转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 71 / 143 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000099 Chr06 NC_080392.1:711426-711437promoter 内 1044-1055 bp + 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 707805-708480(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTA
SmilChr03G004366 Chr03 NC_080389.1:61869954-61869965promoter 内 553-564 bp - 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61873402-61882230(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr03G004508 Chr03 NC_080389.1:63179514-63179525promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63170609-63176044(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr05G001572 Chr05 NC_080391.1:14392418-14392429promoter 内 260-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14386774-14388688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr06G000098 Chr06 NC_080392.1:711426-711437promoter 内 133-144 bp + 3857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 704306-707569(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTA
SmilChr02G001549 Chr02 NC_080388.1:28785563-28785574promoter 内 3665-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 28779199-28785238(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr04G003413 Chr04 NC_080390.1:50766515-50766526promoter 内 667-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 50755390-50763192(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCTG
SmilChr02G003160 Chr02 NC_080388.1:52650360-52650371promoter 内 3548-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 52650813-52654043(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTG
SmilChr04G003766 Chr04 NC_080390.1:53894721-53894732promoter 内 3286-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 53895436-53896342(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAT
SmilChr01G005539 Chr01 NC_080387.1:72225130-72225141promoter 内 2987-2998 bp - 1003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 72226144-72227093(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATC
SmilChr07G000411 Chr07 NC_080393.1:2834892-2834903promoter 内 1683-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 2837210-2848285(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr02G000698 Chr02 NC_080388.1:11121564-11121575promoter 内 1614-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 11114974-11119188(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCTA
SmilChr06G002915 Chr06 NC_080392.1:42005549-42005560promoter 内 1408-1419 bp - 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 42008142-42010432(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGC
SmilChr06G000269 Chr06 NC_080392.1:1821300-1821311promoter 内 1137-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1824164-1824278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAT
SmilChr01G002046 Chr01 NC_080387.1:36219796-36219807promoter 内 1069-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 36222728-36223768(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATC
SmilChr01G005480 Chr01 NC_080387.1:71781800-71781811promoter 内 821-832 bp - 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 71775356-71778631(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr01G001668 Chr01 NC_080387.1:30782457-30782468promoter 内 569-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 30777945-30779036(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGAG
SmilChr05G002133 Chr05 NC_080391.1:22419079-22419090promoter 内 254-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 22422826-22424163(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTA
SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53894721-53894732promoter 内 146-157 bp - 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 53898576-53900830(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAT
SmilChr04G000042 Chr04 NC_080390.1:409943-409954promoter 内 3975-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 409969-412055(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr05G002318 Chr05 NC_080391.1:24996657-24996668promoter 内 3956-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24994515-24996623(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCC
SmilChr05G002082 Chr05 NC_080391.1:21751711-21751722promoter 内 3931-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 21746217-21751652(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr04G003752 Chr04 NC_080390.1:53796053-53796064promoter 内 3882-3893 bp + 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53796172-53797181(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGC
SmilChr06G002914 Chr06 NC_080392.1:42005549-42005560promoter 内 3858-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 42002592-42005417(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAC
SmilChr04G002459 Chr04 NC_080390.1:39413117-39413128promoter 内 3840-3851 bp + 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39412281-39412967(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr04G000041 Chr04 NC_080390.1:409943-409954promoter 内 3820-3831 bp - 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 397358-409773(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr05G001023 Chr05 NC_080391.1:8394781-8394792promoter 内 3601-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8393853-8394392(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGAG
SmilChr02G003026 Chr02 NC_080388.1:50929341-50929352promoter 内 3581-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 50925664-50928932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTG
SmilChr03G001058 Chr03 NC_080389.1:12290835-12290846promoter 内 3505-3516 bp - 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 12287789-12290350(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43605154-43605165promoter 内 3403-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43605752-43610948(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGAG
SmilChr02G000295 Chr02 NC_080388.1:3747005-3747016promoter 内 3349-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3745654-3746364(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr01G000072 Chr01 NC_080387.1:1235151-1235162promoter 内 3270-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1235882-1236703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCC
SmilChr04G002583 Chr04 NC_080390.1:41216663-41216674promoter 内 3226-3237 bp + 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 41211800-41215899(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGT
SmilChr04G002286 Chr04 NC_080390.1:37146140-37146151promoter 内 3171-3182 bp - 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37136204-37145321(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr03G002812 Chr03 NC_080389.1:44586346-44586357promoter 内 3170-3181 bp + 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44587177-44590718(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr04G003416 Chr04 NC_080390.1:50766515-50766526promoter 内 3152-3163 bp - 838 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 50765606-50765677(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCTG
SmilChr06G000410 Chr06 NC_080392.1:3386919-3386930promoter 内 3114-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3387806-3390540(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCAA
SmilChr02G000384 Chr02 NC_080388.1:4792994-4793005promoter 内 3034-3045 bp - 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4793961-4795480(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGT
SmilChr02G000343 Chr02 NC_080388.1:4469093-4469104promoter 内 2887-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4470207-4470950(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAT
SmilChr04G000859 Chr04 NC_080390.1:10902575-10902586promoter 内 2834-2845 bp + 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10903742-10905247(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCAT
SmilChr08G000044 Chr08 NC_080394.1:291272-291283promoter 内 2804-2815 bp - 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 288764-290086(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGC
SmilChr04G000053 Chr04 NC_080390.1:466667-466678promoter 内 2704-2715 bp - 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 467964-474356(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr01G005531 Chr01 NC_080387.1:72167192-72167203promoter 内 2527-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 72162633-72165729(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAT
SmilChr01G004103 Chr01 NC_080387.1:59507211-59507222promoter 内 2482-2493 bp - 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59503982-59505703(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGC
SmilChr06G003083 Chr06 NC_080392.1:43704357-43704368promoter 内 2457-2468 bp - 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43702136-43702824(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCAT
SmilChr07G001714 Chr07 NC_080393.1:14564377-14564388promoter 内 2380-2391 bp - 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14551315-14562767(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTG
SmilChr05G003960 Chr05 NC_080391.1:53330647-53330658promoter 内 2379-2390 bp - 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53332269-53333071(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAT
SmilChr01G000911 Chr01 NC_080387.1:19232534-19232545promoter 内 2374-2385 bp + 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 19229491-19230918(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAT
SmilChr02G003148 Chr02 NC_080388.1:52508263-52508274promoter 内 2370-2381 bp + 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52505293-52506643(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGT
SmilChr05G004269 Chr05 NC_080391.1:56474900-56474911promoter 内 2357-2368 bp - 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56468369-56473267(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCTG