转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 58 / 151 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006054 Chr01 NC_080387.1:76019568-76019580promoter 内 2218-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 76021351-76024909(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACGGTAGGTGAT
SmilChr03G000773 Chr03 NC_080389.1:8810838-8810850promoter 内 2064-2076 bp + 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8812775-8814487(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAACGCG
SmilChr01G002715 Chr01 NC_080387.1:45406800-45406812promoter 内 1921-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45408880-45418329(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCGTTAGGTAAG
SmilChr02G002276 Chr02 NC_080388.1:40212977-40212989promoter 内 1889-1901 bp + 2100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40215089-40215653(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTGC
SmilChr01G005637 Chr01 NC_080387.1:72802116-72802128promoter 内 1805-1817 bp + 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72804312-72805047(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTCT
SmilChr04G003890 Chr04 NC_080390.1:54709787-54709799promoter 内 1761-1773 bp + 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54704682-54707559(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTAGT
SmilChr05G000316 Chr05 NC_080391.1:2379315-2379327promoter 内 1720-1732 bp - 2269 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2374217-2377046(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCTTA
SmilChr01G000525 Chr01 NC_080387.1:10706651-10706663promoter 内 1380-1392 bp - 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 10702889-10704042(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTGGA
SmilChr01G005696 Chr01 NC_080387.1:73230435-73230447promoter 内 1248-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 73233188-73241369(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCGTTAGGTAAC
SmilChr02G001311 Chr02 NC_080388.1:24338738-24338750promoter 内 1161-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 24341578-24343361(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTTGG
SmilChr04G000484 Chr04 NC_080390.1:5226172-5226184promoter 内 1134-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 5229039-5240075(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACCATA
SmilChr05G000339 Chr05 NC_080391.1:2535215-2535227promoter 内 1130-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2531032-2532356(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr02G003617 Chr02 NC_080388.1:57448030-57448042promoter 内 1104-1116 bp - 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 57441488-57445145(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTAAC
SmilChr03G002753 Chr03 NC_080389.1:43753382-43753394promoter 内 988-1000 bp - 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43756395-43758734(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATAGTAGGTACA
SmilChr01G005811 Chr01 NC_080387.1:74123699-74123711promoter 内 971-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 74126729-74127211(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAAGTAGGTAGT
SmilChr04G002447 Chr04 NC_080390.1:39190495-39190507promoter 内 883-895 bp + 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 39180055-39187389(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTATG
SmilChr03G002737 Chr03 NC_080389.1:43497706-43497718promoter 内 776-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43500931-43503338(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATAGTAGGTACA
SmilChr01G003976 Chr01 NC_080387.1:58203134-58203146promoter 内 745-757 bp + 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 58197199-58199890(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAGGTAGGTGGT
SmilChr03G002736 Chr03 NC_080389.1:43497706-43497718promoter 内 721-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43490514-43494438(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTATT
SmilChr02G005042 Chr02 NC_080388.1:72148735-72148747promoter 内 635-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72142577-72145381(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTCT
SmilChr02G005044 Chr02 NC_080388.1:72148735-72148747promoter 内 568-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72152168-72164421(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTATG
SmilChr01G005636 Chr01 NC_080387.1:72802116-72802128promoter 内 542-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72796920-72798669(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTATG
SmilChr01G003546 Chr01 NC_080387.1:54042882-54042894promoter 内 535-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54046348-54049957(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAAGTAGGTACA
SmilChr03G003313 Chr03 NC_080389.1:51374643-51374655promoter 内 442-454 bp + 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51370311-51371096(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAAG
SmilChr05G001715 Chr05 NC_080391.1:16419731-16419743promoter 内 373-385 bp - 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 16423359-16426134(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGATGTAGGTAAA
SmilChr04G001320 Chr04 NC_080390.1:21289394-21289406promoter 内 371-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 21283386-21285776(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCACA
SmilChr04G003046 Chr04 NC_080390.1:46991189-46991201promoter 内 236-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 46994954-46995976(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCGTT
SmilChr04G003170 Chr04 NC_080390.1:48323438-48323450promoter 内 227-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 48318661-48319676(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCGTT
SmilChr02G004857 Chr02 NC_080388.1:70721614-70721626promoter 内 166-178 bp + 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 70711405-70717791(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATGTAGGTAAA
SmilChr04G003970 Chr04 NC_080390.1:55165360-55165372promoter 内 33-45 bp + 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55169328-55173066(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCGAC
SmilChr01G005423 Chr01 NC_080387.1:71418613-71418625promoter 内 3812-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 3 71415456-71418436(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAA
SmilChr04G001570 Chr04 NC_080390.1:26024129-26024141promoter 内 3844-3856 bp + 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 26024286-26026852(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr03G000361 Chr03 NC_080389.1:4041806-4041818promoter 内 3672-3684 bp - 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4040456-4041489(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTTA
SmilChr05G001247 Chr05 NC_080391.1:10597603-10597615promoter 内 3589-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 10598015-10601637(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr03G004691 Chr03 NC_080389.1:64285258-64285270promoter 内 3585-3597 bp + 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 64285674-64285745(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTACC
SmilChr04G002619 Chr04 NC_080390.1:41600464-41600476promoter 内 3536-3548 bp + 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 41600929-41605099(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr04G002661 Chr04 NC_080390.1:42016984-42016996promoter 内 3510-3522 bp + 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 42017475-42021643(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr02G004592 Chr02 NC_080388.1:68434032-68434044promoter 内 3064-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 68420941-68433107(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTTAG
SmilChr01G003415 Chr01 NC_080387.1:52791801-52791813promoter 内 2390-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 52787901-52790202(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr01G005269 Chr01 NC_080387.1:70125722-70125734promoter 内 1937-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 70127786-70128712(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr01G003480 Chr01 NC_080387.1:53361089-53361101promoter 内 1415-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 53356289-53358515(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr02G003876 Chr02 NC_080388.1:60816970-60816982promoter 内 1408-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 60812787-60814389(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAATTAGGTAAC
SmilChr03G004690 Chr03 NC_080389.1:64285258-64285270promoter 内 1117-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 64280804-64282386(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTAGTAGGTAGT
SmilChr02G004072 Chr02 NC_080388.1:63010129-63010141promoter 内 1031-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 63005876-63007171(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAA
SmilChr04G004168 Chr04 NC_080390.1:56325669-56325681promoter 内 286-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 56318929-56321966(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCAAA
SmilChr04G001560 Chr04 NC_080390.1:25899197-25899209promoter 内 3988-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 25899210-25902942(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCTCC
SmilChr02G002290 Chr02 NC_080388.1:40431296-40431308promoter 内 3974-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40431323-40434945(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCTCC
SmilChr02G003165 Chr02 NC_080388.1:52684251-52684263promoter 内 3945-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52681247-52684207(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCCTT
SmilChr04G000617 Chr04 NC_080390.1:6983994-6984006promoter 内 3936-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6980916-6983941(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTAA
SmilChr03G001926 Chr03 NC_080389.1:27021607-27021619promoter 内 3797-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27018285-27021415(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCTCC