转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 88 / 143 下载 TSV

上一页 88 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001544 Chr04 NC_080390.1:25564673-25564684promoter 内 202-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 25557571-25560885(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAC
SmilChr07G001286 Chr07 NC_080393.1:9904673-9904684promoter 内 122-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9899737-9900805(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr02G003201 Chr02 NC_080388.1:53174505-53174516promoter 内 121-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53167782-53170636(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr03G004351 Chr03 NC_080389.1:61753795-61753806promoter 内 116-127 bp - 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61757680-61758356(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr04G001762 Chr04 NC_080390.1:28982801-28982812promoter 内 27-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28986775-28987281(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr01G004391 Chr01 NC_080387.1:62083411-62083422promoter 内 21-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62087391-62090905(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr04G003415 Chr04 NC_080390.1:50763734-50763745promoter 内 3944-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 50763791-50764399(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGT
SmilChr06G001859 Chr06 NC_080392.1:22022937-22022948promoter 内 830-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 22026108-22028609(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATA
SmilChr06G001853 Chr06 NC_080392.1:21908982-21908993promoter 内 827-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 21912156-21914649(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATA
SmilChr01G000430 Chr01 NC_080387.1:8591870-8591881promoter 内 3944-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 8591927-8592436(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGT
SmilChr05G002395 Chr05 NC_080391.1:26441642-26441653promoter 内 3780-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 26440606-26441432(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATA
SmilChr01G005653 Chr01 NC_080387.1:72896681-72896692promoter 内 3213-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 72893237-72895904(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACACCTGTCAA
SmilChr08G002501 Chr08 NC_080394.1:24050145-24050156promoter 内 2768-2779 bp + 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 24046008-24048923(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACACCTGTCAA
SmilChr07G001293 Chr07 NC_080393.1:9937113-9937124promoter 内 2446-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 9938668-9938741(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTT
SmilChr03G001873 Chr03 NC_080389.1:25975531-25975542promoter 内 2259-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 25977273-25978713(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCT
SmilChr07G001294 Chr07 NC_080393.1:9937113-9937124promoter 内 2220-2231 bp - 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 9938894-9941357(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTT
SmilChr07G000012 Chr07 NC_080393.1:64956-64967promoter 内 1831-1842 bp + 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 67126-67916(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAA
SmilChr02G005374 Chr02 NC_080388.1:74419305-74419316promoter 内 1691-1702 bp + 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 74421615-74424248(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCA
SmilChr08G000886 Chr08 NC_080394.1:6563221-6563232promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 6565655-6568215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGG
SmilChr07G001748 Chr07 NC_080393.1:14819317-14819328promoter 内 1398-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 14821920-14824006(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAAA
SmilChr01G002681 Chr01 NC_080387.1:45030324-45030335promoter 内 1363-1374 bp + 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 45025964-45027697(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATA
SmilChr07G002393 Chr07 NC_080393.1:22301469-22301480promoter 内 479-490 bp - 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 22304991-22315170(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr08G001991 Chr08 NC_080394.1:17627338-17627349promoter 内 390-401 bp + 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 17630949-17636841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr03G004141 Chr03 NC_080389.1:60249198-60249209promoter 内 291-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 60243987-60245499(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCT
SmilChr02G001319 Chr02 NC_080388.1:24530649-24530660promoter 内 234-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 24525910-24526893(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGTG
SmilChr07G002895 Chr07 NC_080393.1:29312338-29312349promoter 内 43-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 29304258-29308391(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGT
SmilChr07G002442 Chr07 NC_080393.1:22868152-22868163promoter 内 3983-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22868170-22869894(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAG
SmilChr08G002395 Chr08 NC_080394.1:22730452-22730463promoter 内 3976-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22730477-22732770(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGG
SmilChr08G003434 Chr08 NC_080394.1:36652720-36652731promoter 内 3968-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 36652753-36657834(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTG
SmilChr07G004463 Chr07 NC_080393.1:57219725-57219736promoter 内 3931-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 57217973-57219666(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCTA
SmilChr07G001736 Chr07 NC_080393.1:14751920-14751931promoter 内 3909-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14752012-14752611(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr06G000002 Chr06 NC_080392.1:118077-118088promoter 内 3822-3833 bp - 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 118256-120557(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCT
SmilChr02G004350 Chr02 NC_080388.1:65760894-65760905promoter 内 3820-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65761075-65764167(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGT
SmilChr03G003206 Chr03 NC_080389.1:49604919-49604930promoter 内 3778-3789 bp - 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 49602347-49604707(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATACCAGCTGTG
SmilChr04G000094 Chr04 NC_080390.1:854778-854789promoter 内 3739-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 855040-857530(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAA
SmilChr01G004439 Chr01 NC_080387.1:62475466-62475477promoter 内 3665-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 62475802-62476465(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr07G004114 Chr07 NC_080393.1:52825414-52825425promoter 内 3634-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52825781-52828448(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGAT
SmilChr02G004372 Chr02 NC_080388.1:66072784-66072795promoter 内 3571-3582 bp + 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 66071276-66072365(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTT
SmilChr05G003814 Chr05 NC_080391.1:51437826-51437837promoter 内 3512-3523 bp + 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51438315-51443308(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGGG
SmilChr02G004229 Chr02 NC_080388.1:64497418-64497429promoter 内 3502-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64491924-64496930(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr03G002210 Chr03 NC_080389.1:34857110-34857121promoter 内 3497-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34857614-34858137(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr02G001706 Chr02 NC_080388.1:31382693-31382704promoter 内 3474-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31383220-31389483(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATACCAGCTGTG
SmilChr08G002392 Chr08 NC_080394.1:22686805-22686816promoter 内 3464-3475 bp - 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22684489-22686279(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGG
SmilChr04G003980 Chr04 NC_080390.1:55247092-55247103promoter 内 3451-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55247642-55254934(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr02G001301 Chr02 NC_080388.1:24137911-24137922promoter 内 3313-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24135664-24137234(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCCC
SmilChr08G000544 Chr08 NC_080394.1:3964812-3964823promoter 内 3311-3322 bp - 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3965502-3967070(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGT
SmilChr07G002303 Chr07 NC_080393.1:21324536-21324547promoter 内 3277-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21325260-21326419(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACC
SmilChr08G000438 Chr08 NC_080394.1:3140610-3140621promoter 内 3261-3272 bp + 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3137946-3139881(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATT
SmilChr04G003695 Chr04 NC_080390.1:53332651-53332662promoter 内 3180-3191 bp + 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53331770-53331841(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGC
SmilChr05G002179 Chr05 NC_080391.1:23237520-23237531promoter 内 3165-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23228756-23236695(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC