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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G002704; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005062-RA_Salv SmilChr04G002704 ERF XP_057807081.1 MP00026 CACCGACCAT

可能结合的靶基因

9854 个结合位点 7408 个候选靶基因 第 59 / 149 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000973 Chr05 NC_080391.1:7870514-7870523promoter 内 662-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7873853-7877402(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr06G000702 Chr06 NC_080392.1:6266112-6266121promoter 内 561-570 bp + 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6269552-6271191(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCAG
SmilChr01G006141 Chr01 NC_080387.1:76919459-76919468promoter 内 516-525 bp + 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 76913729-76915983(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTA
SmilChr01G000514 Chr01 NC_080387.1:10561811-10561820promoter 内 514-523 bp + 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 10565298-10568405(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr01G006131 Chr01 NC_080387.1:76825151-76825160promoter 内 513-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 76828639-76833459(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTA
SmilChr01G000373 Chr01 NC_080387.1:7682731-7682740promoter 内 505-514 bp + 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7686227-7698295(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr04G001125 Chr04 NC_080390.1:16314938-16314947promoter 内 419-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16308418-16311365(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCAG
SmilChr01G005321 Chr01 NC_080387.1:70426247-70426256promoter 内 395-404 bp + 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 70429853-70432586(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr02G001191 Chr02 NC_080388.1:21833274-21833283promoter 内 395-404 bp - 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21836880-21838824(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CTGGTCGGTT
SmilChr05G000910 Chr05 NC_080391.1:7218804-7218813promoter 内 394-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7222411-7228531(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr02G004066 Chr02 NC_080388.1:62951388-62951397promoter 内 317-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 62945020-62947713(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CTGGTCGGTT
SmilChr06G000008 Chr06 NC_080392.1:192636-192645promoter 内 265-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 186090-188909(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCAG
SmilChr03G001370 Chr03 NC_080389.1:16093743-16093752promoter 内 244-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16086865-16089995(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr01G000457 Chr01 NC_080387.1:9338094-9338103promoter 内 163-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9341932-9345111(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr01G004873 Chr01 NC_080387.1:66833403-66833412promoter 内 149-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 66837255-66837328(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr02G000898 Chr02 NC_080388.1:15413859-15413868promoter 内 28-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15417832-15420844(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCAC
SmilChr03G003276 Chr03 NC_080389.1:50703685-50703694promoter 内 21-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 50707665-50713095(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCAG
SmilChr01G002794 Chr01 NC_080387.1:46450107-46450116promoter 内 180-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 6 46443274-46446295(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
SmilChr01G002275 Chr01 NC_080387.1:39521610-39521619promoter 内 3270-3279 bp - 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 39522341-39524619(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr02G003677 Chr02 NC_080388.1:58145009-58145018promoter 内 1878-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 58142824-58142895(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
SmilChr05G003974 Chr05 NC_080391.1:53541060-53541069promoter 内 1110-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 53537027-53538178(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr01G001703 Chr01 NC_080387.1:31470144-31470153promoter 内 761-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 31473384-31473543(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACATC
SmilChr04G000853 Chr04 NC_080390.1:10797398-10797407promoter 内 3986-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 10797413-10801269(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr06G000463 Chr06 NC_080392.1:3789760-3789769promoter 内 3967-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 3789794-3792165(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr03G000387 Chr03 NC_080389.1:4292260-4292269promoter 内 3935-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 4292326-4293199(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr02G004797 Chr02 NC_080388.1:70155472-70155481promoter 内 3898-3907 bp - 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 70155575-70159505(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GAGGTCGGTC
SmilChr01G001512 Chr01 NC_080387.1:28948562-28948571promoter 内 3893-3902 bp - 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 28946670-28948463(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACATC
SmilChr05G001175 Chr05 NC_080391.1:9847987-9847996promoter 内 3845-3854 bp - 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 9842817-9847840(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACACG
SmilChr05G001588 Chr05 NC_080391.1:14580019-14580028promoter 内 3765-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 14579370-14579792(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
SmilChr05G000586 Chr05 NC_080391.1:4428459-4428468promoter 内 3721-3730 bp - 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 4427178-4428188(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
SmilChr05G001224 Chr05 NC_080391.1:10302048-10302057promoter 内 3594-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 10302455-10306055(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
SmilChr03G000957 Chr03 NC_080389.1:10809340-10809349promoter 内 3234-3243 bp - 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 10810107-10812420(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr01G003914 Chr01 NC_080387.1:57412507-57412516promoter 内 3204-3213 bp + 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 57405401-57411719(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GAGGTCGGTC
SmilChr03G000602 Chr03 NC_080389.1:6677669-6677678promoter 内 3074-3083 bp - 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 6678596-6681405(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGTGTCGGTG
SmilChr01G000730 Chr01 NC_080387.1:16246331-16246340promoter 内 2891-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 16247441-16254213(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
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SmilChr02G002680 Chr02 NC_080388.1:46388278-46388287promoter 内 2733-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 46384041-46387019(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
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SmilChr05G003248 Chr05 NC_080391.1:41849481-41849490promoter 内 2536-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 41850946-41854642(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
SmilChr02G004796 Chr02 NC_080388.1:70155412-70155421promoter 内 2138-2147 bp - 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 70148259-70153558(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
SmilChr01G005586 Chr01 NC_080387.1:72549529-72549538promoter 内 2118-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 72551412-72553133(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GAGGTCGGTC
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76051323-76051332promoter 内 2006-2015 bp - 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 76053318-76053403(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
SmilChr01G003764 Chr01 NC_080387.1:56025231-56025240promoter 内 1807-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 56027425-56028951(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACACG
SmilChr01G001009 Chr01 NC_080387.1:21218139-21218148promoter 内 1779-1788 bp + 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21220361-21223520(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACCGACCTC
SmilChr04G002043 Chr04 NC_080390.1:33154086-33154095promoter 内 1747-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 33148031-33151841(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
SmilChr01G005290 Chr01 NC_080387.1:70228263-70228272promoter 内 1637-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 70230627-70231738(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GATGTCGGTG
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