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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 7 / 160 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004396 Chr05 NC_080391.1:57387605-57387615promoter 内 2797-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 57388809-57390341(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCG
SmilChr02G001729 Chr02 NC_080388.1:31783374-31783384promoter 内 3917-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 31783458-31786897(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr03G001123 Chr03 NC_080389.1:12933793-12933803promoter 内 1933-1943 bp + 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 12930762-12931735(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGGTTACGTAT
SmilChr05G001286 Chr05 NC_080391.1:11001029-11001039promoter 内 1658-1668 bp - 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 11003372-11005941(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTGC
SmilChr03G003980 Chr03 NC_080389.1:58821264-58821274promoter 内 1148-1158 bp + 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 58815363-58818421(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGGTTACGTAT
SmilChr02G000683 Chr02 NC_080388.1:10785094-10785104promoter 内 682-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 10780977-10781785(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTGG
SmilChr02G000062 Chr02 NC_080388.1:772806-772816promoter 内 338-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 776469-779675(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr02G002538 Chr02 NC_080388.1:44159856-44159866promoter 内 3950-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 44159907-44165662(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTGG
SmilChr01G006082 Chr01 NC_080387.1:76278299-76278309promoter 内 3370-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 76278930-76279670(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTGC
SmilChr03G001124 Chr03 NC_080389.1:12933793-12933803promoter 内 3226-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 12934568-12937249(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCG
SmilChr05G003233 Chr05 NC_080391.1:41486434-41486444promoter 内 3024-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 41487411-41488971(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr02G000008 Chr02 NC_080388.1:66234-66244promoter 内 2838-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63884-65081(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTGC
SmilChr02G003603 Chr02 NC_080388.1:57278220-57278230promoter 内 2767-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 57275427-57276996(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCG
SmilChr04G001457 Chr04 NC_080390.1:23980393-23980403promoter 内 2652-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 23974953-23979054(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTGG
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39907221-39907231promoter 内 2369-2379 bp + 1622 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 39908853-39912236(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr02G001736 Chr02 NC_080388.1:31935784-31935794promoter 内 2136-2146 bp + 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 31937649-31939943(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr01G004566 Chr01 NC_080387.1:63734114-63734124promoter 内 1964-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63727451-63732087(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGGTTACGTAT
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SmilChr02G002537 Chr02 NC_080388.1:44159856-44159866promoter 内 1322-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 44154115-44157187(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAACCT
SmilChr05G002443 Chr05 NC_080391.1:26919128-26919138promoter 内 955-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 26911650-26916092(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTGC
SmilChr01G006084 Chr01 NC_080387.1:76278299-76278309promoter 内 208-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 76282092-76285016(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTGC
SmilChr05G000270 Chr05 NC_080391.1:2077943-2077953promoter 内 27-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 2081917-2082791(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAACCA
SmilChr05G003878 Chr05 NC_080391.1:52365564-52365574promoter 内 2750-2760 bp + 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 52366815-52368698(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACCC
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SmilChr01G002332 Chr01 NC_080387.1:40467257-40467267promoter 内 972-982 bp + 3019 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 40470286-40471841(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACCC
SmilChr05G001360 Chr05 NC_080391.1:12103914-12103924promoter 内 3955-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12100982-12103878(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAACGT
SmilChr05G002839 Chr05 NC_080391.1:33722128-33722138promoter 内 3790-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 33722339-33727669(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGCG
SmilChr04G002715 Chr04 NC_080390.1:42762536-42762546promoter 内 3758-3768 bp + 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 42760769-42762303(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGGTTACGTGA
SmilChr05G004031 Chr05 NC_080391.1:54307547-54307557promoter 内 3750-3760 bp - 241 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54307798-54307992(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGT
SmilChr02G001599 Chr02 NC_080388.1:29824723-29824733promoter 内 3462-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 29825262-29827982(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGCTTACGTGT
SmilChr05G004032 Chr05 NC_080391.1:54307547-54307557promoter 内 2898-2908 bp - 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54308650-54308810(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGT
SmilChr01G005365 Chr01 NC_080387.1:70877509-70877519promoter 内 2778-2788 bp + 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 70873447-70876296(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGGTTACGTGA
SmilChr01G002564 Chr01 NC_080387.1:43766595-43766605promoter 内 1735-1745 bp + 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 43760740-43764339(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGGTTACGTGA
SmilChr02G000527 Chr02 NC_080388.1:7246176-7246186promoter 内 1641-1651 bp - 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7248536-7248813(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGT
SmilChr05G004033 Chr05 NC_080391.1:54307547-54307557promoter 内 1383-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54310165-54311880(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGT
SmilChr01G002331 Chr01 NC_080387.1:40467257-40467267promoter 内 742-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 40459444-40464008(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGGTTACGTGA
SmilChr05G001361 Chr05 NC_080391.1:12103914-12103924promoter 内 188-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12107727-12108395(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGT
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SmilChr05G003557 Chr05 NC_080391.1:47502448-47502458promoter 内 2908-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 47503541-47505664(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCG
SmilChr05G003556 Chr05 NC_080391.1:47476094-47476104promoter 内 2824-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 47477271-47479136(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCG
SmilChr03G000560 Chr03 NC_080389.1:6088999-6089009promoter 内 577-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 6092423-6094576(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCG
SmilChr01G000806 Chr01 NC_080387.1:17438392-17438402promoter 内 368-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 17431542-17434769(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAGTTACGTGA
SmilChr03G001867 Chr03 NC_080389.1:25821425-25821435promoter 内 3538-3548 bp - 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 25821888-25823864(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAGTTACGTGA
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SmilChr06G000496 Chr06 NC_080392.1:4078965-4078975promoter 内 2083-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4070653-4077057(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTG