转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 51 / 135 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001139 Chr03 NC_080389.1:13120870-13120884promoter 内 1476-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 13116341-13118359(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGGATAAGATTTTA
SmilChr02G002450 Chr02 NC_080388.1:42758431-42758445promoter 内 1445-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42755311-42755889(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGCCAAT
SmilChr01G002648 Chr01 NC_080387.1:44809577-44809591promoter 内 1287-1301 bp - 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 44802533-44806877(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCTTCATTATCCTC
SmilChr01G001349 Chr01 NC_080387.1:26768324-26768338promoter 内 1205-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26756632-26765542(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTGCCTTATCCCA
SmilChr01G004122 Chr01 NC_080387.1:59726217-59726231promoter 内 1194-1208 bp + 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 59729024-59731585(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAATTCATTATCCTC
SmilChr01G000217 Chr01 NC_080387.1:3796543-3796557promoter 内 1021-1035 bp + 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3792740-3793577(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAAATAT
SmilChr03G001817 Chr03 NC_080389.1:24843219-24843233promoter 内 1013-1027 bp - 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24837738-24840245(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TACCTCCTTATCTGC
SmilChr01G004120 Chr01 NC_080387.1:59726217-59726231promoter 内 987-1001 bp + 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 59723147-59723217(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATGAATTG
SmilChr02G002447 Chr02 NC_080388.1:42702925-42702939promoter 内 971-985 bp - 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42698713-42699909(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCGGCCCTTATCCAC
SmilChr01G004151 Chr01 NC_080387.1:60038357-60038371promoter 内 946-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 60041412-60047436(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTACGTTATCCTT
SmilChr03G002275 Chr03 NC_080389.1:35917709-35917723promoter 内 867-881 bp - 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35913199-35914589(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAGATCCTTATCATT
SmilChr01G001405 Chr01 NC_080387.1:27671205-27671219promoter 内 847-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 27662126-27668065(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTCGTCGTTATCCTC
SmilChr03G002050 Chr03 NC_080389.1:31050374-31050388promoter 内 802-816 bp + 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 31041157-31047189(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAGATAAGGATTCG
SmilChr02G000840 Chr02 NC_080388.1:14234588-14234602promoter 内 644-658 bp - 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 14237945-14239455(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAAATAA
SmilChr01G005594 Chr01 NC_080387.1:72570413-72570427promoter 内 561-575 bp - 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 72573853-72574621(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGGCGGAA
SmilChr03G000494 Chr03 NC_080389.1:5287980-5287994promoter 内 421-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5277891-5284414(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATATTATC
SmilChr01G004905 Chr01 NC_080387.1:67102725-67102739promoter 内 373-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 67106353-67109520(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAGATAAGGTCACC
SmilChr01G000231 Chr01 NC_080387.1:4290866-4290880promoter 内 329-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4286721-4287208(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATCGCCTTATCTTC
SmilChr01G004342 Chr01 NC_080387.1:61584622-61584636promoter 内 289-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 61588334-61597467(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTCGTCCTTATCTGC
SmilChr01G001612 Chr01 NC_080387.1:30253111-30253125promoter 内 259-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30256853-30259134(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGGACAT
SmilChr01G004150 Chr01 NC_080387.1:60038357-60038371promoter 内 240-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 60028237-60034610(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAACGTAATT
SmilChr01G004998 Chr01 NC_080387.1:68017164-68017178promoter 内 237-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 68020928-68023989(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GACCTTCTTATCCTT
SmilChr02G002588 Chr02 NC_080388.1:45006231-45006245promoter 内 202-216 bp + 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 45000641-45002446(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGCTCAAA
SmilChr03G001856 Chr03 NC_080389.1:25585101-25585115promoter 内 158-172 bp - 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 25588944-25589594(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGAATGA
SmilChr02G003174 Chr02 NC_080388.1:52872589-52872603promoter 内 154-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 52867986-52868756(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCAGATAAGGAATAA
SmilChr01G003199 Chr01 NC_080387.1:50755005-50755019promoter 内 76-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 50758930-50765314(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGGATAAGGATCTA
SmilChr02G003256 Chr02 NC_080388.1:53875346-53875360promoter 内 1-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 53862311-53871360(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAATTA
SmilChr02G004657 Chr02 NC_080388.1:68985320-68985334promoter 内 3289-3303 bp + 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 6 68983438-68984622(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAACAATAAG
SmilChr03G000764 Chr03 NC_080389.1:8737249-8737263promoter 内 3226-3240 bp + 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 8738024-8741270(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCCGTCCTTATCTCC
SmilChr02G000416 Chr02 NC_080388.1:5299588-5299602promoter 内 1862-1876 bp + 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 5301727-5303520(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATCTCCTTATCTCT
SmilChr02G005473 Chr02 NC_080388.1:74985300-74985314promoter 内 1595-1609 bp + 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 74987706-74989538(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATTACCTTATCTCT
SmilChr01G002623 Chr01 NC_080387.1:44503843-44503857promoter 内 3611-3625 bp + 376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 44504233-44507820(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTCCCTTATCCTA
SmilChr02G000807 Chr02 NC_080388.1:13503663-13503677promoter 内 2922-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 13498082-13502598(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGACCAG
SmilChr02G000808 Chr02 NC_080388.1:13540812-13540826promoter 内 2922-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 13535231-13539747(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGACCAG
SmilChr01G000979 Chr01 NC_080387.1:20742068-20742082promoter 内 1869-1883 bp - 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 20744200-20746027(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGTAATT
SmilChr02G000736 Chr02 NC_080388.1:11927517-11927531promoter 内 1563-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 11921131-11925093(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTGTTC
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SmilChr02G004146 Chr02 NC_080388.1:63777315-63777329promoter 内 2108-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 63779208-63782520(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGGAGCT
SmilChr02G002711 Chr02 NC_080388.1:46967605-46967619promoter 内 2065-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 46963126-46965683(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATTACCTTATCTCT
SmilChr03G002572 Chr03 NC_080389.1:40902246-40902260promoter 内 1891-1905 bp - 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40904356-40905561(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGTAATT