转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 65 / 136 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000884 Chr02 NC_080388.1:15247855-15247865promoter 内 1000-1010 bp + 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15240996-15244864(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGG
SmilChr08G002496 Chr08 NC_080394.1:23936904-23936914promoter 内 882-892 bp - 3109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23940023-23947470(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAT
SmilChr07G002188 Chr07 NC_080393.1:20092524-20092534promoter 内 845-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20095680-20098851(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr02G001673 Chr02 NC_080388.1:30984811-30984821promoter 内 832-842 bp - 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30987980-30989248(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACCCTGAGCC
SmilChr02G002435 Chr02 NC_080388.1:42407692-42407702promoter 内 749-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 42401551-42404450(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCG
SmilChr01G003830 Chr01 NC_080387.1:56639069-56639079promoter 内 635-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56631798-56635713(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr08G002313 Chr08 NC_080394.1:21801657-21801667promoter 内 618-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21805040-21805113(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr03G002774 Chr03 NC_080389.1:44136176-44136186promoter 内 518-528 bp - 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44139659-44140393(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr03G000170 Chr03 NC_080389.1:1866376-1866386promoter 内 463-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1869914-1872256(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr03G003395 Chr03 NC_080389.1:52361003-52361013promoter 内 453-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52355585-52357465(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGG
SmilChr08G002131 Chr08 NC_080394.1:19185375-19185385promoter 内 407-417 bp + 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19188969-19192358(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTT
SmilChr06G000410 Chr06 NC_080392.1:3384061-3384071promoter 内 256-266 bp - 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3387806-3390540(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGG
SmilChr01G005727 Chr01 NC_080387.1:73420721-73420731promoter 内 192-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 73413251-73416922(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAG
SmilChr06G003093 Chr06 NC_080392.1:43774815-43774825promoter 内 151-161 bp - 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43778665-43782104(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr07G000844 Chr07 NC_080393.1:6009633-6009643promoter 内 128-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6013506-6016163(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCT
SmilChr01G004045 Chr01 NC_080387.1:58873873-58873883promoter 内 104-114 bp + 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58877770-58889743(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTG
SmilChr04G003711 Chr04 NC_080390.1:53417478-53417488promoter 内 1443-1453 bp + 2548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 53420036-53421268(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAC
SmilChr01G004371 Chr01 NC_080387.1:61924378-61924388promoter 内 2944-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 61922627-61923331(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr01G004372 Chr01 NC_080387.1:61924378-61924388promoter 内 2846-2856 bp + 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 61925533-61927324(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAC
SmilChr08G001189 Chr08 NC_080394.1:9524699-9524709promoter 内 2182-2192 bp + 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 9520343-9522890(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr08G003791 Chr08 NC_080394.1:43755817-43755827promoter 内 2265-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 43752043-43754091(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr02G004052 Chr02 NC_080388.1:62843109-62843119promoter 内 2160-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 62844950-62847799(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr07G003991 Chr07 NC_080393.1:50975008-50975018promoter 内 993-1003 bp + 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 50964673-50972010(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTA
SmilChr07G003640 Chr07 NC_080393.1:43108171-43108181promoter 内 3970-3980 bp - 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43108202-43110213(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr08G001605 Chr08 NC_080394.1:13300026-13300036promoter 内 3450-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 13293504-13299485(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTA
SmilChr08G003054 Chr08 NC_080394.1:30704107-30704117promoter 内 3295-3305 bp + 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30700162-30703411(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTA
SmilChr02G004929 Chr02 NC_080388.1:71295526-71295536promoter 内 3284-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71296243-71300602(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
SmilChr02G000682 Chr02 NC_080388.1:10767720-10767730promoter 内 2867-2877 bp - 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10765274-10766596(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr07G003741 Chr07 NC_080393.1:45569193-45569203promoter 内 2637-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45570557-45572301(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr07G003882 Chr07 NC_080393.1:48464331-48464341promoter 内 2432-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48461807-48462772(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr05G001969 Chr05 NC_080391.1:20326954-20326964promoter 内 2121-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 20322994-20325084(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
SmilChr04G000338 Chr04 NC_080390.1:3117244-3117254promoter 内 2062-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3119183-3123775(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGCA
SmilChr06G003301 Chr06 NC_080392.1:45541858-45541868promoter 内 1978-1988 bp + 2013 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45543881-45549841(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr02G004750 Chr02 NC_080388.1:69691794-69691804promoter 内 1855-1865 bp - 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69693940-69694625(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
SmilChr02G004748 Chr02 NC_080388.1:69691794-69691804promoter 内 1709-1719 bp - 2282 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69684844-69689512(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr08G002292 Chr08 NC_080394.1:21399426-21399436promoter 内 1463-1473 bp + 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21401964-21404205(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAC
SmilChr03G003520 Chr03 NC_080389.1:53811619-53811629promoter 内 1459-1469 bp + 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53805883-53809087(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCG
SmilChr01G000604 Chr01 NC_080387.1:13154277-13154287promoter 内 1413-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 13148705-13151699(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr07G002820 Chr07 NC_080393.1:28239277-28239287promoter 内 1296-1306 bp - 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28241982-28245220(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
SmilChr02G004407 Chr02 NC_080388.1:66387482-66387492promoter 内 1070-1080 bp + 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 66390413-66392292(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGCA
SmilChr07G002819 Chr07 NC_080393.1:28239277-28239287promoter 内 1059-1069 bp - 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28234733-28236345(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr07G002322 Chr07 NC_080393.1:21482282-21482292promoter 内 835-845 bp + 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21485448-21487293(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCC
SmilChr01G000349 Chr01 NC_080387.1:7164492-7164502promoter 内 779-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7167714-7170836(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
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SmilChr02G004051 Chr02 NC_080388.1:62843109-62843119promoter 内 346-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 62836145-62839464(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAC
SmilChr03G004439 Chr03 NC_080389.1:62548027-62548037promoter 内 294-304 bp + 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 62527186-62544330(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAG
SmilChr07G003018 Chr07 NC_080393.1:31228691-31228701promoter 内 1237-1247 bp + 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 8 31224933-31225937(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr03G002933 Chr03 NC_080389.1:46066316-46066326promoter 内 2975-2985 bp - 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 46067342-46070591(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTC
SmilChr03G002932 Chr03 NC_080389.1:46066316-46066326promoter 内 2192-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 46062193-46064517(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCAGCGCG
SmilChr04G001215 Chr04 NC_080390.1:18932282-18932292promoter 内 72-82 bp + 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 18925717-18928363(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCG