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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 8 / 141 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004257 Chr02 NC_080388.1:64781272-64781286promoter 内 2126-2140 bp - 1861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 64783147-64783219(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGACAAAA
SmilChr01G005566 Chr01 NC_080387.1:72459364-72459378promoter 内 1814-1828 bp + 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 72451656-72457191(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATCACCGACAATG
SmilChr05G001115 Chr05 NC_080391.1:9299831-9299845promoter 内 1653-1667 bp + 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9291872-9297497(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCGCACCGACACCG
SmilChr07G000824 Chr07 NC_080393.1:5811568-5811582promoter 内 1598-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5806814-5809179(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGACAAAT
SmilChr04G002619 Chr04 NC_080390.1:41598361-41598375promoter 内 1433-1447 bp - 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 41600929-41605099(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGCCACCGACAAAG
SmilChr08G004277 Chr08 NC_080394.1:52335558-52335572promoter 内 1427-1441 bp + 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 52329578-52332998(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAGCCACCGACACTA
SmilChr04G002661 Chr04 NC_080390.1:42014880-42014894promoter 内 1406-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 42017475-42021643(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGCCACCGACAAAG
SmilChr05G003033 Chr05 NC_080391.1:38010864-38010878promoter 内 1207-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 38013658-38015986(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGTGTCGGTGCTGG
SmilChr07G004183 Chr07 NC_080393.1:53821874-53821888promoter 内 1202-1216 bp + 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 53816357-53819089(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTCCCACCGACACTG
SmilChr08G001228 Chr08 NC_080394.1:9899444-9899458promoter 内 871-885 bp + 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9902574-9902645(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr08G002832 Chr08 NC_080394.1:28191165-28191179promoter 内 684-698 bp + 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28194482-28206040(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTGTCGGCGGCGC
SmilChr06G001939 Chr06 NC_080392.1:23756694-23756708promoter 内 535-549 bp - 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 23749703-23753242(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTGGAGT
SmilChr08G001229 Chr08 NC_080394.1:9899444-9899458promoter 内 525-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9902920-9902991(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr04G002642 Chr04 NC_080390.1:41801228-41801242promoter 内 517-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 41804712-41806406(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTTGTCGGTGGAGA
SmilChr01G001647 Chr01 NC_080387.1:30536203-30536217promoter 内 342-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 30530273-30532558(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACAAAT
SmilChr03G002120 Chr03 NC_080389.1:32942047-32942061promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 32945823-32946908(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGCCACCGACAAAG
SmilChr04G000468 Chr04 NC_080390.1:5001712-5001726promoter 内 181-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5005532-5006849(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCCACCGACGGCG
SmilChr07G002190 Chr07 NC_080393.1:20123190-20123204promoter 内 135-149 bp - 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 20118416-20119338(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGCGTCGGTGGTGA
SmilChr05G001970 Chr05 NC_080391.1:20327187-20327201promoter 内 132-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 20331056-20333011(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGCGTCGGTGGTGA
SmilChr03G001505 Chr03 NC_080389.1:18404677-18404691promoter 内 2650-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 5 18406028-18407845(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGCTGG
SmilChr07G004654 Chr07 NC_080393.1:59411106-59411120promoter 内 2900-2914 bp + 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 59408630-59410019(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGTCACCGACACAG
SmilChr03G002795 Chr03 NC_080389.1:44438872-44438886promoter 内 291-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44434064-44435176(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGACGTCGGTGGTGG
SmilChr07G003184 Chr07 NC_080393.1:33930161-33930175promoter 内 3111-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 33927118-33929285(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTCGTCGGTGGGGG
SmilChr08G003814 Chr08 NC_080394.1:44324534-44324548promoter 内 2810-2824 bp + 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 44319891-44323357(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCAGCACCGACGCCG
SmilChr07G001417 Chr07 NC_080393.1:11020254-11020268promoter 内 2474-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 11021781-11024859(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTGATGG
SmilChr05G000263 Chr05 NC_080391.1:2009079-2009093promoter 内 2332-2346 bp - 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 2004175-2007424(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTGTCGGCGGCGA
SmilChr03G003989 Chr03 NC_080389.1:58918847-58918861promoter 内 2282-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 58911799-58917142(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTCGTCGGTGGGGG
SmilChr05G000265 Chr05 NC_080391.1:2009079-2009093promoter 内 1796-1810 bp - 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 2011284-2013186(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCCGCCGACAAGG
SmilChr05G001635 Chr05 NC_080391.1:15279097-15279111promoter 内 1448-1462 bp + 2539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 15281650-15283298(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCCGTCGGTGGCGA
SmilChr02G005478 Chr02 NC_080388.1:75010145-75010159promoter 内 637-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 75004608-75006795(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCCCACCGACGACG
SmilChr01G005928 Chr01 NC_080387.1:75076291-75076305promoter 内 3886-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 75076406-75077641(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCCACCGACGACA
SmilChr04G004100 Chr04 NC_080390.1:55971331-55971345promoter 内 3703-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 55966158-55971047(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTTCCACCGACACCA
SmilChr07G002324 Chr07 NC_080393.1:21580015-21580029promoter 内 3426-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 21576913-21579454(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTCTGTCGGTGGCCG
SmilChr01G005906 Chr01 NC_080387.1:74922658-74922672promoter 内 3405-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74923254-74924003(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCCACCGACGACA
SmilChr01G005904 Chr01 NC_080387.1:74922658-74922672promoter 内 2607-2621 bp - 1380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74919083-74921278(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTCGTCGGTGGCGA
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SmilChr08G001393 Chr08 NC_080394.1:11162299-11162313promoter 内 1712-1726 bp - 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 11164588-11165880(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCAGCACCGACGCCG
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SmilChr07G004346 Chr07 NC_080393.1:56001811-56001825promoter 内 1261-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56004551-56008125(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTTTGTCGGTGGCAG
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SmilChr01G002182 Chr01 NC_080387.1:37957132-37957146promoter 内 269-283 bp - 3718 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 37950605-37953414(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTGGCTG
SmilChr03G003946 Chr03 NC_080389.1:58525632-58525646promoter 内 106-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 58518743-58521751(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACAAAA