转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 59 / 136 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004033 Chr05 NC_080391.1:54307149-54307159promoter 内 985-995 bp + 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54310165-54311880(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr08G002301 Chr08 NC_080394.1:21566879-21566889promoter 内 985-995 bp - 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21563786-21563873(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr02G003464 Chr02 NC_080388.1:55929384-55929394promoter 内 979-989 bp + 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55932406-55936660(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr03G003935 Chr03 NC_080389.1:58409197-58409207promoter 内 959-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58412239-58412667(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr04G000341 Chr04 NC_080390.1:3135092-3135102promoter 内 926-936 bp + 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3138167-3141860(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr05G003179 Chr05 NC_080391.1:40704574-40704584promoter 内 907-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 40699119-40701490(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTT
SmilChr05G003406 Chr05 NC_080391.1:45167042-45167052promoter 内 907-917 bp - 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45155778-45163958(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr02G003373 Chr02 NC_080388.1:54866923-54866933promoter 内 891-901 bp + 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54870033-54880559(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr08G002453 Chr08 NC_080394.1:23348316-23348326promoter 内 885-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 23343007-23345210(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr02G002386 Chr02 NC_080388.1:41791123-41791133promoter 内 878-888 bp - 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41794246-41799827(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr08G003523 Chr08 NC_080394.1:37839830-37839840promoter 内 827-837 bp + 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37836183-37836666(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr03G002178 Chr03 NC_080389.1:33854227-33854237promoter 内 800-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 33857428-33859654(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr07G003581 Chr07 NC_080393.1:41858606-41858616promoter 内 789-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41853247-41855404(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr04G001090 Chr04 NC_080390.1:15622053-15622063promoter 内 778-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 15617053-15618840(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr04G002119 Chr04 NC_080390.1:34184707-34184717promoter 内 737-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 34177739-34181453(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCC
SmilChr03G002972 Chr03 NC_080389.1:46516239-46516249promoter 内 708-718 bp - 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 46519532-46525194(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr02G001148 Chr02 NC_080388.1:20884443-20884453promoter 内 707-717 bp + 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20878858-20881159(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr07G003847 Chr07 NC_080393.1:47723448-47723458promoter 内 620-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 47719582-47720077(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr01G000329 Chr01 NC_080387.1:6720599-6720609promoter 内 619-629 bp - 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6723981-6724799(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr01G001323 Chr01 NC_080387.1:26261804-26261814promoter 内 581-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 26265224-26266468(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr01G003934 Chr01 NC_080387.1:57639364-57639374promoter 内 517-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 57631456-57635890(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr07G004239 Chr07 NC_080393.1:54809264-54809274promoter 内 440-450 bp + 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54802035-54805713(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTT
SmilChr02G003043 Chr02 NC_080388.1:51219749-51219759promoter 内 411-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 51223339-51229024(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr02G002652 Chr02 NC_080388.1:45979271-45979281promoter 内 337-347 bp - 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45972579-45975617(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr08G003568 Chr08 NC_080394.1:38448600-38448610promoter 内 282-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38440260-38444891(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr08G000026 Chr08 NC_080394.1:182833-182843promoter 内 238-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 175840-179080(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr08G000440 Chr08 NC_080394.1:3154161-3154171promoter 内 225-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3157937-3158018(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr02G003766 Chr02 NC_080388.1:59361043-59361053promoter 内 147-157 bp + 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 59364897-59366076(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr04G002756 Chr04 NC_080390.1:43274947-43274957promoter 内 130-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43278818-43280175(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTT
SmilChr02G003832 Chr02 NC_080388.1:59966957-59966967promoter 内 61-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 59958803-59963027(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr02G004218 Chr02 NC_080388.1:64406665-64406675promoter 内 50-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 64401012-64402724(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCT
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43758396-43758406promoter 内 7-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr03G004573 Chr03 NC_080389.1:63635233-63635243promoter 内 1112-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 63626563-63632354(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC
SmilChr05G002087 Chr05 NC_080391.1:21857263-21857273promoter 内 765-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 21860499-21869548(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGT
SmilChr03G002911 Chr03 NC_080389.1:45859076-45859086promoter 内 3356-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 45859721-45861379(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr01G003031 Chr01 NC_080387.1:49357890-49357900promoter 内 2147-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 49353674-49356046(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr08G000394 Chr08 NC_080394.1:2765144-2765154promoter 内 1691-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 2767454-2768307(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAG
SmilChr07G003498 Chr07 NC_080393.1:39626782-39626792promoter 内 1182-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 39629601-39631367(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCACAGCGCG
SmilChr01G000011 Chr01 NC_080387.1:245649-245659promoter 内 857-867 bp + 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 242443-242515(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr01G003032 Chr01 NC_080387.1:49357890-49357900promoter 内 3979-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49357912-49361275(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr03G000480 Chr03 NC_080389.1:5098202-5098212promoter 内 3923-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5096765-5098134(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr08G000633 Chr08 NC_080394.1:4732982-4732992promoter 内 3890-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 4733093-4736059(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr07G002064 Chr07 NC_080393.1:18771214-18771224promoter 内 3880-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18771335-18774148(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr05G000619 Chr05 NC_080391.1:4677987-4677997promoter 内 3809-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 4676178-4677805(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGGT
SmilChr07G003043 Chr07 NC_080393.1:31549588-31549598promoter 内 3759-3769 bp + 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31544367-31549356(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
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SmilChr08G004528 Chr08 NC_080394.1:54835267-54835277promoter 内 3699-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54824367-54834975(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC
SmilChr02G001663 Chr02 NC_080388.1:30853469-30853479promoter 内 3697-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30853773-30857355(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC