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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 83 / 146 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004459 Chr02 NC_080388.1:67016014-67016027promoter 内 3853-3866 bp + 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 66989070-67015879(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAAAGTCAAAAAC
SmilChr04G002886 Chr04 NC_080390.1:45063108-45063121promoter 内 3405-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 45059347-45062525(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CACTTTGACTTCTT
SmilChr03G001887 Chr03 NC_080389.1:26315413-26315426promoter 内 2567-2580 bp + 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 26316847-26319373(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTTC
SmilChr04G000625 Chr04 NC_080390.1:7117121-7117134promoter 内 1502-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 7119620-7122369(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr01G005975 Chr01 NC_080387.1:75418474-75418487promoter 内 1458-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 75414077-75415944(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCT
SmilChr03G000292 Chr03 NC_080389.1:3343906-3343919promoter 内 1074-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 3337044-3340992(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACCAGTCAACGGT
SmilChr01G005816 Chr01 NC_080387.1:74156952-74156965promoter 内 487-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 74152452-74153451(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGATGGTCAACGGG
SmilChr02G000987 Chr02 NC_080388.1:17359919-17359932promoter 内 451-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 17363469-17366231(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACTAGTCAACCAC
SmilChr04G003924 Chr04 NC_080390.1:54920467-54920480promoter 内 3933-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 54918537-54920412(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGGTTGACTATCA
SmilChr02G000548 Chr02 NC_080388.1:7597592-7597605promoter 内 3914-3927 bp - 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 7596257-7597518(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTTTTGACTTTTT
SmilChr04G001242 Chr04 NC_080390.1:19510749-19510762promoter 内 3816-3829 bp + 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 19510934-19513879(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTATTTGACTTTTG
SmilChr04G003613 Chr04 NC_080390.1:52615277-52615290promoter 内 3741-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 52615537-52623935(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAAAAGTCAAATTG
SmilChr02G002351 Chr02 NC_080388.1:41300431-41300444promoter 内 3723-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 41299216-41300166(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr03G000367 Chr03 NC_080389.1:4102469-4102482promoter 内 3694-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4102776-4104254(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGATAGTCAACACC
SmilChr04G004159 Chr04 NC_080390.1:56274298-56274311promoter 内 3639-3652 bp + 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 56274660-56278615(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TATGTTGACTTGTG
SmilChr02G005240 Chr02 NC_080388.1:73576111-73576124promoter 内 3447-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 73572201-73575570(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCATAGTCAACTAT
SmilChr03G002918 Chr03 NC_080389.1:45935129-45935142promoter 内 3283-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 45931901-45934424(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAAAGTCAAACAT
SmilChr01G001018 Chr01 NC_080387.1:21351246-21351259promoter 内 3262-3275 bp - 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 21345982-21350520(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TACTTTGACTTTAA
SmilChr04G002760 Chr04 NC_080390.1:43346903-43346916promoter 内 3212-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 43338436-43346127(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCAAAGTCAATGTT
SmilChr04G001308 Chr04 NC_080390.1:20870695-20870708promoter 内 2995-3008 bp + 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 20871701-20872882(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTATTTGACTTTTG
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SmilChr04G002115 Chr04 NC_080390.1:34149698-34149711promoter 内 2475-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 34151224-34154858(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCATAGTCAACACG
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SmilChr02G003680 Chr02 NC_080388.1:58163060-58163073promoter 内 1773-1786 bp - 2215 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 58165288-58170625(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTACAGTCAACGAA
SmilChr04G004147 Chr04 NC_080390.1:56207956-56207969promoter 内 1702-1715 bp + 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 56203971-56205670(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGAAGTCAACCTA
SmilChr03G003243 Chr03 NC_080389.1:50327372-50327385promoter 内 1664-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 50329709-50331573(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGTTAGTCAACGTT
SmilChr03G001844 Chr03 NC_080389.1:25339384-25339397promoter 内 1562-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 25341823-25343163(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAAAGTCAAATAC
SmilChr02G003463 Chr02 NC_080388.1:55920070-55920083promoter 内 1473-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 55922598-55931701(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGGTTTGACTTATT
SmilChr01G003901 Chr01 NC_080387.1:57292546-57292559promoter 内 1408-1421 bp + 2580 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 57295139-57298637(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGCGCTGACTTTGT
SmilChr03G001884 Chr03 NC_080389.1:26246916-26246929promoter 内 1319-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 26243055-26244247(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAATAC
SmilChr01G004481 Chr01 NC_080387.1:62916695-62916708promoter 内 1178-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 62910499-62913885(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGCGTTGACCATCA
SmilChr04G002576 Chr04 NC_080390.1:41115452-41115465promoter 内 1167-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 41118286-41164029(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr02G001542 Chr02 NC_080388.1:28674087-28674100promoter 内 1161-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 28676927-28682190(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGATGGTCAACGCA
SmilChr01G001247 Chr01 NC_080387.1:24983696-24983709promoter 内 1137-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 24986560-24987734(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAGTTGACTCTCA
SmilChr02G000623 Chr02 NC_080388.1:9220553-9220566promoter 内 1116-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 9216415-9217681(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAATAC
SmilChr03G002567 Chr03 NC_080389.1:40855860-40855873promoter 内 1084-1097 bp + 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 40858777-40859191(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCATTTGACTTTCC
SmilChr01G003900 Chr01 NC_080387.1:57292546-57292559promoter 内 794-807 bp + 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 57286627-57289352(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAGCGCC
SmilChr01G001730 Chr01 NC_080387.1:31852697-31852710promoter 内 772-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 31855926-31860250(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
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SmilChr02G000622 Chr02 NC_080388.1:9220553-9220566promoter 内 188-201 bp + 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 9212839-9216753(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAATAC