转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 66 / 167 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000967 Chr03 NC_080389.1:10937157-10937168promoter 内 657-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10940501-10942103(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCT
SmilChr01G002900 Chr01 NC_080387.1:47667753-47667764promoter 内 649-660 bp - 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47671105-47672514(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGATG
SmilChr04G002807 Chr04 NC_080390.1:43992399-43992410promoter 内 622-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43995778-43996868(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTGGCGTGGCA
SmilChr07G004485 Chr07 NC_080393.1:57391716-57391727promoter 内 577-588 bp - 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57395140-57396649(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGGTT
SmilChr01G003705 Chr01 NC_080387.1:55412768-55412779promoter 内 576-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55416193-55417162(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTGCACGCCATA
SmilChr02G002501 Chr02 NC_080388.1:43465574-43465585promoter 内 531-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43460472-43462115(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGCAG
SmilChr03G004599 Chr03 NC_080389.1:63792209-63792220promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63786949-63788739(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGCTT
SmilChr04G001496 Chr04 NC_080390.1:24520707-24520718promoter 内 508-519 bp + 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 24511870-24517225(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGACA
SmilChr04G000635 Chr04 NC_080390.1:7218139-7218150promoter 内 475-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7211092-7214624(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCT
SmilChr06G003052 Chr06 NC_080392.1:43415838-43415849promoter 内 475-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43410461-43412323(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAGCACGCCATC
SmilChr01G001418 Chr01 NC_080387.1:27771067-27771078promoter 内 460-471 bp - 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27763875-27767537(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AACCACGCCACC
SmilChr03G004154 Chr03 NC_080389.1:60339348-60339359promoter 内 423-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60330852-60335781(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTGCACGCCATA
SmilChr05G000571 Chr05 NC_080391.1:4301573-4301584promoter 内 391-402 bp + 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4297118-4297974(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTGGCGTGACA
SmilChr05G001316 Chr05 NC_080391.1:11327456-11327467promoter 内 337-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 11323731-11323803(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGCTT
SmilChr01G002863 Chr01 NC_080387.1:47218422-47218433promoter 内 335-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47222088-47227943(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCTCACGCCACA
SmilChr02G003123 Chr02 NC_080388.1:52228701-52228712promoter 内 250-261 bp - 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52232452-52238966(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGGTT
SmilChr06G000757 Chr06 NC_080392.1:7028944-7028955promoter 内 224-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7022721-7025178(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTGCACGCCATG
SmilChr08G002828 Chr08 NC_080394.1:28127230-28127241promoter 内 224-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28131007-28136192(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGCTC
SmilChr03G004603 Chr03 NC_080389.1:63803591-63803602promoter 内 222-233 bp + 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63807370-63815364(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAGCACGCCATG
SmilChr02G003063 Chr02 NC_080388.1:51473132-51473143promoter 内 219-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51462837-51469361(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGGTT
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73174494-73174505promoter 内 177-188 bp + 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 73168441-73170681(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTGGCGTGATG
SmilChr07G001073 Chr07 NC_080393.1:7894773-7894784promoter 内 107-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7898667-7902573(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTCCACGCCACA
SmilChr03G002760 Chr03 NC_080389.1:43886343-43886354promoter 内 88-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43880518-43882441(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGCAA
SmilChr06G000692 Chr06 NC_080392.1:6124756-6124767promoter 内 11-22 bp + 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6128746-6132215(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCCCACGCCACT
SmilChr07G001062 Chr07 NC_080393.1:7823255-7823266promoter 内 2030-2041 bp - 1960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 7825226-7828255(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTTGCGTGTTA
SmilChr05G000317 Chr05 NC_080391.1:2377429-2377440promoter 内 3899-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 2377531-2379708(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATT
SmilChr03G001125 Chr03 NC_080389.1:12952372-12952383promoter 内 3822-3833 bp + 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 12952551-12958573(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATT
SmilChr04G000564 Chr04 NC_080390.1:6292162-6292173promoter 内 3648-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 6287465-6291820(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AAACACGCCATG
SmilChr08G001465 Chr08 NC_080394.1:11803349-11803360promoter 内 3236-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 11795788-11802595(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAGCACGCCATA
SmilChr03G004172 Chr03 NC_080389.1:60464498-60464509promoter 内 3204-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 60465295-60467056(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTCA
SmilChr02G003414 Chr02 NC_080388.1:55336083-55336094promoter 内 2937-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 55337147-55338223(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTTGCGTGTTC
SmilChr07G001091 Chr07 NC_080393.1:8024972-8024983promoter 内 1780-1791 bp - 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 8027193-8030686(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTTC
SmilChr01G000107 Chr01 NC_080387.1:1848358-1848369promoter 内 1608-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 1850751-1852521(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTTG
SmilChr02G005013 Chr02 NC_080388.1:71933495-71933506promoter 内 777-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 71921805-71930282(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTTGCGTGTTG
SmilChr02G003093 Chr02 NC_080388.1:51795667-51795678promoter 内 721-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 51789092-51792398(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTTC
SmilChr02G005017 Chr02 NC_080388.1:71933495-71933506promoter 内 605-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 71936891-71942377(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAACACGCAACA
SmilChr06G003152 Chr06 NC_080392.1:44529244-44529255promoter 内 516-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 44522686-44525770(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATT
SmilChr05G000284 Chr05 NC_080391.1:2200785-2200796promoter 内 435-446 bp - 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 2193001-2197230(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATT
SmilChr05G000219 Chr05 NC_080391.1:1716265-1716276promoter 内 306-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 1710197-1712581(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATT
SmilChr04G000729 Chr04 NC_080390.1:8615297-8615308promoter 内 261-272 bp + 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 8619037-8620930(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAACACGCAACA
SmilChr04G002260 Chr04 NC_080390.1:36575042-36575053promoter 内 115-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 36567529-36571167(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTAA
SmilChr04G001267 Chr04 NC_080390.1:20127586-20127597promoter 内 38-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 20118567-20123634(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTCA
SmilChr01G004555 Chr01 NC_080387.1:63645875-63645886promoter 内 3868-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 63646008-63646901(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTACACGCCATC
SmilChr08G000496 Chr08 NC_080394.1:3597392-3597403promoter 内 3818-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3595221-3597220(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCACACGCCATT
SmilChr06G000497 Chr06 NC_080392.1:4092230-4092241promoter 内 3798-3809 bp + 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4092433-4095893(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TACCACGCCACA
SmilChr08G002854 Chr08 NC_080394.1:28370218-28370229promoter 内 3685-3696 bp - 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28369842-28369913(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATT
SmilChr05G000316 Chr05 NC_080391.1:2377429-2377440promoter 内 3607-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2374217-2377046(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTTC
SmilChr08G002853 Chr08 NC_080394.1:28370218-28370229promoter 内 3502-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28369648-28369730(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATT
SmilChr08G002076 Chr08 NC_080394.1:18666590-18666601promoter 内 3427-3438 bp - 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 18667164-18669309(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTTGCGTGTTG
SmilChr06G001710 Chr06 NC_080392.1:19667942-19667953promoter 内 3270-3281 bp + 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 19666258-19667222(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTTT