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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005298; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002362-RA_Salv SmilChr01G005298 ARR-B XP_057788621.1 MP00010 AAAGATACGG

可能结合的靶基因

9778 个结合位点 8344 个候选靶基因 第 90 / 167 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000440 Chr08 NC_080394.1:3155413-3155422promoter 内 1477-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3157937-3158018(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr02G004547 Chr02 NC_080388.1:68017042-68017051promoter 内 1329-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 68019714-68020863(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr08G001148 Chr08 NC_080394.1:9058596-9058605promoter 内 1165-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9053507-9055769(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr01G004514 Chr01 NC_080387.1:63267095-63267104promoter 内 1157-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63262823-63264260(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr04G002026 Chr04 NC_080390.1:32933868-32933877promoter 内 1095-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32928238-32930971(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr04G002587 Chr04 NC_080390.1:41288802-41288811promoter 内 1049-1058 bp + 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41284541-41285859(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr01G002214 Chr01 NC_080387.1:38478846-38478855promoter 内 1014-1023 bp - 2978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38481833-38482558(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr01G005763 Chr01 NC_080387.1:73743347-73743356promoter 内 904-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 73730030-73740259(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr02G004888 Chr02 NC_080388.1:70941545-70941554promoter 内 884-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70944662-70944734(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr01G001556 Chr01 NC_080387.1:29583028-29583037promoter 内 758-767 bp + 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 29586271-29592615(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr02G000780 Chr02 NC_080388.1:12792553-12792562promoter 内 755-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12795799-12802086(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62503397-62503406promoter 内 695-704 bp - 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62498208-62500100(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
SmilChr06G000842 Chr06 NC_080392.1:7950554-7950563promoter 内 454-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7954101-7956918(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTT
SmilChr08G000966 Chr08 NC_080394.1:7193584-7193593promoter 内 261-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7188159-7189853(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAGGATACGG
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SmilChr01G005563 Chr01 NC_080387.1:72430183-72430192promoter 内 569-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 72433615-72435844(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
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SmilChr01G004125 Chr01 NC_080387.1:59736397-59736406promoter 内 1969-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 59738429-59750632(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr07G000152 Chr07 NC_080393.1:904779-904788promoter 内 1747-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 899627-902534(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr07G000907 Chr07 NC_080393.1:6493851-6493860promoter 内 427-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6488161-6490286(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr04G001654 Chr04 NC_080390.1:27514769-27514778promoter 内 3847-3856 bp - 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27513513-27514624(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr01G003090 Chr01 NC_080387.1:49720539-49720548promoter 内 3716-3725 bp + 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49717894-49720263(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr03G000060 Chr03 NC_080389.1:669278-669287promoter 内 3588-3597 bp - 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 669691-771622(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr01G003755 Chr01 NC_080387.1:55931179-55931188promoter 内 3517-3526 bp - 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55931663-55934320(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr05G002005 Chr05 NC_080391.1:20751354-20751363promoter 内 3468-3477 bp + 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20751887-20755958(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr07G001168 Chr07 NC_080393.1:8785536-8785545promoter 内 3461-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8786076-8786826(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
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SmilChr04G003705 Chr04 NC_080390.1:53382265-53382274promoter 内 3337-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53376171-53381610(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr04G003121 Chr04 NC_080390.1:47779117-47779126promoter 内 3038-3047 bp + 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47777115-47778163(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr05G000892 Chr05 NC_080391.1:7057191-7057200promoter 内 2974-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7058218-7062033(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr03G002465 Chr03 NC_080389.1:39105022-39105031promoter 内 2725-2734 bp - 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39103129-39103755(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr07G004323 Chr07 NC_080393.1:55777946-55777955promoter 内 2491-2500 bp - 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55771957-55776445(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr07G002949 Chr07 NC_080393.1:29887147-29887156promoter 内 2482-2491 bp - 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29884195-29885637(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr03G001505 Chr03 NC_080389.1:18404493-18404502promoter 内 2466-2475 bp + 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 18406028-18407845(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr08G002006 Chr08 NC_080394.1:17836027-17836036promoter 内 2443-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17837585-17840918(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67302317-67302326promoter 内 2416-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 67303902-67303973(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr07G000190 Chr07 NC_080393.1:1198848-1198857promoter 内 2398-2407 bp - 1594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1200451-1204401(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
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SmilChr07G001822 Chr07 NC_080393.1:15724756-15724765promoter 内 2202-2211 bp - 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15718989-15722966(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr08G000097 Chr08 NC_080394.1:589330-589339promoter 内 2109-2118 bp + 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 591222-605169(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
SmilChr06G002333 Chr06 NC_080392.1:33838109-33838118promoter 内 2102-2111 bp - 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33840008-33841063(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr05G002004 Chr05 NC_080391.1:20751354-20751363promoter 内 2094-2103 bp + 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20747689-20749456(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
SmilChr08G003145 Chr08 NC_080394.1:31859230-31859239promoter 内 2009-2018 bp - 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31861222-31862532(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC
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SmilChr01G001712 Chr01 NC_080387.1:31590413-31590422promoter 内 1751-1760 bp + 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31592663-31598105(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
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SmilChr07G000434 Chr07 NC_080393.1:3047456-3047465promoter 内 1685-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3043084-3045149(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GAGGATACGG
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SmilChr08G000459 Chr08 NC_080394.1:3288531-3288540promoter 内 1401-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3291131-3296298(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 CCGTATCCTC