转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 65 / 164 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004464 Chr02 NC_080388.1:67057257-67057271promoter 内 2783-2797 bp - 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 67058475-67063551(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCTCTAG
SmilChr04G003090 Chr04 NC_080390.1:47532908-47532922promoter 内 2689-2703 bp - 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47527776-47531610(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATAGTAGGTGAA
SmilChr01G002353 Chr01 NC_080387.1:40702249-40702263promoter 内 2670-2684 bp - 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40680169-40700932(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATAGTAGGTGAA
SmilChr02G001620 Chr02 NC_080388.1:30138952-30138966promoter 内 2665-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30140288-30143101(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCGACCTACCCCCCC
SmilChr07G003758 Chr07 NC_080393.1:45860982-45860996promoter 内 2662-2676 bp - 1325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45857706-45859657(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAATTGTTAGGTGAG
SmilChr03G004392 Chr03 NC_080389.1:62101288-62101302promoter 内 2476-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 62099029-62099777(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTACCTACCTGACT
SmilChr08G001521 Chr08 NC_080394.1:12367529-12367543promoter 内 2458-2472 bp + 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12360556-12366000(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACTATCAT
SmilChr03G002850 Chr03 NC_080389.1:45090992-45091006promoter 内 2422-2436 bp + 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45092571-45093170(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGAG
SmilChr03G000268 Chr03 NC_080389.1:3099318-3099332promoter 内 2400-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3094510-3097731(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTCAGGTAGGTAAG
SmilChr03G000082 Chr03 NC_080389.1:965082-965096promoter 内 2385-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 966698-968401(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTCAGGTAGGTAAG
SmilChr06G000160 Chr06 NC_080392.1:1117415-1117429promoter 内 2367-2381 bp - 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1119049-1126183(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTAACAACGC
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7498630-7498644promoter 内 2305-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCGTTT
SmilChr04G003832 Chr04 NC_080390.1:54379205-54379219promoter 内 2171-2185 bp + 1816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54381035-54383686(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAAATAGTAGGTGAG
SmilChr05G004176 Chr05 NC_080391.1:55685871-55685885promoter 内 2116-2130 bp + 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55681295-55684000(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACACCTACCAAAAT
SmilChr08G001685 Chr08 NC_080394.1:14089154-14089168promoter 内 2050-2064 bp + 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14084933-14087217(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTACCTACCACACT
SmilChr08G002515 Chr08 NC_080394.1:24356740-24356754promoter 内 2020-2034 bp - 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24349114-24354773(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTTTGGTAGTTGAA
SmilChr05G003245 Chr05 NC_080391.1:41781840-41781854promoter 内 1879-1893 bp + 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41778822-41779732(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACCACCG
SmilChr04G003830 Chr04 NC_080390.1:54379205-54379219promoter 内 1816-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54374747-54377034(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTATTTA
SmilChr07G002847 Chr07 NC_080393.1:28588251-28588265promoter 内 1813-1827 bp + 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28585103-28586077(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCAACCTACCATCTG
SmilChr05G004210 Chr05 NC_080391.1:55980338-55980352promoter 内 1651-1665 bp - 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55976254-55978002(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATGCGGTAGGTGAA
SmilChr08G002056 Chr08 NC_080394.1:18413370-18413384promoter 内 1649-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18415722-18420797(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCAGCTT
SmilChr01G005590 Chr01 NC_080387.1:72564645-72564659promoter 内 1646-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72558686-72562304(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTTTATC
SmilChr01G001994 Chr01 NC_080387.1:35343748-35343762promoter 内 1631-1645 bp + 2356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35339808-35341392(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTTTTTA
SmilChr07G000951 Chr07 NC_080393.1:6818986-6819000promoter 内 1591-1605 bp + 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6821396-6822302(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCTTGGTAGTTGGA
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7498630-7498644promoter 内 1589-1603 bp - 2398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7493156-7496232(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAACGGGTAGGTGAA
SmilChr01G001379 Chr01 NC_080387.1:27190497-27190511promoter 内 1550-1564 bp - 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27187377-27188060(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAAATGGTAGGTGAT
SmilChr07G000849 Chr07 NC_080393.1:6053034-6053048promoter 内 1534-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6055501-6059166(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCCCAAA
SmilChr05G002450 Chr05 NC_080391.1:27047154-27047168promoter 内 1498-1512 bp - 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27040989-27044665(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTCAAAGTAGGTGGG
SmilChr02G004449 Chr02 NC_080388.1:66848336-66848350promoter 内 1480-1494 bp + 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66850857-66852409(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGAG
SmilChr03G003013 Chr03 NC_080389.1:47027367-47027381promoter 内 1456-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47022961-47024836(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTCCACA
SmilChr05G000116 Chr05 NC_080391.1:866538-866552promoter 内 1454-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 860654-864005(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAACCC
SmilChr03G004552 Chr03 NC_080389.1:63479787-63479801promoter 内 1342-1356 bp + 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63482446-63488364(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CAGTTGGTTGTTGGG
SmilChr08G001866 Chr08 NC_080394.1:16022479-16022493promoter 内 1290-1304 bp - 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16025190-16025735(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTTTATC
SmilChr06G001473 Chr06 NC_080392.1:15637867-15637881promoter 内 1278-1292 bp + 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15640590-15641683(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGCAGGTAGGTGAC
SmilChr03G001710 Chr03 NC_080389.1:22870920-22870934promoter 内 1250-1264 bp + 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22873671-22874800(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCAAGGTAGGTGAA
SmilChr04G000216 Chr04 NC_080390.1:1896548-1896562promoter 内 1225-1239 bp - 2762 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1899324-1903515(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCTACCTACCATATC
SmilChr02G000835 Chr02 NC_080388.1:14108324-14108338promoter 内 1195-1209 bp - 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14111130-14114061(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAACCC
SmilChr01G005125 Chr01 NC_080387.1:69053958-69053972promoter 内 1193-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 69056766-69059958(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCATTAA
SmilChr02G002137 Chr02 NC_080388.1:38470370-38470384promoter 内 1125-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38473246-38475937(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAACCC
SmilChr04G004048 Chr04 NC_080390.1:55691717-55691731promoter 内 1080-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55685043-55688810(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATGTGGTAGGTTAA
SmilChr02G000196 Chr02 NC_080388.1:2451925-2451939promoter 内 1075-1089 bp - 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2454851-2457037(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAACCC
SmilChr07G003093 Chr07 NC_080393.1:32704328-32704342promoter 内 1053-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32707276-32709301(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAACCC
SmilChr08G002201 Chr08 NC_080394.1:19945832-19945846promoter 内 1000-1014 bp + 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 19939413-19942845(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCGCATT
SmilChr01G005617 Chr01 NC_080387.1:72679515-72679529promoter 内 933-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72673286-72676461(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATGAGGTAGGTTGG
SmilChr05G003749 Chr05 NC_080391.1:50625857-50625871promoter 内 928-942 bp + 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50619235-50622798(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGCACCTACCTGCAG
SmilChr01G000851 Chr01 NC_080387.1:18389434-18389448promoter 内 916-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18382740-18386363(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATAGTAGGTGAA
SmilChr06G001121 Chr06 NC_080392.1:11280142-11280156promoter 内 817-831 bp + 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11274252-11276972(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTACCTACCATGTC
SmilChr06G002812 Chr06 NC_080392.1:40824381-40824395promoter 内 816-830 bp - 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40819244-40821210(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGAG
SmilChr06G001105 Chr06 NC_080392.1:11160102-11160116promoter 内 782-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11154224-11156897(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTACCTACCATGTC
SmilChr01G002404 Chr01 NC_080387.1:41392675-41392689promoter 内 769-783 bp - 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41395907-41396679(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACTATACT