转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 75 / 151 下载 TSV

上一页 75 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003219 Chr02 NC_080388.1:53362692-53362704promoter 内 680-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53366013-53373533(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTATTAGGTAAA
SmilChr02G001432 Chr02 NC_080388.1:27023268-27023280promoter 内 649-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27026620-27037270(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACTCA
SmilChr04G003749 Chr04 NC_080390.1:53768061-53768073promoter 内 373-385 bp - 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53771689-53775979(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTATTAGGTAAC
SmilChr03G001526 Chr03 NC_080389.1:18933138-18933150promoter 内 365-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18936774-18940438(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATTA
SmilChr01G002857 Chr01 NC_080387.1:47160560-47160572promoter 内 331-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47154333-47156902(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACACA
SmilChr04G000579 Chr04 NC_080390.1:6447210-6447222promoter 内 291-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6441485-6443512(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCCAT
SmilChr04G000869 Chr04 NC_080390.1:11197449-11197461promoter 内 228-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10980515-11193688(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAACCTACCTAG
SmilChr01G003344 Chr01 NC_080387.1:52220945-52220957promoter 内 192-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 52214949-52217148(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATAGA
SmilChr04G004042 Chr04 NC_080390.1:55658247-55658259promoter 内 169-181 bp + 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55647357-55654427(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGTTAGGTAAT
SmilChr01G006013 Chr01 NC_080387.1:75724386-75724398promoter 内 98-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75719970-75720495(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATGTAGGTAAA
SmilChr02G001312 Chr02 NC_080388.1:24351585-24351597promoter 内 70-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24346163-24347666(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATAAA
SmilChr01G005593 Chr01 NC_080387.1:72576916-72576928promoter 内 63-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72572491-72572990(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAAATC
SmilChr01G000378 Chr01 NC_080387.1:7779792-7779804promoter 内 35-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7783758-7787536(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAT
SmilChr02G003665 Chr02 NC_080388.1:58040906-58040918promoter 内 17-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 58044890-58052071(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATCA
SmilChr02G000469 Chr02 NC_080388.1:6347512-6347524promoter 内 14-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6341401-6343537(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTTAGGTAAT
SmilChr03G003708 Chr03 NC_080389.1:56019488-56019500promoter 内 1772-1784 bp + 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 56021717-56025599(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTGCA
SmilChr01G005444 Chr01 NC_080387.1:71539299-71539311promoter 内 1042-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 71530944-71536352(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAGA
SmilChr05G000697 Chr05 NC_080391.1:5263794-5263806promoter 内 3975-3987 bp + 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 5263707-5263780(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATGTAGGTAAC
SmilChr03G003007 Chr03 NC_080389.1:46897757-46897769promoter 内 1617-1629 bp - 2372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 46900141-46909143(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGTGTAGGTAGC
SmilChr02G000021 Chr02 NC_080388.1:168973-168985promoter 内 1609-1621 bp - 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 162502-166593(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACA
SmilChr01G006175 Chr01 NC_080387.1:77264809-77264821promoter 内 380-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 77258619-77261200(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr02G004837 Chr02 NC_080388.1:70495416-70495428promoter 内 360-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 70490461-70491787(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G000738 Chr04 NC_080390.1:8947137-8947149promoter 内 269-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8950869-8952636(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCATA
SmilChr02G005417 Chr02 NC_080388.1:74635837-74635849promoter 内 191-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 74626092-74632039(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCACCTACCATT
SmilChr05G000257 Chr05 NC_080391.1:1975392-1975404promoter 内 3894-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1971415-1975297(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACACCG
SmilChr02G003390 Chr02 NC_080388.1:55023597-55023609promoter 内 3818-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55023780-55031918(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATGCA
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24934477-24934489promoter 内 3813-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 24933517-24934301(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTATA
SmilChr04G002209 Chr04 NC_080390.1:35756035-35756047promoter 内 3813-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35755075-35755859(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTATA
SmilChr04G001259 Chr04 NC_080390.1:19862959-19862971promoter 内 3785-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19863175-19864535(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G003705 Chr04 NC_080390.1:53381816-53381828promoter 内 3783-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53376171-53381610(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACA
SmilChr02G001946 Chr02 NC_080388.1:35082829-35082841promoter 内 3702-3714 bp + 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35080855-35082542(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAAA
SmilChr01G000847 Chr01 NC_080387.1:18314249-18314261promoter 内 3699-3711 bp + 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18314551-18321642(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACA
SmilChr03G002662 Chr03 NC_080389.1:42280413-42280425promoter 内 3665-3677 bp + 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42280749-42283805(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACA
SmilChr02G000573 Chr02 NC_080388.1:8117684-8117696promoter 内 3654-3666 bp - 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8118031-8119196(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G001258 Chr04 NC_080390.1:19852015-19852027promoter 内 3654-3666 bp - 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19852362-19853591(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr03G001842 Chr03 NC_080389.1:25315344-25315356promoter 内 3604-3616 bp + 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 25315741-25323625(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCATA
SmilChr02G000797 Chr02 NC_080388.1:13201881-13201893promoter 内 3578-3590 bp + 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 13200323-13201470(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr01G000846 Chr01 NC_080387.1:18314249-18314261promoter 内 3558-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18312378-18313818(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAAA
SmilChr02G000796 Chr02 NC_080388.1:13190927-13190939promoter 内 3557-3569 bp + 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 13189369-13190495(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr01G003661 Chr01 NC_080387.1:55033088-55033100promoter 内 3555-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55031026-55032654(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAAA
SmilChr04G001024 Chr04 NC_080390.1:14363221-14363233promoter 内 3519-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14363703-14364842(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G001025 Chr04 NC_080390.1:14372650-14372662promoter 内 3519-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14373132-14374220(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr01G004540 Chr01 NC_080387.1:63545982-63545994promoter 内 3446-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63546537-63551510(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAC
SmilChr01G000969 Chr01 NC_080387.1:20529892-20529904promoter 内 3415-3427 bp + 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 20528323-20529318(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G001948 Chr04 NC_080390.1:31613406-31613418promoter 内 3314-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31614093-31614990(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr03G001009 Chr03 NC_080389.1:11571651-11571663promoter 内 3300-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11572352-11573228(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr04G003655 Chr04 NC_080390.1:53033178-53033190promoter 内 3300-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53033879-53036528(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAACA
SmilChr02G001692 Chr02 NC_080388.1:31211447-31211459promoter 内 3251-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31209946-31210709(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr02G001693 Chr02 NC_080388.1:31222420-31222432promoter 内 3251-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31220803-31221682(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr03G003941 Chr03 NC_080389.1:58478408-58478420promoter 内 3179-3191 bp + 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 58479230-58479915(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAC