCC
SmilChr03G000771 Chr03 NC_080389.1:8808931-8808943promoter 内 3781-3793 bp - 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 8809151-8810054(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCTGTT
SmilChr02G001748 Chr02 NC_080388.1:32074263-32074275promoter 内 3735-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 32072280-32074009(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AACAGCATATTCC
SmilChr02G004784 Chr02 NC_080388.1:70017484-70017496promoter 内 2887-2899 bp - 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70015359-70016382(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATGGCATATTCC
SmilChr02G004785 Chr02 NC_080388.1:70017484-70017496promoter 内 2880-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70018605-70021442(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCCATT
SmilChr03G000773 Chr03 NC_080389.1:8808931-8808943promoter 内 157-169 bp - 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 8812775-8814487(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCTGTT
SmilChr02G005184 Chr02 NC_080388.1:73148521-73148533promoter 内 2281-2293 bp + 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 73145483-73146813(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCTGTG
SmilChr01G005459 Chr01 NC_080387.1:71617276-71617288promoter 内 750-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 71609114-71614037(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCCGAATATTCC
SmilChr01G001940 Chr01 NC_080387.1:34607320-34607332promoter 内 2310-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 34587467-34605641(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCGGCATATTCC
SmilChr02G003655 Chr02 NC_080388.1:57935799-57935811promoter 内 1089-1101 bp + 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 57938711-57941795(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAAGAATATTCC
SmilChr02G000042 Chr02 NC_080388.1:556534-556546promoter 内 528-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 548685-553073(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CACAGAATATTCC
SmilChr01G005460 Chr01 NC_080387.1:71617276-71617288promoter 内 3940-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 71615057-71617227(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCCGAATATTCC
SmilChr02G000934 Chr02 NC_080388.1:16266851-16266863promoter 内 3369-3381 bp - 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 16267483-16270555(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTTTT
SmilChr01G001741 Chr01 NC_080387.1:32090995-32091007promoter 内 2725-2737 bp - 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 32092271-32093782(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCCCCA
SmilChr02G004881 Chr02 NC_080388.1:70900588-70900600promoter 内 2296-2308 bp - 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 70902293-70903796(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATTCCCCA
SmilChr01G006193 Chr01 NC_080387.1:77544830-77544842promoter 内 1918-1930 bp - 2071 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 77540519-77542759(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATCCC
SmilChr01G003280 Chr01 NC_080387.1:51489761-51489773promoter 内 1467-1479 bp + 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 51492295-51495595(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCGGCATATTCC
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SmilChr01G000185 Chr01 NC_080387.1:3167138-3167150promoter 内 908-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 3170231-3177775(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATCCC
SmilChr02G003606 Chr02 NC_080388.1:57313548-57313560promoter 内 885-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 57304569-57310444(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGACGCATATTCC
SmilChr03G000278 Chr03 NC_080389.1:3166348-3166360promoter 内 672-684 bp - 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 3160443-3163031(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAAGAATATTCC
SmilChr02G003673 Chr02 NC_080388.1:58105427-58105439promoter 内 3707-3719 bp - 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 58104390-58105145(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCGGCATATTCC
SmilChr01G002079 Chr01 NC_080387.1:36742082-36742094promoter 内 3612-3624 bp + 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 36742471-36743140(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCGGCATATTCC
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SmilChr01G003720 Chr01 NC_080387.1:55525221-55525233promoter 内 1454-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 55527768-55530226(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCCGCT
SmilChr02G001816 Chr02 NC_080388.1:33027649-33027661promoter 内 582-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 33020235-33024242(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCTTCT
SmilChr03G000459 Chr03 NC_080389.1:4909258-4909270promoter 内 430-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 4902541-4905699(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATCCC
SmilChr01G000875 Chr01 NC_080387.1:18621570-18621582promoter 内 332-344 bp - 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 18625239-18626543(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCCGCT