转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 53 / 144 下载 TSV

上一页 53 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004828 Chr02 NC_080388.1:70381016-70381028promoter 内 1795-1807 bp - 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70383222-70384193(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTTTTGACTTTT
SmilChr02G003690 Chr02 NC_080388.1:58308435-58308447promoter 内 1775-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58303033-58306221(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TACGTTGACTGCT
SmilChr01G005022 Chr01 NC_080387.1:68203179-68203191promoter 内 1769-1781 bp - 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 68197204-68200959(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACAAC
SmilChr01G004542 Chr01 NC_080387.1:63568884-63568896promoter 内 1757-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63571128-63574750(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACTTT
SmilChr04G000243 Chr04 NC_080390.1:2210108-2210120promoter 内 1711-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2204094-2207830(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTATG
SmilChr01G003373 Chr01 NC_080387.1:52434638-52434650promoter 内 1710-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52436929-52438863(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr02G005235 Chr02 NC_080388.1:73546956-73546968promoter 内 1696-1708 bp - 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73542925-73544663(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAATGGG
SmilChr02G002307 Chr02 NC_080388.1:40696939-40696951promoter 内 1687-1699 bp - 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40693816-40694637(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACAAC
SmilChr01G004704 Chr01 NC_080387.1:65143391-65143403promoter 内 1588-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65145804-65147888(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCTTTGACTTAC
SmilChr04G000623 Chr04 NC_080390.1:7081139-7081151promoter 内 1578-1590 bp - 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7083562-7089291(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTGGTTGACTGTG
SmilChr01G003032 Chr01 NC_080387.1:49355474-49355486promoter 内 1563-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 49357912-49361275(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAACC
SmilChr02G001192 Chr02 NC_080388.1:21898304-21898316promoter 内 1483-1495 bp + 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21893830-21895798(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACGTTT
SmilChr01G002645 Chr01 NC_080387.1:44755188-44755200promoter 内 1446-1458 bp - 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44757743-44763466(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTTTTGACTTTT
SmilChr02G001063 Chr02 NC_080388.1:18933971-18933983promoter 内 1358-1370 bp - 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18936614-18940083(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTGG
SmilChr02G003362 Chr02 NC_080388.1:54754861-54754873promoter 内 1309-1321 bp - 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54744015-54752181(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAATGGG
SmilChr02G005119 Chr02 NC_080388.1:72677327-72677339promoter 内 1282-1294 bp - 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72680046-72684140(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTCAT
SmilChr01G002876 Chr01 NC_080387.1:47343578-47343590promoter 内 1275-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 47346304-47347005(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGTGTTGACTTCG
SmilChr01G002389 Chr01 NC_080387.1:41156997-41157009promoter 内 1271-1283 bp - 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41159727-41162434(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTGTT
SmilChr01G002746 Chr01 NC_080387.1:45766999-45767011promoter 内 1245-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45769755-45771498(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCATTGACTTTG
SmilChr01G005377 Chr01 NC_080387.1:70998106-70998118promoter 内 1195-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70990844-70995312(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAACCC
SmilChr03G001112 Chr03 NC_080389.1:12827090-12827102promoter 内 1192-1204 bp - 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12819542-12824293(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAAGC
SmilChr02G004143 Chr02 NC_080388.1:63766406-63766418promoter 内 1190-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63761396-63763607(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CATAGTCAACATC
SmilChr01G003967 Chr01 NC_080387.1:58124990-58125002promoter 内 1172-1184 bp - 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58127819-58132541(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCATTGACTTTG
SmilChr01G005760 Chr01 NC_080387.1:73704630-73704642promoter 内 1142-1154 bp + 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73700573-73701783(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTTTTGACTTTT
SmilChr02G001328 Chr02 NC_080388.1:24739945-24739957promoter 内 1121-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24742825-24747007(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAAGTCAAAGAC
SmilChr02G005292 Chr02 NC_080388.1:73915495-73915507promoter 内 1074-1086 bp - 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73910972-73912580(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTAGTCAACGAG
SmilChr03G003316 Chr03 NC_080389.1:51398767-51398779promoter 内 1051-1063 bp - 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51401717-51409726(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCTTTGACTTAC
SmilChr02G000201 Chr02 NC_080388.1:2583474-2583486promoter 内 1019-1031 bp + 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2586456-2586910(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCAGTCAACGGG
SmilChr02G000200 Chr02 NC_080388.1:2583474-2583486promoter 内 993-1005 bp + 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2578649-2580478(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr02G005323 Chr02 NC_080388.1:74116161-74116173promoter 内 868-880 bp + 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 74110219-74113040(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr03G002428 Chr03 NC_080389.1:38568184-38568196promoter 内 863-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38571322-38574246(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCAGTCAACGGG
SmilChr01G004515 Chr01 NC_080387.1:63270034-63270046promoter 内 851-863 bp - 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63273184-63275104(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCATTGACTTTG
SmilChr02G001851 Chr02 NC_080388.1:33734735-33734747promoter 内 806-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33737930-33738989(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr04G000606 Chr04 NC_080390.1:6863311-6863323promoter 内 794-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6853578-6860116(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCCTTGACTTTG
SmilChr03G001421 Chr03 NC_080389.1:16829346-16829358promoter 内 757-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 16832590-16834140(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48033936-48033948promoter 内 704-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCTGTTGACTATT
SmilChr03G002604 Chr03 NC_080389.1:41426251-41426263promoter 内 615-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41429637-41432804(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTAGGTCAACGGG
SmilChr02G004144 Chr02 NC_080388.1:63766406-63766418promoter 内 591-603 bp - 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63769816-63769897(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATGTTGACTATG
SmilChr02G005236 Chr02 NC_080388.1:73546956-73546968promoter 内 530-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73550427-73555379(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCATTGACTTTG
SmilChr04G001642 Chr04 NC_080390.1:27351565-27351577promoter 内 513-525 bp + 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 27341801-27348089(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTGAT
SmilChr03G004519 Chr03 NC_080389.1:63262110-63262122promoter 内 501-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63265610-63268258(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACAAA
SmilChr01G004087 Chr01 NC_080387.1:59271906-59271918promoter 内 479-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 59275428-59277249(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAATGCT
SmilChr03G004554 Chr03 NC_080389.1:63512741-63512753promoter 内 381-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63516361-63526829(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTTTTGACTTTT
SmilChr02G004927 Chr02 NC_080388.1:71284204-71284216promoter 内 372-384 bp + 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71287833-71291720(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAACCC
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SmilChr01G004849 Chr01 NC_080387.1:66643535-66643547promoter 内 275-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 66636330-66639821(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAGTTGACTTTC
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SmilChr04G000610 Chr04 NC_080390.1:6900130-6900142promoter 内 226-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6895458-6896367(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CATAGTCAACTGC