Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 54 / 152 下载 TSV

上一页 54 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003969 Chr01 NC_080387.1:58140115-58140133promoter 内 1864-1882 bp + 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 58134832-58137996(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTCAAGTGGTTGAAGAAG
SmilChr04G000385 Chr04 NC_080390.1:3910393-3910411promoter 内 1858-1876 bp - 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3912536-3913039(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTATTGTTGGTTGGAGTCG
SmilChr01G002566 Chr01 NC_080387.1:43769355-43769373promoter 内 1801-1819 bp + 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43764827-43767173(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTGAGGTGGTGGGGGCGA
SmilChr01G001330 Chr01 NC_080387.1:26496504-26496522promoter 内 1771-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 26498734-26500788(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTTCCTCAACCACACCGCC
SmilChr03G002640 Chr03 NC_080389.1:41974305-41974323promoter 内 1598-1616 bp + 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 41969327-41971920(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTGTATTGGTTGGGGATT
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2207301-2207319promoter 内 1536-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAATATGTGGTTGAGGAGT
SmilChr04G000383 Chr04 NC_080390.1:3910393-3910411promoter 内 1467-1485 bp - 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3906747-3907877(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGACTCCAACCAACAATAC
SmilChr01G002571 Chr01 NC_080387.1:43803121-43803139promoter 内 1391-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43795685-43800529(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAGCATGTGGTTGGCAAGG
SmilChr01G001708 Chr01 NC_080387.1:31500460-31500478promoter 内 1389-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 31503072-31504277(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACCTCCCAACCACTGCGCA
SmilChr04G000505 Chr04 NC_080390.1:5508494-5508512promoter 内 1224-1242 bp + 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5511271-5516428(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCACACCAACCACCCAGCC
SmilChr05G002130 Chr05 NC_080391.1:22404966-22404984promoter 内 1176-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22398914-22402159(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATTTTCAACCACTAGTTC
SmilChr05G001339 Chr05 NC_080391.1:11811287-11811305promoter 内 1126-1144 bp - 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11814162-11814671(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTAGAGGTGGTGGAGGAGG
SmilChr04G004175 Chr04 NC_080390.1:56365669-56365687promoter 内 1089-1107 bp - 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56360741-56362775(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTTCTCAACCACTCTACC
SmilChr02G000764 Chr02 NC_080388.1:12449269-12449287promoter 内 883-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12444913-12446169(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AACCTACAACCACCGCAGC
SmilChr02G001144 Chr02 NC_080388.1:20779127-20779145promoter 内 863-881 bp + 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20761415-20776007(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGCGAGTGGTTGAAGGTT
SmilChr03G003332 Chr03 NC_080389.1:51586251-51586269promoter 内 837-855 bp + 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 51589415-51591216(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACAACACAACCACCTCATC
SmilChr01G002389 Chr01 NC_080387.1:41156467-41156485promoter 内 741-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 41159727-41162434(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGTAAAGTGGTTGAAACAT
SmilChr03G000378 Chr03 NC_080389.1:4226338-4226356promoter 内 559-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4229780-4233095(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACAACAGTGGTTGGAAATC
SmilChr03G002055 Chr03 NC_080389.1:31268445-31268463promoter 内 490-508 bp - 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 31271956-31272420(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCTGAGGTTGTTGGAAAGA
SmilChr02G004795 Chr02 NC_080388.1:70150965-70150983promoter 内 473-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 70146692-70147455(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGCGATGTGGTTGAGGGGA
SmilChr01G003425 Chr01 NC_080387.1:52927396-52927414promoter 内 462-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52917001-52923875(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAAATCCAACCACCAAATT
SmilChr03G000236 Chr03 NC_080389.1:2824157-2824175promoter 内 458-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2819595-2820632(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAAAGGTAGTTGAGTGTA
SmilChr01G003785 Chr01 NC_080387.1:56229846-56229864promoter 内 391-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56224761-56226254(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTCTTCAACCACTTGAGA
SmilChr05G002780 Chr05 NC_080391.1:32481113-32481131promoter 内 321-339 bp + 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 32476456-32477451(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTCAAGTGGTTGAAGAAG
SmilChr05G001263 Chr05 NC_080391.1:10759373-10759391promoter 内 286-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10763088-10764175(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGGGTTTTGGTTGGGGCGG
SmilChr01G004811 Chr01 NC_080387.1:66308052-66308070promoter 内 267-285 bp - 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 66311786-66315489(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGAAAAGTGGTTGGATATT
SmilChr01G005007 Chr01 NC_080387.1:68107896-68107914promoter 内 249-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 68111648-68111721(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAACTCCAACCATCTTCAC
SmilChr03G001740 Chr03 NC_080389.1:23496475-23496493promoter 内 193-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 23490541-23492685(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTCTCAACCACATTCCA
SmilChr04G000008 Chr04 NC_080390.1:122251-122269promoter 内 172-190 bp + 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 126080-127625(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TAGAGCCAACCACCCTCGT
SmilChr05G002418 Chr05 NC_080391.1:26701789-26701807promoter 内 171-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 26697171-26697977(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGACTCCAACCAACAATAC
SmilChr03G003458 Chr03 NC_080389.1:52959207-52959225promoter 内 110-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52963098-52968142(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGTGTAGTAGTTGGAAAAG
SmilChr04G000589 Chr04 NC_080390.1:6555594-6555612promoter 内 9-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6559586-6578686(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTGACCAACCACCAAGCC
SmilChr04G000355 Chr04 NC_080390.1:3414930-3414948promoter 内 2634-2652 bp + 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 7 3410233-3413581(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGAAGGTGGTGGGGGTGA
SmilChr04G000356 Chr04 NC_080390.1:3414930-3414948promoter 内 3008-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 6 3413581-3413955(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGAAGGTGGTGGGGGTGA
SmilChr04G003743 Chr04 NC_080390.1:53732606-53732624promoter 内 2444-2462 bp - 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 53726226-53731067(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAACCACAACCACTTATTT
SmilChr01G006200 Chr01 NC_080387.1:77702116-77702134promoter 内 11-29 bp - 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 77690583-77698144(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAAACCCAACCACCAAGCA
SmilChr03G000144 Chr03 NC_080389.1:1576230-1576248promoter 内 3896-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 1576335-1579231(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCACAACCACCCTATG
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1586940-1586958promoter 内 3896-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 1587045-1589941(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCACAACCACCCTATG
SmilChr03G001850 Chr03 NC_080389.1:25432940-25432958promoter 内 3812-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 25427666-25432769(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTGAGGTGGTTGATAAAA
SmilChr03G003827 Chr03 NC_080389.1:57378469-57378487promoter 内 3660-3678 bp + 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 57378810-57384068(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATACTCCAACCAACTTTTG
SmilChr01G001909 Chr01 NC_080387.1:34213155-34213173promoter 内 3653-3671 bp + 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 34211136-34212825(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGGAATGTGGTTGAAGGCA
SmilChr02G003293 Chr02 NC_080388.1:54213304-54213322promoter 内 3614-3632 bp - 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 54206696-54212935(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCATCTCAACCACATACTC
SmilChr02G005248 Chr02 NC_080388.1:73632472-73632490promoter 内 3089-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 73633384-73638666(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGTTCTCAACCACCAGCTA
SmilChr04G003309 Chr04 NC_080390.1:49822538-49822556promoter 内 2873-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 49819436-49821428(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAAGGGTGGTTGAGCACA
SmilChr02G003569 Chr02 NC_080388.1:56854942-56854960promoter 内 2316-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 56856627-56857276(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCGCTCCAACCGCCTTTGA
SmilChr05G000442 Chr05 NC_080391.1:3351307-3351325promoter 内 2261-2279 bp + 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 3353047-3359104(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACTTTCAACCACTTATAA
SmilChr04G003879 Chr04 NC_080390.1:54647424-54647442promoter 内 2141-2159 bp - 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 54642432-54645582(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTCCTCCAACCAATACGTC
SmilChr02G001883 Chr02 NC_080388.1:34159880-34159898promoter 内 1794-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 34152231-34157691(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGATTAGTGGTTGAGATTG
SmilChr02G000117 Chr02 NC_080388.1:1479041-1479059promoter 内 1722-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 1475662-1476780(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGGCGGTGGTTGCCGCCG
SmilChr05G002304 Chr05 NC_080391.1:24900302-24900320promoter 内 1651-1669 bp + 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 24902652-24905557(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGCACACAACCACCCCACC