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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 50 / 152 下载 TSV

上一页 50 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002128 Chr01 NC_080387.1:37280605-37280623promoter 内 1093-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 37283513-37294618(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAAAAATGGTTGGGGCAG
SmilChr02G001932 Chr02 NC_080388.1:34736310-34736328promoter 内 998-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 34739313-34740095(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGGGTGGTGGTTGGTCTCG
SmilChr03G000915 Chr03 NC_080389.1:10473956-10473974promoter 内 875-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10469068-10470848(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGTATGTGGTTGGCAGAA
SmilChr04G000437 Chr04 NC_080390.1:4624902-4624920promoter 内 869-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 4628034-4669251(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGGCAGTGGTTGTGGGTG
SmilChr01G005148 Chr01 NC_080387.1:69262228-69262246promoter 内 865-883 bp + 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 69257401-69259110(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTTTAGTGGTTGAGGGTT
SmilChr02G001764 Chr02 NC_080388.1:32372465-32372483promoter 内 760-778 bp + 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32375706-32377534(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATGCTCAACCACTATTCC
SmilChr02G001734 Chr02 NC_080388.1:31864912-31864930promoter 内 728-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31868185-31870376(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGGGGATGGTTGGGGGTG
SmilChr02G003537 Chr02 NC_080388.1:56514631-56514649promoter 内 698-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56517934-56519916(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAGAAAGTGGTTGGCATTC
SmilChr05G000536 Chr05 NC_080391.1:4115613-4115631promoter 内 643-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 4109259-4112273(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATTCACAACCACAACCCC
SmilChr03G001606 Chr03 NC_080389.1:20413502-20413520promoter 内 634-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 20407165-20410153(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACGGTGGTGGTTGTTGGAG
SmilChr03G004344 Chr03 NC_080389.1:61724545-61724563promoter 内 557-575 bp - 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 61727989-61734910(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATCAAAGTGGTTGGTGAAT
SmilChr03G004452 Chr03 NC_080389.1:62639664-62639682promoter 内 546-564 bp + 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 62643119-62645997(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTTCTCAACCACCCTACA
SmilChr04G001116 Chr04 NC_080390.1:16014858-16014876promoter 内 507-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16009970-16011382(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAATCCCCACCACCTTCCC
SmilChr02G003884 Chr02 NC_080388.1:60917455-60917473promoter 内 496-514 bp - 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60908928-60913968(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACCATCCAACCACTTTATT
SmilChr02G001609 Chr02 NC_080388.1:29953197-29953215promoter 内 338-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29956860-29957405(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTTAGGTGGTTGAGCTTC
SmilChr02G001530 Chr02 NC_080388.1:28552084-28552102promoter 内 299-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 28555786-28558459(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGTTTGTGGTTGGAGTTT
SmilChr02G001927 Chr02 NC_080388.1:34679435-34679453promoter 内 269-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 34683167-34686374(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTCTTCAACCACATCATA
SmilChr01G004745 Chr01 NC_080387.1:65631614-65631632promoter 内 209-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 65626950-65627840(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTGGAGTGGTTGGCAATA
SmilChr02G004544 Chr02 NC_080388.1:68005712-68005730promoter 内 157-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 67993430-68001886(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGAGGGTGGTTGCAAATT
SmilChr01G005187 Chr01 NC_080387.1:69582642-69582660promoter 内 138-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 69586505-69589186(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GACCTGCAACCACCTATGT
SmilChr05G002610 Chr05 NC_080391.1:29354831-29354849promoter 内 135-153 bp + 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29358697-29365128(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAATCCCCACCACCTTCCC
SmilChr03G001292 Chr03 NC_080389.1:15122195-15122213promoter 内 114-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15126082-15131174(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTGAAGGTGGTTGGTCGAA
SmilChr01G000813 Chr01 NC_080387.1:17534662-17534680promoter 内 105-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17538558-17561262(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTCTTCAACCACTTTACA
SmilChr04G002725 Chr04 NC_080390.1:42863407-42863425promoter 内 94-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 42853277-42859518(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AACGCCCAACCACCCGCTG
SmilChr05G002092 Chr05 NC_080391.1:21901026-21901044promoter 内 6-24 bp + 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 21894655-21897049(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTGCAAGTGGTTGGGTTTG
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SmilChr03G000212 Chr03 NC_080389.1:2470834-2470852promoter 内 2733-2751 bp - 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 4 2472102-2472657(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTGGGTGGTTGGATGGT
SmilChr05G002105 Chr05 NC_080391.1:22062654-22062672promoter 内 3620-3638 bp - 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 22063035-22064258(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAGTGGTGGTTGTGCATG
SmilChr02G000653 Chr02 NC_080388.1:9880144-9880162promoter 内 3095-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 9875624-9879256(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGGTGGTGGTTGTTGGCA
SmilChr01G001944 Chr01 NC_080387.1:34630120-34630138promoter 内 3012-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 34622560-34629149(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGCCAACAACCACCACCCT
SmilChr02G003794 Chr02 NC_080388.1:59588738-59588756promoter 内 2890-2908 bp + 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 59589849-59591916(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACCATCCAACCACCCAGCC
SmilChr04G002917 Chr04 NC_080390.1:45367162-45367180promoter 内 2850-2868 bp + 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 45368313-45368873(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTCTCAACCACTTCAAA
SmilChr01G002757 Chr01 NC_080387.1:45912025-45912043promoter 内 2007-2025 bp - 1976 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 45909943-45910049(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCTTCCCAACCACAAAGGT
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SmilChr03G002651 Chr03 NC_080389.1:42177038-42177056promoter 内 539-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 42171587-42173594(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GACTAGGTGGTTGTGCAAG
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SmilChr01G002459 Chr01 NC_080387.1:42230344-42230362promoter 内 3686-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 42230659-42233117(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTCTCAACCACTTCAAA
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SmilChr01G003119 Chr01 NC_080387.1:50004584-50004602promoter 内 3610-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 50002361-50004211(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATTCTCAACCACTTCAAA
SmilChr03G002714 Chr03 NC_080389.1:43100269-43100287promoter 内 3477-3495 bp + 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 43097783-43099763(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGGTTGTGGTTGTGGTTG
SmilChr02G002839 Chr02 NC_080388.1:48513553-48513571promoter 内 3422-3440 bp + 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 48514132-48515581(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTGCACAACCACCTAGTC
SmilChr01G001348 Chr01 NC_080387.1:26750885-26750903promoter 内 3405-3423 bp - 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 26751481-26755073(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGGTGGTGGTTGTTGGCA
SmilChr03G002751 Chr03 NC_080389.1:43736599-43736617promoter 内 3382-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 43737218-43741245(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTCCCCAACCACTGTAGA
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SmilChr04G002084 Chr04 NC_080390.1:33601763-33601781promoter 内 2865-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 33598622-33600645(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGCCAACAACCACCACCCT
SmilChr01G003674 Chr01 NC_080387.1:55176012-55176030promoter 内 2819-2837 bp + 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 55172598-55174848(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTGGGTGGTTGGATGAT
SmilChr05G001618 Chr05 NC_080391.1:14954923-14954941promoter 内 2765-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 14950543-14953705(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GACTAGGTGGTTGTGCAAG
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