转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 70 / 151 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003549 Chr03 NC_080389.1:54119852-54119864promoter 内 3398-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 54115533-54119261(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCTA
SmilChr04G003192 Chr04 NC_080390.1:48664629-48664641promoter 内 3219-3231 bp + 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 48655414-48663859(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATGTAGGTAAC
SmilChr04G000178 Chr04 NC_080390.1:1586611-1586623promoter 内 2821-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1587791-1589203(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGTG
SmilChr02G004636 Chr02 NC_080388.1:68820190-68820202promoter 内 2631-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 68821560-68828980(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTAGT
SmilChr02G001229 Chr02 NC_080388.1:22590888-22590900promoter 内 2625-2637 bp - 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 22584075-22589524(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAA
SmilChr01G003214 Chr01 NC_080387.1:50939650-50939662promoter 内 2159-2171 bp + 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 50926238-50937820(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGG
SmilChr03G002257 Chr03 NC_080389.1:35528648-35528660promoter 内 1581-1593 bp - 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 35522220-35526240(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTTG
SmilChr01G004404 Chr01 NC_080387.1:62149959-62149971promoter 内 1522-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 62144212-62147492(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTTGTAGGTAGG
SmilChr02G000094 Chr02 NC_080388.1:1236754-1236766promoter 内 1498-1510 bp - 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1230404-1234263(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCCAA
SmilChr04G000176 Chr04 NC_080390.1:1586611-1586623promoter 内 1392-1404 bp + 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1581190-1584014(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTAGT
SmilChr04G002350 Chr04 NC_080390.1:37940221-37940233promoter 内 1213-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 37943009-37947546(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCGTTAGGTAAC
SmilChr02G000124 Chr02 NC_080388.1:1692175-1692187promoter 内 838-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1695338-1700632(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCCAA
SmilChr01G001299 Chr01 NC_080387.1:25856095-25856107promoter 内 584-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 25859512-25865599(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTAGT
SmilChr03G001671 Chr03 NC_080389.1:21757198-21757210promoter 内 425-437 bp - 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 21760774-21764204(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGG
SmilChr03G001707 Chr03 NC_080389.1:22664715-22664727promoter 内 319-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 22668397-22671563(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGG
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53605617-53605629promoter 内 297-309 bp + 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 53600462-53601925(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCGAG
SmilChr01G000311 Chr01 NC_080387.1:6023038-6023050promoter 内 254-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 6017775-6019303(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATGTAGGTAAC
SmilChr02G001090 Chr02 NC_080388.1:19615124-19615136promoter 内 121-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 19610036-19611256(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAAGTAGGTACA
SmilChr02G002389 Chr02 NC_080388.1:41819244-41819256promoter 内 3845-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 41817003-41819100(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAACCTACCAAA
SmilChr01G001483 Chr01 NC_080387.1:28602469-28602481promoter 内 3688-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28601175-28602168(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCCTA
SmilChr03G000203 Chr03 NC_080389.1:2298009-2298021promoter 内 3671-3683 bp - 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2298339-2302432(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGG
SmilChr02G001341 Chr02 NC_080388.1:24988667-24988679promoter 内 3650-3662 bp + 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24989018-24994857(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTTG
SmilChr02G003361 Chr02 NC_080388.1:54742229-54742241promoter 内 3637-3649 bp - 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54742593-54743716(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTTGTAGGTAAG
SmilChr03G002158 Chr03 NC_080389.1:33605706-33605718promoter 内 3635-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33606072-33607171(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCGAC
SmilChr05G001099 Chr05 NC_080391.1:9152311-9152323promoter 内 3527-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 9152785-9157046(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTGGTAGGTGTA
SmilChr01G003280 Chr01 NC_080387.1:51491819-51491831promoter 内 3525-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51492295-51495595(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTAGT
SmilChr01G001848 Chr01 NC_080387.1:33419790-33419802promoter 内 3484-3496 bp + 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33420307-33422898(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACATTG
SmilChr03G000571 Chr03 NC_080389.1:6220709-6220721promoter 内 3310-3322 bp - 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6217100-6220030(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGTG
SmilChr02G003279 Chr02 NC_080388.1:54082995-54083007promoter 内 3297-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54083699-54084713(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGGTAGGTGGT
SmilChr01G000536 Chr01 NC_080387.1:10994118-10994130promoter 内 3183-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10993207-10993312(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTTG
SmilChr01G002468 Chr01 NC_080387.1:42400959-42400971promoter 内 3119-3131 bp + 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 42401841-42404048(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAA
SmilChr01G004310 Chr01 NC_080387.1:61277243-61277255promoter 内 3054-3066 bp + 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 61278190-61287644(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACAAAT
SmilChr02G004675 Chr02 NC_080388.1:69104905-69104917promoter 内 3041-3053 bp - 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69103412-69103957(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAA
SmilChr01G003279 Chr01 NC_080387.1:51491819-51491831promoter 内 3019-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51489904-51490849(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGTG
SmilChr05G001859 Chr05 NC_080391.1:18623175-18623187promoter 内 2721-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 18617954-18621907(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGTGTAGGTAAG
SmilChr05G001473 Chr05 NC_080391.1:13506899-13506911promoter 内 2681-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 13502916-13505591(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACCTGA
SmilChr02G001518 Chr02 NC_080388.1:28293115-28293127promoter 内 2617-2629 bp - 1372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28294499-28302957(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAAGTAGGTACA
SmilChr01G001059 Chr01 NC_080387.1:21914099-21914111promoter 内 2526-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 21911660-21912636(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCGCCTACCTCT
SmilChr04G003719 Chr04 NC_080390.1:53538694-53538706promoter 内 2202-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53540493-53543900(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACCTAA
SmilChr03G003661 Chr03 NC_080389.1:55431797-55431809promoter 内 1914-1926 bp + 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55427047-55429722(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCGGG
SmilChr01G004057 Chr01 NC_080387.1:59007295-59007307promoter 内 1880-1892 bp - 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59009416-59013737(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATTGTAGGTAGG
SmilChr02G000663 Chr02 NC_080388.1:10183401-10183413promoter 内 1876-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10185526-10188071(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGG
SmilChr03G001670 Chr03 NC_080389.1:21757198-21757210promoter 内 1854-1866 bp - 2135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 21751607-21755063(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAA
SmilChr05G001399 Chr05 NC_080391.1:12586985-12586997promoter 内 1804-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 12589182-12590243(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCAGTAGGTAAA
SmilChr04G003477 Chr04 NC_080390.1:51229814-51229826promoter 内 1769-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51232046-51234859(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTATT
SmilChr01G004219 Chr01 NC_080387.1:60580518-60580530promoter 内 1750-1762 bp - 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 60576167-60578279(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACAATG
SmilChr01G003937 Chr01 NC_080387.1:57689804-57689816promoter 内 1583-1595 bp + 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57685818-57687398(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTATG
SmilChr05G000689 Chr05 NC_080391.1:5217699-5217711promoter 内 1448-1460 bp + 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5220252-5224104(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCAAG
SmilChr04G000824 Chr04 NC_080390.1:10344711-10344723promoter 内 1252-1264 bp - 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10332171-10341974(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTAT
SmilChr02G000319 Chr02 NC_080388.1:4002035-4002047promoter 内 1173-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4004863-4005674(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAA