转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 56 / 121 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000568 Chr05 NC_080391.1:4269082-4269096promoter 内 740-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 4263791-4265835(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACGATCAGATCTGTG
SmilChr02G000606 Chr02 NC_080388.1:8816970-8816984promoter 内 614-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 8820357-8821866(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTAGAGAC
SmilChr02G000750 Chr02 NC_080388.1:12197070-12197084promoter 内 604-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 12192296-12193687(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTAATGTG
SmilChr02G001029 Chr02 NC_080388.1:18215216-18215230promoter 内 482-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 18211138-18211711(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCCCCTTCT
SmilChr02G004406 Chr02 NC_080388.1:66391296-66391310promoter 内 359-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 66385204-66387668(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACAATCAGATCTGTT
SmilChr03G003489 Chr03 NC_080389.1:53458316-53458330promoter 内 110-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 53462207-53466707(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTATGGATCTGAA
SmilChr01G000486 Chr01 NC_080387.1:9932844-9932858promoter 内 3935-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9932910-9934484(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCCATACTT
SmilChr02G003745 Chr02 NC_080388.1:59101664-59101678promoter 内 3801-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 59100565-59101478(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGGGATCTAGATTT
SmilChr04G001160 Chr04 NC_080390.1:17164993-17165007promoter 内 3752-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17161589-17164758(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAGTGAGATCTGAG
SmilChr04G003112 Chr04 NC_080390.1:47681005-47681019promoter 内 3751-3765 bp - 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47679646-47680769(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCTTTTAGATCTGGA
SmilChr03G000833 Chr03 NC_080389.1:9558800-9558814promoter 内 3644-3658 bp - 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9556772-9558457(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTATCTAGATCTACT
SmilChr03G003501 Chr03 NC_080389.1:53636338-53636352promoter 内 3568-3582 bp - 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 53636771-53643349(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTATATTT
SmilChr04G001159 Chr04 NC_080390.1:17155237-17155251promoter 内 3507-3521 bp - 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17151835-17154757(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAGTGAGATCTGAG
SmilChr01G003514 Chr01 NC_080387.1:53751364-53751378promoter 内 3432-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 53751933-53757502(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTGTCGGATCTGAA
SmilChr04G001780 Chr04 NC_080390.1:29218442-29218456promoter 内 3140-3154 bp - 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 29219303-29221123(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGCAAT
SmilChr02G001695 Chr02 NC_080388.1:31240761-31240775promoter 内 2924-2938 bp + 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 31238042-31239698(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCCCACTTC
SmilChr05G000680 Chr05 NC_080391.1:5183079-5183093promoter 内 2864-2878 bp + 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5184216-5184288(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCTCTAGATCTGGT
SmilChr04G001073 Chr04 NC_080390.1:15420407-15420421promoter 内 2712-2726 bp + 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15421696-15422596(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAACGAGATCTGAA
SmilChr01G000628 Chr01 NC_080387.1:14050920-14050934promoter 内 2648-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 14052273-14053478(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGTATGGATCTGAC
SmilChr01G003693 Chr01 NC_080387.1:55295949-55295963promoter 内 2466-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55297484-55299992(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTCGAATC
SmilChr04G001071 Chr04 NC_080390.1:15420407-15420421promoter 内 2466-2480 bp + 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15413781-15418886(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTCGTTAT
SmilChr01G000672 Chr01 NC_080387.1:14867746-14867760promoter 内 2249-2263 bp - 1738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 14864657-14866008(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGATTCCGATCTGAT
SmilChr03G000264 Chr03 NC_080389.1:3055145-3055159promoter 内 2230-2244 bp + 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3056916-3064283(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGAACTAGATCTACC
SmilChr04G000716 Chr04 NC_080390.1:8397897-8397911promoter 内 2150-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 8399748-8401451(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCGAGATCTAATTTC
SmilChr02G004182 Chr02 NC_080388.1:64136013-64136027promoter 内 2081-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 64130316-64134107(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCCAGATCTAAAGGT
SmilChr03G002344 Chr03 NC_080389.1:36980252-36980266promoter 内 2055-2069 bp - 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 36977173-36978320(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTGTGTGGATCTGAT
SmilChr04G003196 Chr04 NC_080390.1:48792552-48792566promoter 内 1990-2004 bp + 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 48794563-48799573(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCAGCTAGATCTCGT
SmilChr01G001197 Chr01 NC_080387.1:24125063-24125077promoter 内 1905-1919 bp - 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 24127159-24128791(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAGTAAC
SmilChr03G001356 Chr03 NC_080389.1:15930606-15930620promoter 内 1884-1898 bp - 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15927053-15928503(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATACTAGATCTCAT
SmilChr02G001859 Chr02 NC_080388.1:33788710-33788724promoter 内 1858-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 33790853-33791013(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAAGCAGATCTGCC
SmilChr05G000681 Chr05 NC_080391.1:5183079-5183093promoter 内 1849-1863 bp + 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5185231-5185303(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCTCTAGATCTGGT
SmilChr04G002423 Chr04 NC_080390.1:38869554-38869568promoter 内 1837-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 38871718-38873046(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGTTCGAGATCTGAT
SmilChr04G001074 Chr04 NC_080390.1:15420407-15420421promoter 内 1735-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15422673-15426627(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAACGAGATCTGAA
SmilChr01G005138 Chr01 NC_080387.1:69170419-69170433promoter 内 1647-1661 bp - 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 69164447-69168079(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAATTTAGATCTTAA
SmilChr03G001368 Chr03 NC_080389.1:16034976-16034990promoter 内 1624-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16031858-16032613(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATACTAGATCTCAT
SmilChr03G000705 Chr03 NC_080389.1:7863549-7863563promoter 内 1459-1473 bp + 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7859246-7861021(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTAGATCTATACCT
SmilChr04G001565 Chr04 NC_080390.1:25947028-25947042promoter 内 1437-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 25949592-25950628(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCTATAGATCTGGA
SmilChr04G000767 Chr04 NC_080390.1:9384775-9384789promoter 内 1435-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9387341-9389181(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACATGTAGATCTAGG
SmilChr03G000373 Chr03 NC_080389.1:4170171-4170185promoter 内 1396-1410 bp + 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4164639-4167580(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTGGGATCTAGTTTC
SmilChr01G002365 Chr01 NC_080387.1:40830682-40830696promoter 内 1361-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 40821774-40828056(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCCCCTTCT
SmilChr01G003766 Chr01 NC_080387.1:56040312-56040326promoter 内 1275-1289 bp + 2712 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 56035765-56037600(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCAAAAGA
SmilChr01G003692 Chr01 NC_080387.1:55295949-55295963promoter 内 1141-1155 bp - 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55288840-55293103(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATTCGAGATCTGAC
SmilChr03G004344 Chr03 NC_080389.1:61725122-61725136promoter 内 1134-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61727989-61734910(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTACAACA
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SmilChr03G003243 Chr03 NC_080389.1:50326834-50326848promoter 内 1126-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50329709-50331573(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGTTTAGATCTATG
SmilChr04G000001 Chr04 NC_080390.1:52644-52658promoter 内 1056-1070 bp + 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 45843-49713(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTAAGATC
SmilChr02G002951 Chr02 NC_080388.1:50059823-50059837promoter 内 992-1006 bp + 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50052333-50056828(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACAGATCTAGGTTT
SmilChr01G005322 Chr01 NC_080387.1:70448145-70448159promoter 内 979-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 70442007-70445137(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAATTAGATCTAAT
SmilChr02G003328 Chr02 NC_080388.1:54537902-54537916promoter 内 972-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54528113-54534887(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGCAAAA
SmilChr02G005151 Chr02 NC_080388.1:72889880-72889894promoter 内 920-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 72886312-72886813(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTCGAATC