转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 81 / 143 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000057 Chr05 NC_080391.1:268651-268662promoter 内 3122-3133 bp - 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 269530-273117(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr02G001663 Chr02 NC_080388.1:30852883-30852894promoter 内 3111-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30853773-30857355(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr01G000382 Chr01 NC_080387.1:7857876-7857887promoter 内 3071-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7856244-7856957(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr08G003519 Chr08 NC_080394.1:37817483-37817494promoter 内 3037-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37815269-37816530(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr07G003176 Chr07 NC_080393.1:33813030-33813041promoter 内 3028-3039 bp - 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33814003-33819576(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr06G002482 Chr06 NC_080392.1:35672893-35672904promoter 内 2958-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35670378-35671861(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr02G000218 Chr02 NC_080388.1:2844884-2844895promoter 内 2956-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2845929-2851125(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAA
SmilChr07G003500 Chr07 NC_080393.1:39863838-39863849promoter 内 2951-2962 bp - 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 39864888-39866352(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr07G004020 Chr07 NC_080393.1:51272753-51272764promoter 内 2942-2953 bp + 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51273812-51275562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGTG
SmilChr01G000357 Chr01 NC_080387.1:7390854-7390865promoter 内 2941-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7389110-7389805(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr01G001116 Chr01 NC_080387.1:22802870-22802881promoter 内 2939-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22800547-22801819(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr04G002774 Chr04 NC_080390.1:43528239-43528250promoter 内 2939-2950 bp + 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 43529301-43530784(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr06G002978 Chr06 NC_080392.1:42605535-42605546promoter 内 2936-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42606600-42607872(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr02G002813 Chr02 NC_080388.1:48181410-48181421promoter 内 2933-2944 bp + 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48182478-48183750(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr04G002319 Chr04 NC_080390.1:37489469-37489480promoter 内 2889-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37485007-37488368(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr08G001181 Chr08 NC_080394.1:9477246-9477257promoter 内 2863-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9472941-9476119(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr01G001691 Chr01 NC_080387.1:31142227-31142238promoter 内 2851-2862 bp + 1139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31139057-31141088(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCTA
SmilChr02G004843 Chr02 NC_080388.1:70559106-70559117promoter 内 2851-2862 bp + 1139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 70552265-70557967(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGG
SmilChr01G005901 Chr01 NC_080387.1:74907266-74907277promoter 内 2824-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74908443-74909244(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCC
SmilChr01G001392 Chr01 NC_080387.1:27376374-27376385promoter 内 2819-2830 bp + 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27372506-27375203(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTC
SmilChr08G003520 Chr08 NC_080394.1:37817483-37817494promoter 内 2808-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37818676-37819610(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr02G003238 Chr02 NC_080388.1:53650761-53650772promoter 内 2774-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53651988-53659844(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr05G004161 Chr05 NC_080391.1:55512717-55512728promoter 内 2766-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55507693-55511493(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr02G000509 Chr02 NC_080388.1:7009216-7009227promoter 内 2734-2745 bp + 1256 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7010483-7028520(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr04G003070 Chr04 NC_080390.1:47251144-47251155promoter 内 2609-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 47247360-47249763(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAC
SmilChr04G003384 Chr04 NC_080390.1:50387299-50387310promoter 内 2559-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50380709-50385868(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAA
SmilChr05G001690 Chr05 NC_080391.1:16042108-16042119promoter 内 2549-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16040021-16040667(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTC
SmilChr05G002845 Chr05 NC_080391.1:33894983-33894994promoter 内 2537-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33892896-33893530(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTC
SmilChr01G004279 Chr01 NC_080387.1:61013406-61013417promoter 内 2526-2537 bp - 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61009073-61011942(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr06G001529 Chr06 NC_080392.1:16535078-16535089promoter 内 2524-2535 bp + 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16532992-16533612(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTC
SmilChr03G002813 Chr03 NC_080389.1:44593450-44593461promoter 内 2232-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44595219-44596953(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr01G001136 Chr01 NC_080387.1:23159178-23159189promoter 内 2220-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 23153104-23157408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATC
SmilChr01G005747 Chr01 NC_080387.1:73555531-73555542promoter 内 2170-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 73557362-73558285(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGA
SmilChr07G000217 Chr07 NC_080393.1:1391515-1391526promoter 内 2148-2159 bp + 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1393368-1394026(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCC
SmilChr05G000148 Chr05 NC_080391.1:1213726-1213737promoter 内 2074-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1194552-1211810(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr05G000162 Chr05 NC_080391.1:1295606-1295617promoter 内 2061-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1290407-1293677(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr05G003788 Chr05 NC_080391.1:51226660-51226671promoter 内 2005-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51223102-51224675(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr06G000435 Chr06 NC_080392.1:3571961-3571972promoter 内 1937-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3566917-3569908(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr01G000291 Chr01 NC_080387.1:5686149-5686160promoter 内 1877-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5688273-5690755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr01G005869 Chr01 NC_080387.1:74626617-74626628promoter 内 1877-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74623630-74624504(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr05G000155 Chr05 NC_080391.1:1254841-1254852promoter 内 1810-1821 bp + 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1250082-1252661(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr08G003623 Chr08 NC_080394.1:39438554-39438565promoter 内 1770-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 39440785-39443676(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr03G003869 Chr03 NC_080389.1:57802876-57802887promoter 内 1730-1741 bp - 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 57798026-57800616(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCAAGCTGTA
SmilChr07G003685 Chr07 NC_080393.1:44371592-44371603promoter 内 1698-1709 bp + 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44362916-44369300(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr07G000888 Chr07 NC_080393.1:6366498-6366509promoter 内 1684-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6360987-6364192(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGC
SmilChr04G003220 Chr04 NC_080390.1:49026316-49026327promoter 内 1663-1674 bp + 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49022512-49023989(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr06G002294 Chr06 NC_080392.1:33054132-33054143promoter 内 1642-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33056491-33056597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr06G001939 Chr06 NC_080392.1:23755694-23755705promoter 内 1538-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 23749703-23753242(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr05G000161 Chr05 NC_080391.1:1290908-1290919promoter 内 1495-1506 bp + 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1285097-1288413(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73209349-73209360promoter 内 1488-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 73211862-73215804(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGA