转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 87 / 149 下载 TSV

上一页 87 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003187 Chr06 NC_080392.1:44770094-44770104promoter 内 1787-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44772308-44779839(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr04G001703 Chr04 NC_080390.1:28167588-28167598promoter 内 1772-1782 bp + 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28169817-28170251(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr04G000978 Chr04 NC_080390.1:13174815-13174825promoter 内 1736-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13177080-13178379(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr02G001120 Chr02 NC_080388.1:20209048-20209058promoter 内 1685-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 20204191-20206742(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G002019 Chr03 NC_080389.1:30226451-30226461promoter 内 1685-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30221594-30224145(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G004222 Chr03 NC_080389.1:60780997-60781007promoter 内 1666-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60783332-60786462(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr04G000524 Chr04 NC_080390.1:5762314-5762324promoter 内 1660-1670 bp - 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 5756241-5759983(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCC
SmilChr03G004346 Chr03 NC_080389.1:61734305-61734315promoter 内 1646-1656 bp + 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61736660-61739767(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCC
SmilChr03G002086 Chr03 NC_080389.1:32136037-32136047promoter 内 1627-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 32138411-32140303(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr04G001323 Chr04 NC_080390.1:21310215-21310225promoter 内 1625-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 21312591-21329516(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr01G000621 Chr01 NC_080387.1:13738699-13738709promoter 内 1623-1633 bp - 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13734991-13736331(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr04G001705 Chr04 NC_080390.1:28183544-28183554promoter 内 1608-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28185937-28189670(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G001145 Chr01 NC_080387.1:23411613-23411623promoter 内 1565-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 23414049-23416919(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr01G000982 Chr01 NC_080387.1:20789555-20789565promoter 内 1518-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 20792038-20795706(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G001684 Chr03 NC_080389.1:22219754-22219764promoter 内 1518-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22222237-22223700(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40265980-40265990promoter 内 1514-1524 bp - 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40268467-40269588(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G003444 Chr05 NC_080391.1:45801847-45801857promoter 内 1493-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45798735-45799349(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr02G005016 Chr02 NC_080388.1:71938053-71938063promoter 内 1480-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 71934718-71935542(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr01G001329 Chr01 NC_080387.1:26461508-26461518promoter 内 1423-1433 bp + 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26464086-26473494(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr03G001215 Chr03 NC_080389.1:13969326-13969336promoter 内 1391-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13971936-13972914(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr03G000852 Chr03 NC_080389.1:9738802-9738812promoter 内 1332-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9733194-9736143(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr03G000051 Chr03 NC_080389.1:512023-512033promoter 内 1329-1339 bp + 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 514695-517585(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr05G000440 Chr05 NC_080391.1:3321774-3321784promoter 内 1317-1327 bp + 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3324458-3328456(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr05G000958 Chr05 NC_080391.1:7727805-7727815promoter 内 1315-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7730491-7734929(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr05G004281 Chr05 NC_080391.1:56603995-56604005promoter 内 1310-1320 bp - 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56606686-56609506(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G002837 Chr03 NC_080389.1:44909666-44909676promoter 内 1296-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44912371-44919831(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr02G000435 Chr02 NC_080388.1:5670914-5670924promoter 内 1291-1301 bp + 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 5673624-5676683(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr07G003172 Chr07 NC_080393.1:33769372-33769382promoter 内 1258-1268 bp + 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 33772115-33773073(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr05G004210 Chr05 NC_080391.1:55980748-55980758promoter 内 1245-1255 bp + 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 55976254-55978002(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr01G000927 Chr01 NC_080387.1:19662680-19662690promoter 内 1244-1254 bp - 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19658453-19659933(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr01G003514 Chr01 NC_080387.1:53749170-53749180promoter 内 1238-1248 bp + 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 53751933-53757502(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G005333 Chr01 NC_080387.1:70533404-70533414promoter 内 1217-1227 bp + 2774 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70536188-70538055(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr02G002218 Chr02 NC_080388.1:39428773-39428783promoter 内 1206-1216 bp + 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39421720-39425988(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr04G003439 Chr04 NC_080390.1:50932404-50932414promoter 内 1186-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 50926055-50929599(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr02G003295 Chr02 NC_080388.1:54230246-54230256promoter 内 1172-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54225546-54227427(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr05G002292 Chr05 NC_080391.1:24756380-24756390promoter 内 1157-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 24759224-24762489(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr02G005449 Chr02 NC_080388.1:74849521-74849531promoter 内 1105-1115 bp + 2886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 74843521-74846635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr05G000003 Chr05 NC_080391.1:11935-11945promoter 内 1074-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3422-9018(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr04G000434 Chr04 NC_080390.1:4612740-4612750promoter 内 1058-1068 bp - 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4606390-4609807(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr02G000120 Chr02 NC_080388.1:1607210-1607220promoter 内 1023-1033 bp - 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1603431-1604242(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr04G001990 Chr04 NC_080390.1:32205993-32206003promoter 内 986-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 32209008-32211377(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr06G002125 Chr06 NC_080392.1:28529874-28529884promoter 内 932-942 bp - 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28532943-28540019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G003728 Chr03 NC_080389.1:56306919-56306929promoter 内 921-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56300804-56303849(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr07G000649 Chr07 NC_080393.1:4376903-4376913promoter 内 913-923 bp - 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4379991-4381759(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr01G005027 Chr01 NC_080387.1:68224707-68224717promoter 内 898-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 68227810-68231451(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr03G002356 Chr03 NC_080389.1:37197736-37197746promoter 内 887-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37181113-37194632(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr07G003192 Chr07 NC_080393.1:34060703-34060713promoter 内 880-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 34063824-34065612(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr04G001196 Chr04 NC_080390.1:18311114-18311124promoter 内 872-882 bp + 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18314243-18314755(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr04G001924 Chr04 NC_080390.1:31346981-31346991promoter 内 861-871 bp - 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31343198-31343851(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr02G003296 Chr02 NC_080388.1:54230246-54230256promoter 内 800-810 bp - 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54233447-54235258(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAA