转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 68 / 151 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002616 Chr04 NC_080390.1:41581074-41581086promoter 内 1236-1248 bp + 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41571501-41578321(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTACA
SmilChr03G001265 Chr03 NC_080389.1:14649305-14649317promoter 内 1208-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14645299-14646524(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTAAT
SmilChr01G006045 Chr01 NC_080387.1:75957565-75957577promoter 内 952-964 bp + 3037 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 75960614-75962698(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCTTG
SmilChr05G001974 Chr05 NC_080391.1:20384144-20384156promoter 内 838-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20380018-20380993(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTTGG
SmilChr03G000700 Chr03 NC_080389.1:7829179-7829191promoter 内 837-849 bp + 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7818304-7826027(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTGTA
SmilChr01G003923 Chr01 NC_080387.1:57477189-57477201promoter 内 805-817 bp + 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57480385-57485705(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCACT
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66263381-66263393promoter 内 785-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 66266597-66270367(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTGTG
SmilChr02G002255 Chr02 NC_080388.1:39978574-39978586promoter 内 633-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39981942-39983388(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCACA
SmilChr04G001194 Chr04 NC_080390.1:18271460-18271472promoter 内 257-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18275204-18281066(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATCAT
SmilChr02G002259 Chr02 NC_080388.1:40029029-40029041promoter 内 254-266 bp - 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40022937-40025294(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCCAC
SmilChr03G003464 Chr03 NC_080389.1:53049970-53049982promoter 内 135-147 bp + 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53053836-53056129(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTATA
SmilChr05G001485 Chr05 NC_080391.1:13624351-13624363promoter 内 86-98 bp + 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13619180-13620448(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTTAC
SmilChr02G001175 Chr02 NC_080388.1:21582035-21582047promoter 内 3951-3963 bp - 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 21579250-21581997(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCAGC
SmilChr02G003106 Chr02 NC_080388.1:51983706-51983718promoter 内 3906-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 51983801-52028202(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATATGTAGGTAAG
SmilChr05G000813 Chr05 NC_080391.1:6338193-6338205promoter 内 3709-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 6336534-6337913(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCTT
SmilChr02G002352 Chr02 NC_080388.1:41311893-41311905promoter 内 3683-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 41309914-41311587(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGTC
SmilChr01G004916 Chr01 NC_080387.1:67195503-67195515promoter 内 3602-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 67193509-67195116(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATATGTAGGTAGG
SmilChr03G003895 Chr03 NC_080389.1:58053607-58053619promoter 内 3340-3352 bp - 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 58050988-58052958(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACATAT
SmilChr03G003683 Chr03 NC_080389.1:55678934-55678946promoter 内 3300-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 55679635-55681221(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACATAT
SmilChr02G002926 Chr02 NC_080388.1:49665479-49665491promoter 内 3270-3282 bp + 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 49666210-49667026(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTTTT
SmilChr01G003469 Chr01 NC_080387.1:53235648-53235660promoter 内 3102-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 53236547-53239556(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCGGTAGGTTGG
SmilChr02G005185 Chr02 NC_080388.1:73166976-73166988promoter 内 3086-3098 bp - 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 73167891-73170879(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTAGT
SmilChr01G001368 Chr01 NC_080387.1:27036136-27036148promoter 内 2652-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 27037485-27040166(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr05G000833 Chr05 NC_080391.1:6555271-6555283promoter 内 2580-2592 bp + 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 6556692-6557778(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTTGC
SmilChr02G002927 Chr02 NC_080388.1:49665479-49665491promoter 内 2298-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 49667182-49668027(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTTTT
SmilChr01G002328 Chr01 NC_080387.1:40437695-40437707promoter 内 940-952 bp + 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 40440756-40444375(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr05G000167 Chr05 NC_080391.1:1323413-1323425promoter 内 884-896 bp + 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 1326530-1330586(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr02G003717 Chr02 NC_080388.1:58782730-58782742promoter 内 850-862 bp + 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 58785881-58789816(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr03G004336 Chr03 NC_080389.1:61707349-61707361promoter 内 526-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 61697804-61703886(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTTGA
SmilChr05G000269 Chr05 NC_080391.1:2084552-2084564promoter 内 450-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 2057143-2081013(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTGC
SmilChr04G003698 Chr04 NC_080390.1:53346528-53346540promoter 内 427-439 bp - 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 53350102-53352148(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTTGA
SmilChr03G002027 Chr03 NC_080389.1:30395559-30395571promoter 内 270-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 30399290-30401540(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr03G003896 Chr03 NC_080389.1:58053607-58053619promoter 内 262-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 58057346-58057959(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATATGTAGGTAGG
SmilChr04G000464 Chr04 NC_080390.1:4949489-4949501promoter 内 71-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 4953419-4958842(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTGGTAGGTACC
SmilChr03G004493 Chr03 NC_080389.1:63052481-63052493promoter 内 48-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 63045233-63048540(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTCTC
SmilChr02G004498 Chr02 NC_080388.1:67485851-67485863promoter 内 3974-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 67482937-67485836(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr02G004499 Chr02 NC_080388.1:67494659-67494671promoter 内 3974-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 67491753-67494644(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr03G001165 Chr03 NC_080389.1:13422773-13422785promoter 内 3954-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13422820-13425557(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr04G001203 Chr04 NC_080390.1:18487118-18487130promoter 内 3942-3954 bp + 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18486454-18487071(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAATTAGGTAAC
SmilChr03G001164 Chr03 NC_080389.1:13414072-13414084promoter 内 3941-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13414132-13416298(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr03G001166 Chr03 NC_080389.1:13427863-13427875promoter 内 3941-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13427923-13430668(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr03G001167 Chr03 NC_080389.1:13436576-13436588promoter 内 3941-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13436636-13439364(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr01G000396 Chr01 NC_080387.1:8138494-8138506promoter 内 3834-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 8138661-8141454(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCAC
SmilChr05G000187 Chr05 NC_080391.1:1573201-1573213promoter 内 3829-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1499834-1573041(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATATGTAGGTAAG
SmilChr02G002684 Chr02 NC_080388.1:46499479-46499491promoter 内 3813-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46492875-46499303(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCACT
SmilChr03G001693 Chr03 NC_080389.1:22446606-22446618promoter 内 3766-3778 bp + 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22446841-22447502(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACCTT
SmilChr04G000751 Chr04 NC_080390.1:9206032-9206044promoter 内 3571-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9206462-9207454(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTTG
SmilChr03G003876 Chr03 NC_080389.1:57877963-57877975promoter 内 3527-3539 bp + 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57873352-57877501(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTTAA
SmilChr02G001733 Chr02 NC_080388.1:31862359-31862371promoter 内 3359-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31863001-31863504(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr04G003620 Chr04 NC_080390.1:52690620-52690632promoter 内 3163-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52691458-52695462(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACTT