转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 6 / 148 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003083 Chr03 NC_080389.1:47881928-47881941promoter 内 506-519 bp - 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 47877677-47878446(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCGTGACACGTGG
SmilChr03G003084 Chr03 NC_080389.1:47881928-47881941promoter 内 403-416 bp - 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 47885526-47886527(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACGCT
SmilChr05G003183 Chr05 NC_080391.1:40737083-40737096promoter 内 230-243 bp - 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 40740854-40741900(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACGCT
SmilChr06G003241 Chr06 NC_080392.1:45117050-45117063promoter 内 2579-2592 bp + 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 6 45115570-45115641(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCTCT
SmilChr07G002245 Chr07 NC_080393.1:20606385-20606398promoter 内 1785-1798 bp + 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 4 20601164-20604182(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTTCT
SmilChr07G002251 Chr07 NC_080393.1:20677518-20677531promoter 内 1753-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 4 20672101-20675283(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTTCT
SmilChr06G003242 Chr06 NC_080392.1:45117050-45117063promoter 内 3838-3851 bp + 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 45115804-45116900(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCTCT
SmilChr06G002412 Chr06 NC_080392.1:34852590-34852603promoter 内 2317-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 34850164-34850919(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGCGCCACGTGG
SmilChr01G000061 Chr01 NC_080387.1:987728-987741promoter 内 480-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 991249-996545(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGCGACACGTGG
SmilChr02G004032 Chr02 NC_080388.1:62605266-62605279promoter 内 3936-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 62605331-62622002(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGTCAC
SmilChr05G004121 Chr05 NC_080391.1:55114277-55114290promoter 内 3927-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 55112539-55114216(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGCGGCACGTGG
SmilChr08G001539 Chr08 NC_080394.1:12545963-12545976promoter 内 3902-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 12544220-12545877(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCCCAC
SmilChr01G000408 Chr01 NC_080387.1:8331619-8331632promoter 内 3687-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 8329720-8331318(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCTCA
SmilChr04G002447 Chr04 NC_080390.1:39187961-39187974promoter 内 3416-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 39180055-39187389(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTTCT
SmilChr07G000412 Chr07 NC_080393.1:2853762-2853775promoter 内 2709-2722 bp + 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 2843807-2852483(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGTCAC
SmilChr05G001010 Chr05 NC_080391.1:8290534-8290547promoter 内 2431-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 8292104-8293025(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAGGACACGTGG
SmilChr01G005545 Chr01 NC_080387.1:72259877-72259890promoter 内 2210-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 72261668-72264027(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGCGACACGTGG
SmilChr06G001494 Chr06 NC_080392.1:16000258-16000271promoter 内 2162-2175 bp - 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 15993701-15998432(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGAGTCACGTGG
SmilChr06G001285 Chr06 NC_080392.1:13433012-13433025promoter 内 2158-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 13426213-13431182(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGAGTCACGTGG
SmilChr02G001495 Chr02 NC_080388.1:27899031-27899044promoter 内 1330-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 27892569-27896373(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGAGTCACGTGG
SmilChr04G002576 Chr04 NC_080390.1:41115390-41115403promoter 内 1105-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 41118286-41164029(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTCGCA
SmilChr04G002788 Chr04 NC_080390.1:43759039-43759052promoter 内 1003-1016 bp + 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 43762037-43765680(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGAGTCACGTGG
SmilChr03G003296 Chr03 NC_080389.1:51085775-51085788promoter 内 971-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 51088805-51091756(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTCGCA
SmilChr02G005453 Chr02 NC_080388.1:74864322-74864335promoter 内 779-792 bp - 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 74867544-74873718(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCTCT
SmilChr01G000409 Chr01 NC_080387.1:8331619-8331632promoter 内 397-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 8335223-8340175(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGCGACACGTGG
SmilChr05G001009 Chr05 NC_080391.1:8290534-8290547promoter 内 87-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 8283766-8286633(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTTCT
SmilChr03G002519 Chr03 NC_080389.1:40154595-40154608promoter 内 1529-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 40137796-40152136(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr02G000125 Chr02 NC_080388.1:1703739-1703752promoter 内 2454-2467 bp + 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 1705286-1708522(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGGAGTCACGTGG
SmilChr03G003194 Chr03 NC_080389.1:49415070-49415083promoter 内 1129-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 49417942-49442263(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr01G002400 Chr01 NC_080387.1:41353121-41353134promoter 内 1057-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 41356065-41357075(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr04G002146 Chr04 NC_080390.1:34493634-34493647promoter 内 845-858 bp - 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 34496790-34499109(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr05G002775 Chr05 NC_080391.1:32313233-32313246promoter 内 3536-3549 bp + 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 32294933-32312781(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr02G002276 Chr02 NC_080388.1:40213791-40213804promoter 内 2703-2716 bp + 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 40215089-40215653(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr04G000352 Chr04 NC_080390.1:3334461-3334474promoter 内 2533-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3335929-3339006(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr02G002324 Chr02 NC_080388.1:40923284-40923297promoter 内 2346-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 40920720-40921642(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr06G001107 Chr06 NC_080392.1:11180098-11180111promoter 内 1994-2007 bp + 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 11173743-11178104(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr02G002325 Chr02 NC_080388.1:40923284-40923297promoter 内 1922-1935 bp - 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 40925363-40926307(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr05G001970 Chr05 NC_080391.1:20328893-20328906promoter 内 1838-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 20331056-20333011(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr03G002794 Chr03 NC_080389.1:44431019-44431032promoter 内 1776-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 44419615-44428807(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr02G001567 Chr02 NC_080388.1:29070394-29070407promoter 内 1744-1757 bp - 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 29072651-29074053(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr07G003818 Chr07 NC_080393.1:47142595-47142608promoter 内 1660-1673 bp + 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 47144936-47148966(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr06G002604 Chr06 NC_080392.1:37422931-37422944promoter 内 1479-1492 bp + 2509 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 37425453-37428835(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr01G001396 Chr01 NC_080387.1:27452248-27452261promoter 内 1329-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 27441038-27449589(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr02G002323 Chr02 NC_080388.1:40923284-40923297promoter 内 1120-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 40919547-40920416(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr02G001953 Chr02 NC_080388.1:35245010-35245023promoter 内 940-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 35248071-35250239(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr05G001421 Chr05 NC_080391.1:12884126-12884139promoter 内 684-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 12871223-12880822(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr01G001255 Chr01 NC_080387.1:25189062-25189075promoter 内 526-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 25192537-25198619(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG
SmilChr08G001016 Chr08 NC_080394.1:7689170-7689183promoter 内 410-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 7677929-7685592(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCCGCG
SmilChr05G001969 Chr05 NC_080391.1:20328893-20328906promoter 内 179-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 20322994-20325084(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGCA
SmilChr01G003652 Chr01 NC_080387.1:54978557-54978570promoter 内 176-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 54982382-54989938(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGGCCACGTGG