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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 86 / 151 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002842 Chr03 NC_080389.1:44966028-44966040promoter 内 3621-3633 bp - 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44963780-44965660(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
SmilChr05G000270 Chr05 NC_080391.1:2081425-2081437promoter 内 3509-3521 bp + 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2081917-2082791(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTAGT
SmilChr02G001305 Chr02 NC_080388.1:24232985-24232997promoter 内 3444-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24233542-24236968(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
SmilChr04G002330 Chr04 NC_080390.1:37611278-37611290promoter 内 3417-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37604249-37610706(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGAGTAGGTAGT
SmilChr02G000981 Chr02 NC_080388.1:17263208-17263220promoter 内 3415-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 17263794-17268668(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGTC
SmilChr04G000100 Chr04 NC_080390.1:905079-905091promoter 内 3362-3374 bp - 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 905718-910298(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGTGTAGGTAAG
SmilChr04G003555 Chr04 NC_080390.1:51938535-51938547promoter 内 3206-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51939330-51948223(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
SmilChr03G001170 Chr03 NC_080389.1:13458457-13458469promoter 内 3186-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 13459272-13460810(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGTC
SmilChr03G001302 Chr03 NC_080389.1:15250844-15250856promoter 内 3177-3189 bp - 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15248385-15250032(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
SmilChr03G002045 Chr03 NC_080389.1:30964761-30964773promoter 内 3147-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30960883-30963919(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCGGTAGGTGTC
SmilChr02G002079 Chr02 NC_080388.1:37375170-37375182promoter 内 3137-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37372666-37374318(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGAGTAGGTAGT
SmilChr03G002719 Chr03 NC_080389.1:43213412-43213424promoter 内 3067-3079 bp - 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43214346-43215872(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTACT
SmilChr03G001836 Chr03 NC_080389.1:25197841-25197853promoter 内 2762-2774 bp + 1227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25188485-25196614(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGTC
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SmilChr01G000134 Chr01 NC_080387.1:2269214-2269226promoter 内 2572-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2270643-2271913(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
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SmilChr05G001135 Chr05 NC_080391.1:9488119-9488131promoter 内 2350-2362 bp - 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9489770-9497238(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGAGTAGGTAGT
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SmilChr02G002732 Chr02 NC_080388.1:47237803-47237815promoter 内 2214-2226 bp - 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 47232592-47236028(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCTG
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SmilChr04G004023 Chr04 NC_080390.1:55480136-55480148promoter 内 2163-2175 bp + 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55475331-55478310(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCGGTAGGTGTC
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SmilChr04G000928 Chr04 NC_080390.1:12093904-12093916promoter 内 2040-2052 bp - 1949 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12089431-12091955(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
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SmilChr05G000742 Chr05 NC_080391.1:5685989-5686001promoter 内 1945-1957 bp - 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5688045-5688782(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAAGTAGGTAAT
SmilChr05G001011 Chr05 NC_080391.1:8298004-8298016promoter 内 1937-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8300068-8302563(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCTG
SmilChr03G003594 Chr03 NC_080389.1:54580267-54580279promoter 内 1881-1893 bp - 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54577139-54578159(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA
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SmilChr05G002085 Chr05 NC_080391.1:21787074-21787086promoter 内 1780-1792 bp + 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21779712-21784865(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGGTAGGTATG
SmilChr03G004528 Chr03 NC_080389.1:63324877-63324889promoter 内 1723-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63327155-63332864(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCATGTAGGTAGA
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SmilChr02G003084 Chr02 NC_080388.1:51744818-51744830promoter 内 987-999 bp - 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51747832-51748908(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTTCG
SmilChr04G002147 Chr04 NC_080390.1:34521128-34521140promoter 内 745-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34524384-34525553(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGAGTAGGTAGT
SmilChr05G000301 Chr05 NC_080391.1:2304395-2304407promoter 内 730-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2294070-2301136(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTACC
SmilChr02G000940 Chr02 NC_080388.1:16395314-16395326promoter 内 702-714 bp - 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 16388761-16392027(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTCTG
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SmilChr01G004864 Chr01 NC_080387.1:66780794-66780806promoter 内 622-634 bp - 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 66774740-66777427(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCATG
SmilChr01G000037 Chr01 NC_080387.1:600921-600933promoter 内 621-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 604301-606337(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATCTCT
SmilChr04G002813 Chr04 NC_080390.1:44149650-44149662promoter 内 575-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44144692-44146236(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCCCA