转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 62 / 134 下载 TSV

上一页 62 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003935 Chr01 NC_080387.1:57633711-57633723promoter 内 3867-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 57633155-57633589(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTGA
SmilChr01G002440 Chr01 NC_080387.1:41970651-41970663promoter 内 3594-3606 bp + 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 41968603-41970256(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTAA
SmilChr01G005071 Chr01 NC_080387.1:68589896-68589908promoter 内 3588-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68590309-68591133(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATTT
SmilChr03G000573 Chr03 NC_080389.1:6233835-6233847promoter 内 3483-3495 bp + 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6232208-6233329(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATGTT
SmilChr01G004393 Chr01 NC_080387.1:62102565-62102577promoter 内 3476-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62098704-62102052(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATATT
SmilChr01G004016 Chr01 NC_080387.1:58560419-58560431promoter 内 3296-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 58558436-58559726(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTGGTT
SmilChr02G004350 Chr02 NC_080388.1:65760269-65760281promoter 内 3195-3207 bp + 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 65761075-65764167(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGGTTGGATAAGG
SmilChr02G004011 Chr02 NC_080388.1:62431562-62431574promoter 内 2929-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62428456-62430502(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCCCT
SmilChr01G003411 Chr01 NC_080387.1:52763012-52763024promoter 内 2866-2878 bp + 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52764147-52770005(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAATGAGATAAGG
SmilChr02G001561 Chr02 NC_080388.1:28876448-28876460promoter 内 2765-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 28877684-28878106(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGTTAGATAAGG
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62501544-62501556promoter 内 2545-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62498208-62500100(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGTTGATAAGG
SmilChr02G002377 Chr02 NC_080388.1:41659288-41659300promoter 内 2392-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 41660897-41662976(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACATGGATAAGA
SmilChr01G000426 Chr01 NC_080387.1:8555133-8555145promoter 内 2182-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 8556952-8560394(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTGAC
SmilChr01G005469 Chr01 NC_080387.1:71679916-71679928promoter 内 2150-2162 bp + 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 71674685-71678077(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACTAT
SmilChr01G003584 Chr01 NC_080387.1:54414433-54414445promoter 内 2110-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 54416324-54421669(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr01G001256 Chr01 NC_080387.1:25204607-25204619promoter 内 2044-2056 bp + 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 25198578-25202662(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATGTT
SmilChr01G004295 Chr01 NC_080387.1:61148549-61148561promoter 内 2029-2041 bp + 1960 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 61142915-61146589(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATTT
SmilChr03G000817 Chr03 NC_080389.1:9341278-9341290promoter 内 1995-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9336319-9339284(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAGGGATAAGG
SmilChr03G000176 Chr03 NC_080389.1:1909039-1909051promoter 内 1969-1981 bp - 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 1903647-1907019(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAGGGATAAGG
SmilChr02G000845 Chr02 NC_080388.1:14344966-14344978promoter 内 1725-1737 bp + 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 14347242-14350397(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAGGGATAAGG
SmilChr01G000889 Chr01 NC_080387.1:18948068-18948080promoter 内 1534-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 18935863-18945613(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCACAGGATAAGG
SmilChr01G004394 Chr01 NC_080387.1:62102565-62102577promoter 内 1503-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62105063-62109085(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATATGGATAACA
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73614155-73614167promoter 内 1363-1375 bp - 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 73616793-73625585(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATTT
SmilChr02G004180 Chr02 NC_080388.1:64103367-64103379promoter 内 1265-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 64095297-64100643(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATTT
SmilChr02G004603 Chr02 NC_080388.1:68549111-68549123promoter 内 1198-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68540602-68546320(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAAAGGATAAGT
SmilChr02G004412 Chr02 NC_080388.1:66463826-66463838promoter 内 1068-1080 bp + 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 66454537-66460905(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr01G003922 Chr01 NC_080387.1:57475800-57475812promoter 内 961-973 bp - 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 57478840-57479592(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTTT
SmilChr01G002283 Chr01 NC_080387.1:39622632-39622644promoter 内 872-884 bp - 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 39613927-39619515(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAGTGGATAACA
SmilChr01G002157 Chr01 NC_080387.1:37579958-37579970promoter 内 755-767 bp + 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 37583204-37586022(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATG
SmilChr03G000177 Chr03 NC_080389.1:1911875-1911887promoter 内 736-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 1915140-1916637(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCTAGT
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56392126-56392138promoter 内 548-560 bp - 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 56395579-56397687(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTCTC
SmilChr01G003656 Chr01 NC_080387.1:55002417-55002429promoter 内 457-469 bp + 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55005961-55010563(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAACA
SmilChr01G004683 Chr01 NC_080387.1:64906767-64906779promoter 内 403-415 bp - 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 64910365-64911638(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCGAT
SmilChr01G001185 Chr01 NC_080387.1:23963791-23963803promoter 内 366-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 23967426-23968862(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGGCTGGATAAGG
SmilChr02G001292 Chr02 NC_080388.1:23749459-23749471promoter 内 261-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 23739913-23745731(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTCTC
SmilChr02G000216 Chr02 NC_080388.1:2825861-2825873promoter 内 3851-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2822211-2825723(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATG
SmilChr02G001901 Chr02 NC_080388.1:34309463-34309475promoter 内 3758-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 34308094-34309232(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAACCA
SmilChr01G004789 Chr01 NC_080387.1:66115341-66115353promoter 内 3695-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66115647-66117585(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATTT
SmilChr01G001586 Chr01 NC_080387.1:29869467-29869479promoter 内 3523-3535 bp - 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 29869945-29875021(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr01G001212 Chr01 NC_080387.1:24345938-24345950promoter 内 3428-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 24346511-24350237(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr02G000673 Chr02 NC_080388.1:10402529-10402541promoter 内 3396-3408 bp - 593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10399954-10401936(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGAGGGGATAAGA
SmilChr01G002846 Chr01 NC_080387.1:47036233-47036245promoter 内 3394-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 47030507-47035638(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGATCT
SmilChr02G001011 Chr02 NC_080388.1:17863648-17863660promoter 内 3342-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 17864307-17865524(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAGGGATAAGG
SmilChr02G001087 Chr02 NC_080388.1:19496168-19496180promoter 内 3341-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19496828-19501964(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATCCG
SmilChr03G001211 Chr03 NC_080389.1:13935174-13935186promoter 内 3267-3279 bp - 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 13935908-13936964(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAACAAA
SmilChr01G004563 Chr01 NC_080387.1:63710459-63710471promoter 内 3198-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63708057-63709668(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGA
SmilChr01G004523 Chr01 NC_080387.1:63367685-63367697promoter 内 3128-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63363596-63366824(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAAGGATAAGT
SmilChr02G004811 Chr02 NC_080388.1:70274504-70274516promoter 内 3125-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70271070-70273640(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr02G001623 Chr02 NC_080388.1:30157130-30157142promoter 内 3036-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30158095-30162904(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACA
SmilChr02G004290 Chr02 NC_080388.1:65225808-65225820promoter 内 2943-2955 bp - 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 65223581-65224762(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CACGAGGATAAGA