转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G002534; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003982-RA_Salv SmilChr02G002534 TCP XP_057797741.1 MP00169 GTTGGGACCACA

可能结合的靶基因

7295 个结合位点 6498 个候选靶基因 第 65 / 130 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17459200-17459211promoter 内 600-611 bp - 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTTGGTCCCCGT
SmilChr07G004228 Chr07 NC_080393.1:54560693-54560704promoter 内 426-437 bp - 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54564268-54565857(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCTCAT
SmilChr05G002254 Chr05 NC_080391.1:24218273-24218284promoter 内 419-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 24221855-24222823(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTGGGGACCATA
SmilChr04G003351 Chr04 NC_080390.1:50127523-50127534promoter 内 403-414 bp + 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50121532-50123936(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TATGGTCCCCAC
SmilChr05G000072 Chr05 NC_080391.1:367172-367183promoter 内 332-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 362702-363514(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 CGCGGTCCCAAT
SmilChr03G002070 Chr03 NC_080389.1:31599749-31599760promoter 内 277-288 bp - 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 31603473-31605806(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ACTGGTCCCAAC
SmilChr07G000557 Chr07 NC_080393.1:3847550-3847561promoter 内 158-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3841007-3843718(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCAG
SmilChr08G000771 Chr08 NC_080394.1:5695261-5695272promoter 内 127-138 bp + 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5683440-5691398(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGTCCCAAC
SmilChr05G002111 Chr05 NC_080391.1:22127771-22127782promoter 内 89-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22120479-22123870(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TATGGTCCCCAC
SmilChr06G000352 Chr06 NC_080392.1:2683971-2683982promoter 内 79-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2675180-2680060(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGGTGGACCACC
SmilChr08G003709 Chr08 NC_080394.1:41656431-41656442promoter 内 43-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41649521-41652484(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ACTGGTCCCAAC
SmilChr03G000652 Chr03 NC_080389.1:7245908-7245919promoter 内 3390-3401 bp - 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 7246519-7247247(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCAT
SmilChr08G002889 Chr08 NC_080394.1:28764883-28764894promoter 内 3641-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 28765243-28766085(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCAAGC
SmilChr05G002453 Chr05 NC_080391.1:27085978-27085989promoter 内 3415-3426 bp - 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27084506-27085403(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr05G002452 Chr05 NC_080391.1:27078220-27078231promoter 内 3407-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27076740-27077637(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr05G002451 Chr05 NC_080391.1:27070455-27070466promoter 内 3397-3408 bp - 593 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27062388-27069862(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr07G000608 Chr07 NC_080393.1:4137399-4137410promoter 内 3395-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4138005-4139363(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTTGGACCACA
SmilChr05G003037 Chr05 NC_080391.1:38116934-38116945promoter 内 3392-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 38115557-38116336(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCAT
SmilChr02G004903 Chr02 NC_080388.1:71023395-71023406promoter 内 3301-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 71024095-71025732(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCAATC
SmilChr05G001425 Chr05 NC_080391.1:12941544-12941555promoter 内 2882-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 12939546-12940436(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TCTGGTCCCAGC
SmilChr01G001983 Chr01 NC_080387.1:35216852-35216863promoter 内 2632-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 35218221-35220823(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGTGGTCCGGAT
SmilChr08G002820 Chr08 NC_080394.1:28027911-28027922promoter 内 2522-2533 bp - 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 28023534-28026443(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGGAGGACCACA
SmilChr06G002095 Chr06 NC_080392.1:27868545-27868556promoter 内 1942-1953 bp - 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27864348-27866497(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGGAGGACCACA
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7426473-7426484promoter 内 1730-1741 bp + 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 7428744-7431916(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr02G003161 Chr02 NC_080388.1:52651794-52651805promoter 内 1086-1097 bp + 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 52654709-52656442(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTGGGACCATC
SmilChr02G003025 Chr02 NC_080388.1:50927916-50927927promoter 内 1042-1053 bp - 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 50923187-50924968(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTGGGACCATC
SmilChr07G000285 Chr07 NC_080393.1:1848492-1848503promoter 内 939-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 1851554-1854430(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr05G003557 Chr05 NC_080391.1:47500382-47500393promoter 内 842-853 bp + 3148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 47503541-47505664(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr07G000588 Chr07 NC_080393.1:4015982-4015993promoter 内 3971-3982 bp + 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4016012-4017238(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GCTTGGACCACA
SmilChr02G004902 Chr02 NC_080388.1:71023395-71023406promoter 内 3951-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71021125-71023356(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATTGGACCACC
SmilChr03G003081 Chr03 NC_080389.1:47834045-47834056promoter 内 3934-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47834112-47842494(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATTGGACCACC
SmilChr03G004345 Chr03 NC_080389.1:61735466-61735477promoter 内 3883-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61735584-61736510(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTACGGACCACC
SmilChr04G002471 Chr04 NC_080390.1:39524384-39524395promoter 内 3857-3868 bp + 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39523722-39524251(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCAAGC
SmilChr06G000417 Chr06 NC_080392.1:3463480-3463491promoter 内 3804-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3459757-3463294(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCTCCC
SmilChr03G002317 Chr03 NC_080389.1:36522409-36522420promoter 内 3706-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 36520331-36522125(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTCGGGACCAAA
SmilChr04G001016 Chr04 NC_080390.1:14144457-14144468promoter 内 3706-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14144752-14146774(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTCGGGACCAAA
SmilChr01G000292 Chr01 NC_080387.1:5709011-5709022promoter 内 3691-3702 bp - 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5706918-5708712(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTCGGGACCAAA
SmilChr07G004284 Chr07 NC_080393.1:55393482-55393493promoter 内 3641-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55393842-55394447(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCAAGC
SmilChr08G002905 Chr08 NC_080394.1:29011100-29011111promoter 内 3611-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29009211-29010721(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTCGGGACCAAA
SmilChr05G000524 Chr05 NC_080391.1:4021774-4021785promoter 内 3450-3461 bp - 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4016728-4021234(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTGAGGACCACC
SmilChr02G001723 Chr02 NC_080388.1:31701355-31701366promoter 内 3446-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31699763-31700811(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGCAGGACCACC
SmilChr01G000360 Chr01 NC_080387.1:7426332-7426343promoter 内 3440-3451 bp + 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 7425677-7425782(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGTCCCGAC
SmilChr07G003679 Chr07 NC_080393.1:44258725-44258736promoter 内 3440-3451 bp + 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44258070-44258175(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGTCCCGAC
SmilChr08G003922 Chr08 NC_080394.1:46712549-46712560promoter 内 3440-3451 bp - 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46713110-46713215(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGTCCCGAC
SmilChr02G000590 Chr02 NC_080388.1:8461552-8461563promoter 内 3436-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8462117-8462620(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGCAGGACCACC
SmilChr07G003553 Chr07 NC_080393.1:41300139-41300150promoter 内 3422-3433 bp + 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41300718-41301125(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GGCAGGACCACC
SmilChr05G003147 Chr05 NC_080391.1:40224402-40224413promoter 内 3420-3431 bp + 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40224983-40225652(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr03G000282 Chr03 NC_080389.1:3237620-3237631promoter 内 3407-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3207949-3237037(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATGCGGACCACA
SmilChr04G001492 Chr04 NC_080390.1:24376851-24376862promoter 内 3394-3405 bp + 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24375866-24376255(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCAT
SmilChr01G002674 Chr01 NC_080387.1:44954484-44954495promoter 内 3390-3401 bp - 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44955095-44955667(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCGCAT