转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 63 / 143 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000899 Chr08 NC_080394.1:6665245-6665256promoter 内 511-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 6668735-6672694(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr03G003889 Chr03 NC_080389.1:57967116-57967127promoter 内 492-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57961116-57963618(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAA
SmilChr05G004275 Chr05 NC_080391.1:56559285-56559296promoter 内 480-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56551739-56555775(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAA
SmilChr01G001701 Chr01 NC_080387.1:31445044-31445055promoter 内 429-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 31448616-31451301(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr02G000072 Chr02 NC_080388.1:909041-909052promoter 内 413-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 904943-905464(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr06G001223 Chr06 NC_080392.1:12636072-12636083promoter 内 412-423 bp - 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 12626675-12632494(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGGG
SmilChr04G001240 Chr04 NC_080390.1:19500128-19500139promoter 内 400-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 19503729-19504793(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAA
SmilChr06G001691 Chr06 NC_080392.1:19306134-19306145promoter 内 146-157 bp - 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 19299410-19302290(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAGG
SmilChr07G004055 Chr07 NC_080393.1:51863808-51863819promoter 内 124-135 bp - 3866 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 51857466-51859942(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATA
SmilChr07G004057 Chr07 NC_080393.1:51863808-51863819promoter 内 85-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 51867724-51868705(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCGT
SmilChr01G004445 Chr01 NC_080387.1:62572731-62572742promoter 内 67-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 62564470-62568808(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAA
SmilChr06G000817 Chr06 NC_080392.1:7698783-7698794promoter 内 55-66 bp + 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7692165-7694848(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCGT
SmilChr03G001354 Chr03 NC_080389.1:15907345-15907356promoter 内 10-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15901754-15903365(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAA
SmilChr05G003762 Chr05 NC_080391.1:50915291-50915302promoter 内 2653-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 50911236-50913954(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGA
SmilChr03G003428 Chr03 NC_080389.1:52630319-52630330promoter 内 2617-2628 bp + 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 52626154-52628946(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGA
SmilChr06G000053 Chr06 NC_080392.1:432905-432916promoter 内 2372-2383 bp + 1618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 428399-431287(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr02G000360 Chr02 NC_080388.1:4640359-4640370promoter 内 887-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 4643473-4647673(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTA
SmilChr02G004847 Chr02 NC_080388.1:70609732-70609743promoter 内 3821-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 70609912-70613661(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGA
SmilChr02G004507 Chr02 NC_080388.1:67605343-67605354promoter 内 3415-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 67605929-67611060(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTT
SmilChr03G001856 Chr03 NC_080389.1:25588108-25588119promoter 内 3165-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 25588944-25589594(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGA
SmilChr07G003616 Chr07 NC_080393.1:42540901-42540912promoter 内 3023-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42541879-42543684(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr04G004173 Chr04 NC_080390.1:56359336-56359347promoter 内 2680-2691 bp - 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 56354676-56358026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGGT
SmilChr02G004508 Chr02 NC_080388.1:67605343-67605354promoter 内 2471-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 67606873-67625971(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTT
SmilChr06G001814 Chr06 NC_080392.1:21306732-21306743promoter 内 2454-2465 bp - 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 21308279-21310455(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGA
SmilChr08G000567 Chr08 NC_080394.1:4110875-4110886promoter 内 2349-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 4109039-4109234(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGA
SmilChr07G001880 Chr07 NC_080393.1:16260135-16260146promoter 内 2332-2343 bp - 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 16261804-16266591(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGC
SmilChr01G001771 Chr01 NC_080387.1:32625210-32625221promoter 内 2072-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 32627139-32630775(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAG
SmilChr03G003052 Chr03 NC_080389.1:47414644-47414655promoter 内 1869-1880 bp - 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 47411397-47412523(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAA
SmilChr03G002505 Chr03 NC_080389.1:39905127-39905138promoter 内 1523-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 39900186-39902660(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGC
SmilChr02G004506 Chr02 NC_080388.1:67605343-67605354promoter 内 1160-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 67601581-67602513(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGC
SmilChr07G003617 Chr07 NC_080393.1:42540901-42540912promoter 内 1093-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42543809-42544160(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr08G000753 Chr08 NC_080394.1:5550201-5550212promoter 内 1084-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 5553118-5557335(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTT
SmilChr08G000156 Chr08 NC_080394.1:1038830-1038841promoter 内 953-964 bp + 3037 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 1034472-1035793(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCGA
SmilChr04G002760 Chr04 NC_080390.1:43349165-43349176promoter 内 952-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 43338436-43346127(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCGA
SmilChr07G000901 Chr07 NC_080393.1:6458164-6458175promoter 内 876-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 6461289-6464051(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGA
SmilChr05G000939 Chr05 NC_080391.1:7559019-7559030promoter 内 732-743 bp + 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 7562288-7564893(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTT
SmilChr02G003346 Chr02 NC_080388.1:54673250-54673261promoter 内 510-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 54676741-54680443(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAC
SmilChr03G002075 Chr03 NC_080389.1:31722498-31722509promoter 内 322-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 31726177-31727992(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAA
SmilChr02G003005 Chr02 NC_080388.1:50697265-50697276promoter 内 265-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 50690724-50693540(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGC
SmilChr01G003174 Chr01 NC_080387.1:50541977-50541988promoter 内 215-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 50545763-50553870(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGA
SmilChr05G000692 Chr05 NC_080391.1:5232440-5232451promoter 内 137-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 5236304-5239026(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGGT
SmilChr01G005478 Chr01 NC_080387.1:71767012-71767023promoter 内 3867-3878 bp + 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71767146-71770548(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAA
SmilChr01G004660 Chr01 NC_080387.1:64704030-64704041promoter 内 3806-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64704225-64708380(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAA
SmilChr01G001930 Chr01 NC_080387.1:34472636-34472647promoter 内 3786-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 34471363-34472432(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGTG
SmilChr03G002394 Chr03 NC_080389.1:37894971-37894982promoter 内 3767-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37891304-37894748(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAA
SmilChr01G001931 Chr01 NC_080387.1:34472636-34472647promoter 内 3724-3735 bp - 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 34472913-34474261(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGA
SmilChr07G000374 Chr07 NC_080393.1:2545457-2545468promoter 内 3715-3726 bp + 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2545743-2549009(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAA
SmilChr01G001400 Chr01 NC_080387.1:27499573-27499584promoter 内 3658-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27497994-27499241(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAT
SmilChr05G000750 Chr05 NC_080391.1:5809967-5809978promoter 内 3658-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 5806255-5809635(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCGA
SmilChr06G001135 Chr06 NC_080392.1:11393224-11393235promoter 内 3645-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 11393580-11394150(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAT