转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 6 / 134 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003209 Chr02 NC_080388.1:53259733-53259745promoter 内 3166-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 53260568-53261383(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATGGATAAGA
SmilChr01G000627 Chr01 NC_080387.1:14051810-14051822promoter 内 3028-3040 bp - 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 14049918-14050849(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGAGGATAAGA
SmilChr01G004233 Chr01 NC_080387.1:60705358-60705370promoter 内 2765-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 60701894-60704134(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGCGGATAAGG
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54562568-54562580promoter 内 2716-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 54563853-54572590(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCAAC
SmilChr02G001049 Chr02 NC_080388.1:18564979-18564991promoter 内 2557-2569 bp - 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 18566423-18567151(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAATTA
SmilChr02G005233 Chr02 NC_080388.1:73535407-73535419promoter 内 2541-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 73532384-73533959(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAATGGATAAGG
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470905-72470917promoter 内 1348-1360 bp + 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 72465758-72468264(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAGTTC
SmilChr02G004152 Chr02 NC_080388.1:63823467-63823479promoter 内 546-558 bp - 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 63826922-63832961(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTAAT
SmilChr02G002472 Chr02 NC_080388.1:43114673-43114685promoter 内 3891-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 43114489-43114575(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATATC
SmilChr01G003730 Chr01 NC_080387.1:55603436-55603448promoter 内 3769-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 55602590-55603216(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTAAT
SmilChr01G005717 Chr01 NC_080387.1:73369733-73369745promoter 内 3710-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 73368484-73369454(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATATC
SmilChr01G000628 Chr01 NC_080387.1:14051810-14051822promoter 内 3538-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 14052273-14053478(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCAAC
SmilChr02G003195 Chr02 NC_080388.1:53113033-53113045promoter 内 3429-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 53109246-53112473(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACATT
SmilChr01G000650 Chr01 NC_080387.1:14493344-14493356promoter 内 3321-3333 bp + 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 14491531-14492676(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCAAC
SmilChr02G001238 Chr02 NC_080388.1:22749014-22749026promoter 内 2685-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 22750330-22751232(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGAGGATAAGA
SmilChr03G000722 Chr03 NC_080389.1:8074583-8074595promoter 内 2653-2665 bp + 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 8075931-8076936(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAAGGATAAGG
SmilChr03G000591 Chr03 NC_080389.1:6575099-6575111promoter 内 2633-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 6572757-6573743(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAAGGATAAGG
SmilChr01G000651 Chr01 NC_080387.1:14493344-14493356promoter 内 2526-2538 bp + 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 14494819-14495241(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGAGGATAAGA
SmilChr02G002717 Chr02 NC_080388.1:47009486-47009498promoter 内 2296-2308 bp + 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 47011191-47012495(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGAGGATAAGA
SmilChr01G004127 Chr01 NC_080387.1:59786168-59786180promoter 内 1451-1463 bp + 2538 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 59782533-59783630(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTAC
SmilChr01G003953 Chr01 NC_080387.1:57914254-57914266promoter 内 894-906 bp - 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 57917361-57918624(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACATT
SmilChr02G000512 Chr02 NC_080388.1:7082550-7082562promoter 内 829-841 bp + 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 7076226-7079390(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTACAAC
SmilChr01G001227 Chr01 NC_080387.1:24554239-24554251promoter 内 2215-2227 bp - 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 24556025-24558788(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCCTTC
SmilChr01G005201 Chr01 NC_080387.1:69689200-69689212promoter 内 1459-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 69691742-69692321(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTTCC
SmilChr02G005231 Chr02 NC_080388.1:73508573-73508585promoter 内 3691-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 73504800-73508275(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTATGGATAAGG
SmilChr03G002272 Chr03 NC_080389.1:35865737-35865749promoter 内 3302-3314 bp + 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 35866436-35868613(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAAAGGATAAGG
SmilChr03G002018 Chr03 NC_080389.1:30190869-30190881promoter 内 3263-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 30191607-30194001(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGAGGATAAGG
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22544021-22544033promoter 内 3228-3240 bp - 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 22542391-22543260(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTGCGGATAAGG
SmilChr01G003680 Chr01 NC_080387.1:55208520-55208532promoter 内 730-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 55211791-55214783(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAAAGGATAAGG
SmilChr01G003679 Chr01 NC_080387.1:55208520-55208532promoter 内 253-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 55200909-55204784(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTTCC
SmilChr01G004098 Chr01 NC_080387.1:59439870-59439882promoter 内 3863-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 59440008-59447385(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAATA
SmilChr02G002289 Chr02 NC_080388.1:40432697-40432709promoter 内 3327-3339 bp + 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 40431150-40432035(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCTCT
SmilChr02G003837 Chr02 NC_080388.1:60065908-60065920promoter 内 2994-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 60064419-60064913(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTTTA
SmilChr03G000244 Chr03 NC_080389.1:2905824-2905836promoter 内 2548-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 2901348-2904383(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTAGGATAAGG
SmilChr03G000328 Chr03 NC_080389.1:3741920-3741932promoter 内 2121-2133 bp - 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3738629-3740052(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTAGGATAAGG
SmilChr01G002282 Chr01 NC_080387.1:39610801-39610813promoter 内 2007-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 39607158-39608819(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTGGATAAGG
SmilChr01G001320 Chr01 NC_080387.1:26225601-26225613promoter 内 1308-1320 bp - 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 26228294-26230613(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAAAA
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SmilChr01G002227 Chr01 NC_080387.1:38738482-38738494promoter 内 323-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 38742160-38743032(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCTCT
SmilChr02G002090 Chr02 NC_080388.1:37496989-37497001promoter 内 220-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 37487786-37493220(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAAGGATAAGG
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SmilChr02G001774 Chr02 NC_080388.1:32513334-32513346promoter 内 1956-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 32508661-32511301(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAATA
SmilChr01G001823 Chr01 NC_080387.1:33173483-33173495promoter 内 1734-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 33175750-33178273(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAAAGGATAAGG
SmilChr01G002816 Chr01 NC_080387.1:46721121-46721133promoter 内 1567-1579 bp - 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 46723555-46729059(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTTTA
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SmilChr02G002595 Chr02 NC_080388.1:45097252-45097264promoter 内 591-603 bp - 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45100662-45103349(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCTCT
SmilChr02G005262 Chr02 NC_080388.1:73714581-73714593promoter 内 3046-3058 bp + 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 73711521-73713638(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTAA
SmilChr01G005041 Chr01 NC_080387.1:68344104-68344116promoter 内 2939-2951 bp - 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 68340382-68343054(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTGTGGATAAGG