转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 90 / 167 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003956 Chr07 NC_080393.1:50144798-50144809promoter 内 132-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50148667-50156310(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCTAGCGTGTTC
SmilChr07G000047 Chr07 NC_080393.1:203238-203249promoter 内 128-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 197956-199376(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCTTGCGTGTTT
SmilChr03G002668 Chr03 NC_080389.1:42365892-42365903promoter 内 2636-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 42367257-42368166(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGC
SmilChr02G004146 Chr02 NC_080388.1:63777225-63777236promoter 内 2018-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 63779208-63782520(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGTG
SmilChr03G002681 Chr03 NC_080389.1:42590970-42590981promoter 内 1739-1750 bp - 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 42593232-42596144(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGC
SmilChr02G004145 Chr02 NC_080388.1:63777225-63777236promoter 内 1003-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 63770923-63774238(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATG
SmilChr03G002682 Chr03 NC_080389.1:42598942-42598953promoter 内 3508-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 42599435-42600295(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGC
SmilChr03G002669 Chr03 NC_080389.1:42373292-42373303promoter 内 3500-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 42373793-42374845(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGC
SmilChr03G002186 Chr03 NC_080389.1:34122106-34122117promoter 内 3287-3298 bp + 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 34120726-34121403(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGTG
SmilChr04G000080 Chr04 NC_080390.1:720955-720966promoter 内 2935-2946 bp + 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 722021-725426(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCCCACGCCATC
SmilChr03G002680 Chr03 NC_080389.1:42590970-42590981promoter 内 2793-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 42592178-42593079(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGC
SmilChr02G002329 Chr02 NC_080388.1:40986498-40986509promoter 内 2632-2643 bp + 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 40983990-40985140(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA
SmilChr08G002735 Chr08 NC_080394.1:26976808-26976819promoter 内 2592-2603 bp - 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 26975338-26975410(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCAAGA
SmilChr04G002393 Chr04 NC_080390.1:38446301-38446312promoter 内 2527-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 38442411-38444838(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGCCACGCCATA
SmilChr03G002092 Chr03 NC_080389.1:32250836-32250847promoter 内 2452-2463 bp + 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 32245226-32249298(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGTG
SmilChr03G003748 Chr03 NC_080389.1:56539069-56539080promoter 内 2386-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56540684-56545784(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGTC
SmilChr05G001220 Chr05 NC_080391.1:10233921-10233932promoter 内 1846-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 10236076-10238053(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA
SmilChr02G003700 Chr02 NC_080388.1:58462036-58462047promoter 内 1437-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 58464600-58468207(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGCAT
SmilChr04G000078 Chr04 NC_080390.1:720955-720966promoter 内 1009-1020 bp + 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 715016-717974(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA
SmilChr03G002232 Chr03 NC_080389.1:35222329-35222340promoter 内 720-731 bp + 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 35216607-35219059(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGCC
SmilChr02G000142 Chr02 NC_080388.1:1896605-1896616promoter 内 652-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 1890573-1893267(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGCC
SmilChr07G004133 Chr07 NC_080393.1:53056289-53056300promoter 内 260-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 53050340-53052559(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGGA
SmilChr02G002773 Chr02 NC_080388.1:47801589-47801600promoter 内 137-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 47805453-47823024(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA
SmilChr04G001316 Chr04 NC_080390.1:21078912-21078923promoter 内 41-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 21082872-21088011(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATG
SmilChr01G000246 Chr01 NC_080387.1:4586239-4586250promoter 内 3927-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4586313-4590263(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGCCACGCCATA
SmilChr01G003102 Chr01 NC_080387.1:49835626-49835637promoter 内 3901-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49835726-49836121(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATC
SmilChr03G001035 Chr03 NC_080389.1:12054160-12054171promoter 内 3795-3806 bp - 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12050264-12053965(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCATG
SmilChr04G004174 Chr04 NC_080390.1:56361196-56361207promoter 内 3406-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56358324-56360612(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGGGG
SmilChr06G001676 Chr06 NC_080392.1:19038066-19038077promoter 内 3311-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19038756-19052342(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCATC
SmilChr04G003400 Chr04 NC_080390.1:50551343-50551354promoter 内 3262-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50549416-50550615(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA
SmilChr01G002007 Chr01 NC_080387.1:35629512-35629523promoter 内 3138-3149 bp - 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35626537-35628660(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCCCACGCCATC
SmilChr01G002010 Chr01 NC_080387.1:35661173-35661184promoter 内 3138-3149 bp - 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35658198-35660321(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCCCACGCCATC
SmilChr01G002063 Chr01 NC_080387.1:36460439-36460450promoter 内 3115-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36461325-36463456(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCCCACGCCATC
SmilChr04G004096 Chr04 NC_080390.1:55952064-55952075promoter 内 2809-2820 bp - 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55949475-55950883(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCATC
SmilChr01G003730 Chr01 NC_080387.1:55604539-55604550promoter 内 2667-2678 bp - 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55602590-55603216(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCATC
SmilChr06G002001 Chr06 NC_080392.1:25544688-25544699promoter 内 2611-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 25546078-25548694(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGTC
SmilChr07G000038 Chr07 NC_080393.1:171145-171156promoter 内 2611-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 166816-169766(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATC
SmilChr04G002084 Chr04 NC_080390.1:33602047-33602058promoter 内 2588-2599 bp - 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33598622-33600645(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATC
SmilChr05G001204 Chr05 NC_080391.1:10127237-10127248promoter 内 2569-2580 bp - 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10128669-10130629(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGTC
SmilChr01G003103 Chr01 NC_080387.1:49835626-49835637promoter 内 2521-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49837106-49840176(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCATC
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SmilChr07G003728 Chr07 NC_080393.1:45290123-45290134promoter 内 2475-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45284082-45288608(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTTGCGTGTTA
SmilChr01G000105 Chr01 NC_080387.1:1841082-1841093promoter 内 2453-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1837296-1839545(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGTC
SmilChr01G004319 Chr01 NC_080387.1:61365824-61365835promoter 内 2399-2410 bp - 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 61367426-61371693(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGTG
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SmilChr08G001813 Chr08 NC_080394.1:15293943-15293954promoter 内 2191-2202 bp + 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15291077-15292144(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGTG
SmilChr07G001861 Chr07 NC_080393.1:16130601-16130612promoter 内 2093-2104 bp + 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 16132509-16133353(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGCCACGCCATG
SmilChr08G002684 Chr08 NC_080394.1:26443920-26443931promoter 内 2086-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 26445835-26447987(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGCA
SmilChr04G001565 Chr04 NC_080390.1:25947661-25947672promoter 内 2070-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 25949592-25950628(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGGGA
SmilChr02G002651 Chr02 NC_080388.1:45945446-45945457promoter 内 2034-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45937413-45943490(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGGGA