转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 90 / 139 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001361 Chr01 NC_080387.1:26966352-26966363promoter 内 3325-3336 bp + 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 26960517-26965687(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCCGC
SmilChr04G001169 Chr04 NC_080390.1:17483216-17483227promoter 内 2791-2802 bp + 1199 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 17484426-17485847(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGCC
SmilChr01G002447 Chr01 NC_080387.1:42064572-42064583promoter 内 2766-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 42058999-42063348(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATTTCACGTGGC
SmilChr03G003971 Chr03 NC_080389.1:58748708-58748719promoter 内 2636-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 58743127-58747354(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGACGTCAGGT
SmilChr03G003147 Chr03 NC_080389.1:48776131-48776142promoter 内 2383-2394 bp - 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 48777749-48779189(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAAAT
SmilChr03G001619 Chr03 NC_080389.1:20658574-20658585promoter 内 2291-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 20655934-20656875(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAATT
SmilChr01G005106 Chr01 NC_080387.1:68850903-68850914promoter 内 2047-2058 bp - 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 68852857-68853840(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAAAT
SmilChr03G002690 Chr03 NC_080389.1:42790926-42790937promoter 内 1798-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 42786737-42788734(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGAT
SmilChr02G000425 Chr02 NC_080388.1:5428740-5428751promoter 内 1630-1641 bp - 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 5424566-5426380(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTCGA
SmilChr01G003897 Chr01 NC_080387.1:57254350-57254361promoter 内 1366-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 57247544-57251726(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTCGA
SmilChr04G003454 Chr04 NC_080390.1:51028173-51028184promoter 内 866-877 bp - 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 51021581-51025049(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGAC
SmilChr02G005135 Chr02 NC_080388.1:72788227-72788238promoter 内 643-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 72791585-72794428(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGAGGC
SmilChr02G000451 Chr02 NC_080388.1:5938269-5938280promoter 内 623-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 5941647-5944590(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGCC
SmilChr01G000502 Chr01 NC_080387.1:10193777-10193788promoter 内 43-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10187311-10189830(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGCC
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16205005-16205016promoter 内 3959-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16205047-16214520(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTACT
SmilChr03G004145 Chr03 NC_080389.1:60283860-60283871promoter 内 3956-3967 bp - 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 60283905-60288534(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTCT
SmilChr02G003890 Chr02 NC_080388.1:60996478-60996489promoter 内 3954-3965 bp + 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 60996525-60999185(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGAACACGTGGC
SmilChr02G000407 Chr02 NC_080388.1:5040450-5040461promoter 内 3904-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5034119-5040364(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTCT
SmilChr04G003554 Chr04 NC_080390.1:51933171-51933182promoter 内 3772-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51933400-51936993(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGGGACGTGGC
SmilChr01G000348 Chr01 NC_080387.1:7152900-7152911promoter 内 3659-3670 bp + 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7151706-7152569(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGTT
SmilChr02G002510 Chr02 NC_080388.1:43566061-43566072promoter 内 3644-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43565565-43565715(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTTGG
SmilChr02G002507 Chr02 NC_080388.1:43545280-43545291promoter 内 3628-3639 bp - 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43544768-43544918(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTTGG
SmilChr02G000004 Chr02 NC_080388.1:32111-32122promoter 内 3492-3503 bp + 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 27080-31613(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGTT
SmilChr01G002477 Chr01 NC_080387.1:42515419-42515430promoter 内 3395-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 42516025-42518500(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGAG
SmilChr02G003731 Chr02 NC_080388.1:58948814-58948825promoter 内 3331-3342 bp - 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58942849-58948155(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTCACGTGGC
SmilChr03G002734 Chr03 NC_080389.1:43440903-43440914promoter 内 3227-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43441677-43449727(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGAT
SmilChr04G001742 Chr04 NC_080390.1:28699237-28699248promoter 内 3174-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 28694936-28698421(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATCACGTGGC
SmilChr02G003545 Chr02 NC_080388.1:56610178-56610189promoter 内 3157-3168 bp - 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56607424-56609345(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTCACGTGGC
SmilChr03G000801 Chr03 NC_080389.1:9177007-9177018promoter 内 3153-3164 bp + 837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9176064-9176170(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAAAT
SmilChr03G002486 Chr03 NC_080389.1:39525495-39525506promoter 内 3075-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 39521694-39524580(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAAAT
SmilChr03G003320 Chr03 NC_080389.1:51433194-51433205promoter 内 3015-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51430424-51432219(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGTT
SmilChr02G003533 Chr02 NC_080388.1:56479082-56479093promoter 内 2956-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56480127-56483263(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATTT
SmilChr02G002070 Chr02 NC_080388.1:37281967-37281978promoter 内 2945-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37283023-37290216(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTCACGTGGC
SmilChr04G000621 Chr04 NC_080390.1:7039298-7039309promoter 内 2741-2752 bp - 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7037654-7038049(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTCGA
SmilChr02G005134 Chr02 NC_080388.1:72788227-72788238promoter 内 2710-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 72781753-72786947(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTCGTCAGCA
SmilChr01G005866 Chr01 NC_080387.1:74605729-74605740promoter 内 2701-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74607029-74608410(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGAG
SmilChr04G001786 Chr04 NC_080390.1:29291682-29291693promoter 内 2697-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 29288826-29290389(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTACGTCAGCT
SmilChr02G003590 Chr02 NC_080388.1:57112457-57112468promoter 内 2666-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57113792-57116892(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATTT
SmilChr01G005024 Chr01 NC_080387.1:68213520-68213531promoter 内 2600-2611 bp - 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68208685-68212130(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTAGC
SmilChr02G001355 Chr02 NC_080388.1:25316450-25316461promoter 内 2596-2607 bp + 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 25306259-25315056(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATAT
SmilChr02G002965 Chr02 NC_080388.1:50166542-50166553promoter 内 2451-2462 bp - 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50168092-50171839(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTCT
SmilChr04G002275 Chr04 NC_080390.1:36956289-36956300promoter 内 2253-2264 bp + 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36958037-36971581(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTCGA
SmilChr01G005867 Chr01 NC_080387.1:74612009-74612020promoter 内 2242-2253 bp - 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74613768-74614675(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGAG
SmilChr01G005487 Chr01 NC_080387.1:71815353-71815364promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71817116-71820099(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTCGA
SmilChr04G001790 Chr04 NC_080390.1:29334386-29334397promoter 内 2147-2158 bp - 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 29336240-29338808(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTACGTCAGCT
SmilChr02G002596 Chr02 NC_080388.1:45107522-45107533promoter 内 2070-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 45109453-45112694(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGACGTCAGAG
SmilChr02G001657 Chr02 NC_080388.1:30761840-30761851promoter 内 2022-2033 bp - 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30763819-30765136(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCAACGTCAGCA
SmilChr02G001403 Chr02 NC_080388.1:26615667-26615678promoter 内 1988-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26617680-26620835(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTCGA
SmilChr02G003496 Chr02 NC_080388.1:56201388-56201399promoter 内 1938-1949 bp - 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56185346-56199336(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTCGG
SmilChr01G000798 Chr01 NC_080387.1:17241792-17241803promoter 内 1904-1915 bp - 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 17237048-17239706(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTCACGTGGC