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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 71 / 141 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001906 Chr01 NC_080387.1:34153221-34153235promoter 内 1142-1156 bp - 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34149806-34150376(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAACGTCGGTGCGGT
SmilChr02G003035 Chr02 NC_080388.1:51054498-51054512promoter 内 1058-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51057441-51058186(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTTG
SmilChr04G000320 Chr04 NC_080390.1:2917823-2917837promoter 内 879-893 bp - 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2920945-2921988(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACTCCC
SmilChr04G001330 Chr04 NC_080390.1:21488004-21488018promoter 内 861-875 bp - 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 21480745-21484878(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTACGTCGGTGCCGA
SmilChr05G000127 Chr05 NC_080391.1:1018045-1018059promoter 内 836-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1021210-1024350(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAACACCGACAAAT
SmilChr08G002107 Chr08 NC_080394.1:18932564-18932578promoter 内 727-741 bp - 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 18926376-18929304(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGGAGTCGGTGGTTG
SmilChr05G001705 Chr05 NC_080391.1:16285145-16285159promoter 内 720-734 bp + 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 16288426-16289947(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGCAGCGC
SmilChr03G003486 Chr03 NC_080389.1:53451822-53451836promoter 内 671-685 bp + 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53431695-53448506(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCCACCGACTCCA
SmilChr01G004797 Chr01 NC_080387.1:66192585-66192599promoter 内 639-653 bp - 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 66195947-66196019(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCCCACCGACGGTC
SmilChr01G001736 Chr01 NC_080387.1:31960443-31960457promoter 内 638-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31955859-31957094(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCCCCACCGACTCTC
SmilChr08G003125 Chr08 NC_080394.1:31584760-31584774promoter 内 592-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31588169-31595354(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGACGTCGGTGACAA
SmilChr08G000525 Chr08 NC_080394.1:3828997-3829011promoter 内 565-579 bp - 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3823260-3825575(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCGTCGGTGAACG
SmilChr01G003573 Chr01 NC_080387.1:54299746-54299760promoter 内 510-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54294405-54296269(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTCCACCGACGAGA
SmilChr02G002352 Chr02 NC_080388.1:41315129-41315143promoter 内 445-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41309914-41311587(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGACGTCGGTGACAA
SmilChr03G004092 Chr03 NC_080389.1:59810019-59810033promoter 内 426-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59803780-59806458(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGTGTCAT
SmilChr01G001858 Chr01 NC_080387.1:33539792-33539806promoter 内 409-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 33530858-33536214(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTAGCACCGACAAAT
SmilChr07G002376 Chr07 NC_080393.1:22124524-22124538promoter 内 407-421 bp + 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 22118335-22120944(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGACACCGACAAAC
SmilChr07G004413 Chr07 NC_080393.1:56753949-56753963promoter 内 351-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56748397-56750313(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCGTCGGTGAACG
SmilChr02G005256 Chr02 NC_080388.1:73667228-73667242promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 73663374-73663467(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTCCACCGACATGC
SmilChr01G002743 Chr01 NC_080387.1:45728626-45728640promoter 内 163-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45732464-45733904(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGCTTC
SmilChr03G000577 Chr03 NC_080389.1:6398049-6398063promoter 内 104-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6390720-6394166(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACGACCGACATAG
SmilChr02G005255 Chr02 NC_080388.1:73667228-73667242promoter 内 98-112 bp + 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 73663258-73663339(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTCCACCGACATGC
SmilChr04G002346 Chr04 NC_080390.1:37842709-37842723promoter 内 82-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 37846628-37847842(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGCCATCG
SmilChr01G000432 Chr01 NC_080387.1:8654177-8654191promoter 内 46-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8643226-8650236(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGATGGCGGTGGAGC
SmilChr05G004303 Chr05 NC_080391.1:56726334-56726348promoter 内 2276-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 5 56728059-56731931(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TACCCACCGACGGAC
SmilChr08G001225 Chr08 NC_080394.1:9896524-9896538promoter 内 1108-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 5 9892300-9893645(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TACCCACCGACGGAC
SmilChr02G001323 Chr02 NC_080388.1:24573139-24573153promoter 内 3277-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 4 24573863-24575193(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TACCCACCGACGGAC
SmilChr05G002294 Chr05 NC_080391.1:24772737-24772751promoter 内 2423-2437 bp - 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 4 24774315-24776394(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TACCCACCGACGGAC
SmilChr07G004657 Chr07 NC_080393.1:59499130-59499144promoter 内 74-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 4 59493645-59495217(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTCCGTCGGTGGGTA
SmilChr08G000099 Chr08 NC_080394.1:615857-615871promoter 内 3179-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 616679-620221(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTACACCGACGATG
SmilChr08G000083 Chr08 NC_080394.1:478492-478506promoter 内 3158-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 479335-519461(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTACACCGACGATG
SmilChr02G002328 Chr02 NC_080388.1:40966250-40966264promoter 内 2990-3004 bp + 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 40967261-40967923(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGAGTCGGTGGAGA
SmilChr08G000079 Chr08 NC_080394.1:460526-460540promoter 内 2878-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 461649-462395(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTACACCGACGATG
SmilChr06G000332 Chr06 NC_080392.1:2479927-2479941promoter 内 1897-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 2482031-2484034(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCACACCGACAGAT
SmilChr03G000526 Chr03 NC_080389.1:5638342-5638356promoter 内 1465-1479 bp + 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 5640878-5642924(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGCCGTCGGTGATTA
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SmilChr01G005064 Chr01 NC_080387.1:68542895-68542909promoter 内 3010-3024 bp + 977 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 68537871-68541918(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCACACCGACAAAT
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SmilChr01G003529 Chr01 NC_080387.1:53921172-53921186promoter 内 2758-2772 bp + 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 53922415-53926705(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCATGTCGGTGGTAA
SmilChr04G000323 Chr04 NC_080390.1:2938184-2938198promoter 内 2610-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 2935453-2936807(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GATTGTCGGTGATTT
SmilChr04G002650 Chr04 NC_080390.1:41863357-41863371promoter 内 2353-2367 bp + 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 41854998-41861723(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAATCACCGACAATC
SmilChr01G001292 Chr01 NC_080387.1:25696709-25696723promoter 内 2162-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 25698548-25699466(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATTCACCGACGAAT
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SmilChr08G003554 Chr08 NC_080394.1:38197028-38197042promoter 内 1866-1880 bp - 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 38199163-38201868(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGACACCGACGAGG
SmilChr05G002723 Chr05 NC_080391.1:31325428-31325442promoter 内 1669-1683 bp + 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 31327760-31329105(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTTGGCGGTGGAGG
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SmilChr05G001840 Chr05 NC_080391.1:18459096-18459110promoter 内 732-746 bp + 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 18462365-18467725(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGTGGCGGTGGACG