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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 89 / 164 下载 TSV

上一页 89 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003499 Chr07 NC_080393.1:39777452-39777466promoter 内 3277-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 39775994-39776742(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGTGGGTAGGTAAT
SmilChr01G004591 Chr01 NC_080387.1:63918921-63918935promoter 内 3174-3188 bp + 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63914506-63918108(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACACCTACCAAAAC
SmilChr02G004572 Chr02 NC_080388.1:68219428-68219442promoter 内 3138-3152 bp - 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 68220291-68226607(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACTTTTT
SmilChr08G001979 Chr08 NC_080394.1:17498542-17498556promoter 内 3132-3146 bp - 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17499411-17503838(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTACCTACCACTCT
SmilChr07G001370 Chr07 NC_080393.1:10631760-10631774promoter 内 3072-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10629835-10630845(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCTAGGGTAGGTGGT
SmilChr01G004801 Chr01 NC_080387.1:66227955-66227969promoter 内 3006-3020 bp - 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66228950-66232834(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTACCTACCCACCC
SmilChr03G001321 Chr03 NC_080389.1:15466259-15466273promoter 内 2884-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15463229-15465156(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCATGGA
SmilChr01G005660 Chr01 NC_080387.1:72940287-72940301promoter 内 2857-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 72941431-72945167(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACTTCAGC
SmilChr03G001868 Chr03 NC_080389.1:25851558-25851572promoter 内 2845-2859 bp + 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 25842327-25850416(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCAACTACCAAATC
SmilChr01G005729 Chr01 NC_080387.1:73431283-73431297promoter 内 2781-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 73432503-73439654(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACACCTACCTAATA
SmilChr01G004165 Chr01 NC_080387.1:60157870-60157884promoter 内 2674-2688 bp + 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60151027-60156557(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACTAAAGA
SmilChr06G002864 Chr06 NC_080392.1:41470479-41470493promoter 内 2643-2657 bp + 1344 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41467329-41469135(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACTTCTTA
SmilChr03G001427 Chr03 NC_080389.1:16904588-16904602promoter 内 2563-2577 bp - 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16906026-16907941(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCATGGA
SmilChr06G003006 Chr06 NC_080392.1:42929785-42929799promoter 内 2551-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 42931235-42934055(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTTTGGTAGGTTTG
SmilChr05G001253 Chr05 NC_080391.1:10662316-10662330promoter 内 2417-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10663900-10666679(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACACCTACCTCGTT
SmilChr06G001531 Chr06 NC_080392.1:16551418-16551432promoter 内 2335-2349 bp + 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16545356-16549766(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAACCTACCCTCAC
SmilChr04G000683 Chr04 NC_080390.1:7965290-7965304promoter 内 2275-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 7959403-7963578(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACACCTACCAAAAC
SmilChr08G000226 Chr08 NC_080394.1:1527446-1527460promoter 内 2275-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1520372-1525734(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATGGAGGTAGGTAAT
SmilChr03G002351 Chr03 NC_080389.1:37141993-37142007promoter 内 2244-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 37137945-37140250(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAGTGGTAGGTGCT
SmilChr06G001338 Chr06 NC_080392.1:13919837-13919851promoter 内 2019-2033 bp - 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13921819-13923194(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCCGACC
SmilChr03G003083 Chr03 NC_080389.1:47880508-47880522promoter 内 1925-1939 bp + 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 47877677-47878446(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCTGCTG
SmilChr06G003016 Chr06 NC_080392.1:43010826-43010840promoter 内 1921-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 43012906-43017018(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTGATGGTAGGTTTG
SmilChr03G001322 Chr03 NC_080389.1:15466259-15466273promoter 内 1800-1814 bp + 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15468460-15468531(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCATGGTAGGTGCA
SmilChr01G000208 Chr01 NC_080387.1:3625359-3625373promoter 内 1698-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3616537-3623070(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGAATGGTAGGTATA
SmilChr01G004651 Chr01 NC_080387.1:64633994-64634008promoter 内 1696-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 64629285-64631703(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATCAGGTAGGTTGG
SmilChr08G001978 Chr08 NC_080394.1:17498542-17498556promoter 内 1683-1697 bp - 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17493079-17496238(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGAGTGGTAGGTAAT
SmilChr05G003970 Chr05 NC_080391.1:53468006-53468020promoter 内 1669-1683 bp + 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53462133-53465688(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTTCCAC
SmilChr08G001288 Chr08 NC_080394.1:10266918-10266932promoter 内 1664-1678 bp + 2323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10269255-10270153(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGAAGGTAGGTTTG
SmilChr06G000642 Chr06 NC_080392.1:5692933-5692947promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5695299-5697793(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCGAAGGTAGGTAGC
SmilChr01G004663 Chr01 NC_080387.1:64737204-64737218promoter 内 1633-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 64733668-64734850(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTATCTT
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73614424-73614438promoter 内 1632-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 73616793-73625585(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACTACCTACCTCTCT
SmilChr04G002379 Chr04 NC_080390.1:38319857-38319871promoter 内 1590-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 38322268-38330598(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGTGGGTAGGTAAT
SmilChr02G004537 Chr02 NC_080388.1:67964235-67964249promoter 内 1545-1559 bp + 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 67957432-67961793(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGAACCTACCAACTT
SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63918921-63918935promoter 内 1487-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63921435-63922453(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTTTTGGTAGGTGTT
SmilChr02G003865 Chr02 NC_080388.1:60620943-60620957promoter 内 1473-1487 bp + 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60607721-60618429(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CAAACCTACCATACC
SmilChr05G000672 Chr05 NC_080391.1:5134274-5134288promoter 内 1439-1453 bp - 2548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5124881-5131726(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGTGGGTAGGTCAG
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SmilChr05G000051 Chr05 NC_080391.1:234889-234903promoter 内 1324-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 237566-239845(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACTTGGTAGTTGAA
SmilChr05G000511 Chr05 NC_080391.1:3941653-3941667promoter 内 1277-1291 bp - 2710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3944377-3946496(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCCACCAACTA
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SmilChr05G001422 Chr05 NC_080391.1:12899235-12899249promoter 内 1186-1200 bp - 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 12902050-12908325(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACAACTACCAAATC
SmilChr02G000371 Chr02 NC_080388.1:4713420-4713434promoter 内 1147-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 4707394-4710580(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACACCTACCTCCGC
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SmilChr03G001924 Chr03 NC_080389.1:27005479-27005493promoter 内 981-995 bp + 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 27001881-27002473(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCCTAAA
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SmilChr04G002447 Chr04 NC_080390.1:39190495-39190509promoter 内 881-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 39180055-39187389(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAAAAGGTAGGTATG
SmilChr01G003549 Chr01 NC_080387.1:54090650-54090664promoter 内 855-869 bp - 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54093796-54097974(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCCAAGA