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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 81 / 126 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002572 Chr06 NC_080392.1:36930821-36930835promoter 内 1367-1381 bp + 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36925615-36928201(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr02G004949 Chr02 NC_080388.1:71439828-71439842promoter 内 1334-1348 bp - 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 71429678-71437175(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AACACACACGTGTCA
SmilChr02G001664 Chr02 NC_080388.1:30856140-30856154promoter 内 1321-1335 bp - 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30858820-30861350(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr07G003467 Chr07 NC_080393.1:38771335-38771349promoter 内 1319-1333 bp + 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38765481-38768667(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr01G001115 Chr01 NC_080387.1:22799612-22799626promoter 内 1309-1323 bp + 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22794412-22796934(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr04G002318 Chr04 NC_080390.1:37486208-37486222promoter 内 1304-1318 bp + 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 37481009-37483525(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr04G001269 Chr04 NC_080390.1:20190535-20190549promoter 内 1298-1312 bp + 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20185327-20187846(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr06G002979 Chr06 NC_080392.1:42608793-42608807promoter 内 1162-1176 bp - 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 42611632-42614009(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCATTTCA
SmilChr04G002156 Chr04 NC_080390.1:34609070-34609084promoter 内 1081-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 34611990-34614439(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAATTGACGTGGCA
SmilChr05G000831 Chr05 NC_080391.1:6531220-6531234promoter 内 1052-1066 bp - 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6534169-6537241(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTTGTGT
SmilChr05G002277 Chr05 NC_080391.1:24494186-24494200promoter 内 1025-1039 bp - 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 24490441-24491224(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCCTATGACGTGGCG
SmilChr07G002411 Chr07 NC_080393.1:22480466-22480480promoter 内 932-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22476000-22477411(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCAGACCG
SmilChr05G003368 Chr05 NC_080391.1:44513348-44513362promoter 内 927-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44506103-44510288(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAAAATT
SmilChr04G000578 Chr04 NC_080390.1:6444525-6444539promoter 内 881-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6440067-6441419(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTGAAACACGTGGCC
SmilChr01G003572 Chr01 NC_080387.1:54285833-54285847promoter 内 770-784 bp - 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54289064-54290069(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTTGATG
SmilChr05G001904 Chr05 NC_080391.1:19302971-19302985promoter 内 441-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 19306531-19308048(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCACCA
SmilChr01G003556 Chr01 NC_080387.1:54191706-54191720promoter 内 396-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54185514-54188115(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATTTTGACGTGGCG
SmilChr07G002042 Chr07 NC_080393.1:18516859-18516873promoter 内 333-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 18520527-18524903(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATGACACGTGGAA
SmilChr08G000889 Chr08 NC_080394.1:6596920-6596934promoter 内 311-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6585624-6593244(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAGCTTACGTGGCA
SmilChr02G000329 Chr02 NC_080388.1:4206422-4206436promoter 内 235-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4201138-4202670(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAACTAAT
SmilChr02G000332 Chr02 NC_080388.1:4214410-4214424promoter 内 235-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4209441-4210658(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAACTAAT
SmilChr04G000966 Chr04 NC_080390.1:12957404-12957418promoter 内 156-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12961249-12964204(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAATTGACGTGGCA
SmilChr03G003343 Chr03 NC_080389.1:51766011-51766025promoter 内 3402-3416 bp + 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 51757803-51765426(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCAGCAGG
SmilChr05G003477 Chr05 NC_080391.1:46156693-46156707promoter 内 2525-2539 bp - 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 46154175-46155231(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr02G005453 Chr02 NC_080388.1:74865054-74865068promoter 内 1511-1525 bp - 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 74867544-74873718(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATCGGC
SmilChr05G003478 Chr05 NC_080391.1:46156693-46156707promoter 内 451-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 46160243-46162703(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr07G002818 Chr07 NC_080393.1:28234358-28234372promoter 内 3946-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 28232753-28234317(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTTTTACACGTGTCA
SmilChr05G004253 Chr05 NC_080391.1:56323357-56323371promoter 内 3945-3959 bp + 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 56323413-56326490(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTTTCCACGTGGCG
SmilChr08G002066 Chr08 NC_080394.1:18537616-18537630promoter 内 3714-3728 bp + 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 18537903-18540785(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr08G001386 Chr08 NC_080394.1:11072845-11072859promoter 内 3675-3689 bp - 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 11071176-11072533(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr07G000814 Chr07 NC_080393.1:5743416-5743430promoter 内 3654-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 5741070-5743083(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CAATTCCACGTGGCA
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4462449-4462463promoter 内 3402-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 4460922-4461864(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr04G003256 Chr04 NC_080390.1:49301506-49301520promoter 内 3304-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 49299723-49300823(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr04G004117 Chr04 NC_080390.1:56064795-56064809promoter 内 3303-3317 bp + 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 56060212-56064111(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTTACTA
SmilChr01G000117 Chr01 NC_080387.1:2032841-2032855promoter 内 3212-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 2031059-2032066(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
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SmilChr07G004423 Chr07 NC_080393.1:56835879-56835893promoter 内 2988-3002 bp + 999 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 56836892-56837676(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr03G001834 Chr03 NC_080389.1:25178961-25178975promoter 内 2793-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 25176699-25177767(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
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SmilChr02G000622 Chr02 NC_080388.1:9218884-9218898promoter 内 1856-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 9212839-9216753(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTTTTGACGTGGCA
SmilChr04G000513 Chr04 NC_080390.1:5638320-5638334promoter 内 1061-1075 bp + 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 5634144-5635394(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACACGTGTCCCTA
SmilChr04G002947 Chr04 NC_080390.1:45798075-45798089promoter 内 864-878 bp - 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 45801212-45802033(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
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SmilChr02G003404 Chr02 NC_080388.1:55219251-55219265promoter 内 19-33 bp - 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 55212150-55215283(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAATCCACGTGGCA
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SmilChr08G001514 Chr08 NC_080394.1:12291680-12291694promoter 内 3930-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 12291054-12291623(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTTTGCTACGTGGCA
SmilChr01G000541 Chr01 NC_080387.1:11121239-11121253promoter 内 3924-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 11118692-11121176(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTCCACGTGTCCCCA