转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 58 / 143 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003083 Chr08 NC_080394.1:31056143-31056154promoter 内 1965-1976 bp - 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31046825-31054118(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATA
SmilChr01G003046 Chr01 NC_080387.1:49440964-49440975promoter 内 1639-1650 bp + 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 49443326-49448527(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCGC
SmilChr01G003753 Chr01 NC_080387.1:55908370-55908381promoter 内 1622-1633 bp - 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55910749-55913422(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCTA
SmilChr07G002394 Chr07 NC_080393.1:22313283-22313294promoter 内 1131-1142 bp - 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 22316153-22321037(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAG
SmilChr02G000380 Chr02 NC_080388.1:4775476-4775487promoter 内 789-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4770260-4772275(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTT
SmilChr05G002668 Chr05 NC_080391.1:30167048-30167059promoter 内 765-776 bp + 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30170284-30172952(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGC
SmilChr06G002342 Chr06 NC_080392.1:34074526-34074537promoter 内 677-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 34070740-34071213(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTG
SmilChr07G002517 Chr07 NC_080393.1:23851100-23851111promoter 内 509-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 23854592-23856695(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGAG
SmilChr02G004269 Chr02 NC_080388.1:64910070-64910081promoter 内 412-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 64905743-64906492(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAG
SmilChr01G001634 Chr01 NC_080387.1:30401280-30401291promoter 内 230-241 bp - 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30392990-30397520(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAC
SmilChr02G001363 Chr02 NC_080388.1:25617961-25617972promoter 内 21-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 25607442-25613992(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAG
SmilChr02G003833 Chr02 NC_080388.1:59976091-59976102promoter 内 3727-3738 bp - 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 59974151-59975828(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGGA
SmilChr02G003689 Chr02 NC_080388.1:58283447-58283458promoter 内 3679-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 58283769-58293795(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGGA
SmilChr05G004146 Chr05 NC_080391.1:55400405-55400416promoter 内 3117-3128 bp + 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55401289-55402411(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCTC
SmilChr07G003600 Chr07 NC_080393.1:42075813-42075824promoter 内 2987-2998 bp - 1003 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 42073016-42074810(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCGC
SmilChr03G003855 Chr03 NC_080389.1:57655204-57655215promoter 内 2707-2718 bp + 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57651471-57653921(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr05G002180 Chr05 NC_080391.1:23236548-23236559promoter 内 2123-2134 bp - 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 23238426-23241639(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr05G004145 Chr05 NC_080391.1:55400405-55400416promoter 内 1611-1622 bp + 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55397529-55398026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCCC
SmilChr02G003688 Chr02 NC_080388.1:58283447-58283458promoter 内 1490-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 58274625-58280947(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAGA
SmilChr07G004386 Chr07 NC_080393.1:56417162-56417173promoter 内 683-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56412140-56413855(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAA
SmilChr02G000260 Chr02 NC_080388.1:3333069-3333080promoter 内 154-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 3336916-3346337(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAGA
SmilChr05G001055 Chr05 NC_080391.1:8741931-8741942promoter 内 3917-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8739951-8741858(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr04G001065 Chr04 NC_080390.1:15223570-15223581promoter 内 3911-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 15219369-15223491(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCG
SmilChr07G000942 Chr07 NC_080393.1:6727931-6727942promoter 内 3484-3495 bp - 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6726625-6727425(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGAT
SmilChr02G003871 Chr02 NC_080388.1:60725283-60725294promoter 内 3449-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60725835-60728328(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAGG
SmilChr01G004678 Chr01 NC_080387.1:64872428-64872439promoter 内 3431-3442 bp + 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 64867873-64871869(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr03G000134 Chr03 NC_080389.1:1473790-1473801promoter 内 3329-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1474462-1475690(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGGG
SmilChr05G000145 Chr05 NC_080391.1:1187909-1187920promoter 内 3285-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1184607-1187204(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr02G000726 Chr02 NC_080388.1:11796225-11796236promoter 内 3004-3015 bp + 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 11793787-11795239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGA
SmilChr05G000146 Chr05 NC_080391.1:1187909-1187920promoter 内 2927-2938 bp + 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1188983-1190697(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAA
SmilChr04G002536 Chr04 NC_080390.1:40531379-40531390promoter 内 2881-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40532499-40534077(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr07G002397 Chr07 NC_080393.1:22331312-22331323promoter 内 2509-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 22329484-22329831(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGGG
SmilChr07G000683 Chr07 NC_080393.1:4653519-4653530promoter 内 2422-2433 bp + 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4650202-4651951(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr03G003285 Chr03 NC_080389.1:50902402-50902413promoter 内 2347-2358 bp + 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50899609-50900759(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGA
SmilChr03G003959 Chr03 NC_080389.1:58635315-58635326promoter 内 2270-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58637046-58638175(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGAT
SmilChr07G000881 Chr07 NC_080393.1:6298040-6298051promoter 内 2251-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6299790-6301912(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAA
SmilChr07G001630 Chr07 NC_080393.1:13658302-13658313promoter 内 2026-2037 bp + 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13660277-13664255(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAA
SmilChr02G005079 Chr02 NC_080388.1:72430257-72430268promoter 内 1972-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72421915-72428239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAG
SmilChr07G003394 Chr07 NC_080393.1:36808999-36809010promoter 内 1930-1941 bp - 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36805963-36806939(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCTC
SmilChr05G000764 Chr05 NC_080391.1:5914906-5914917promoter 内 1655-1666 bp + 2335 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5908617-5912571(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr02G000791 Chr02 NC_080388.1:13053507-13053518promoter 内 1534-1545 bp + 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13046149-13051051(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAG
SmilChr05G000144 Chr05 NC_080391.1:1184668-1184679promoter 内 1481-1492 bp + 2509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1181068-1182159(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAC
SmilChr07G003027 Chr07 NC_080393.1:31301902-31301913promoter 内 1478-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 31304425-31307019(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGA
SmilChr07G003034 Chr07 NC_080393.1:31371560-31371571promoter 内 1462-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 31374099-31375480(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGA
SmilChr02G002896 Chr02 NC_080388.1:49237442-49237453promoter 内 1437-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49240006-49243113(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAC
SmilChr05G002647 Chr05 NC_080391.1:29902102-29902113promoter 内 1436-1447 bp - 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29904667-29906354(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCCT
SmilChr02G005588 Chr02 NC_080388.1:75670895-75670906promoter 内 1265-1276 bp + 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75673631-75675457(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAA
SmilChr05G001056 Chr05 NC_080391.1:8741931-8741942promoter 内 1265-1276 bp + 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8744667-8749253(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAA
SmilChr05G000130 Chr05 NC_080391.1:1059482-1059493promoter 内 806-817 bp - 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1053902-1056298(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAA
SmilChr04G001978 Chr04 NC_080390.1:32058498-32058509promoter 内 743-754 bp + 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 32052541-32055251(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCG